ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Pythium ultimum mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_014280	TTTG	3	380	390	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	29983050
2	NC_014280	ATC	4	449	459	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	29983050
3	NC_014280	ATA	4	598	610	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	29983050
4	NC_014280	A	13	1335	1347	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	29983050
5	NC_014280	AAAT	3	1530	1540	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	29983050
6	NC_014280	TAAA	3	1715	1725	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	29983050
7	NC_014280	ATTT	3	1757	1767	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	29983050
8	NC_014280	TTAA	3	1807	1817	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	29983050
9	NC_014280	ATA	4	2105	2116	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	29983050
10	NC_014280	TAAA	3	2168	2178	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	29983050
11	NC_014280	CGAA	3	2406	2416	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	29983050
12	NC_014280	ATTT	3	2420	2431	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	29983050
13	NC_014280	A	12	2472	2483	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	29983050
14	NC_014280	TAA	5	2664	2677	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	29983050
15	NC_014280	AAAAT	3	2678	2692	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	29983050
16	NC_014280	ATTTTA	3	2720	2737	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	29983050
17	NC_014280	AGA	4	2801	2812	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	29983050
18	NC_014280	AAT	4	3759	3769	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	29983050
19	NC_014280	ATT	4	3788	3802	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	29983050
20	NC_014280	ATTTT	3	3814	3827	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	29983050
21	NC_014280	AATA	3	4000	4011	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	29983050
22	NC_014280	TAAA	3	4021	4031	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	29983050
23	NC_014280	AT	6	4069	4081	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	29983050
24	NC_014280	TAT	5	4079	4092	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	29983050
25	NC_014280	AAAT	3	4360	4371	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	29983050
26	NC_014280	TA	11	4372	4392	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	29983050
27	NC_014280	AATTT	3	4468	4481	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	29983050
28	NC_014280	T	18	4680	4697	18	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	29983050
29	NC_014280	A	12	4750	4761	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	29983050
30	NC_014280	A	15	4921	4935	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	29983050
31	NC_014280	AAT	4	5094	5106	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	29983050
32	NC_014280	AGA	4	5210	5221	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	29983050
33	NC_014280	ATATT	4	5284	5303	20	40 %	60 %	0 %	0 %	5 %	29983050
34	NC_014280	ATT	6	5301	5317	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	29983050
35	NC_014280	AAAAT	3	5686	5701	16	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	29983050
36	NC_014280	AAT	4	6245	6256	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	29983050
37	NC_014280	TAAAT	3	7114	7127	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	29983050
38	NC_014280	ATA	4	7283	7295	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	29983050
39	NC_014280	TAAA	3	7363	7373	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	29983050
40	NC_014280	ATA	4	7401	7413	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	29983050
41	NC_014280	CAT	4	7601	7612	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	29983050
42	NC_014280	TTAA	3	7653	7664	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	29983050
43	NC_014280	ATT	4	10363	10373	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	29983050
44	NC_014280	TAT	4	10443	10454	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	29983050
45	NC_014280	ATT	4	10649	10660	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	29983050
46	NC_014280	ATTTTT	3	10715	10732	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	0 %	29983050
47	NC_014280	TTAA	3	11387	11397	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	29983050
48	NC_014280	TAT	4	11572	11583	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	29983050
49	NC_014280	ATTTAA	3	11748	11766	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	29983050
50	NC_014280	TAT	4	11772	11783	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	29983050
51	NC_014280	T	14	11789	11802	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	29983050
52	NC_014280	ATA	4	12008	12019	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	29983050
53	NC_014280	ATT	4	12046	12056	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	29983050
54	NC_014280	TTTATT	3	12122	12139	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	29983050
55	NC_014280	AT	6	12348	12359	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	29983050
56	NC_014280	T	12	12528	12539	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	29983050
57	NC_014280	TTTA	3	12549	12559	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	29983050
58	NC_014280	AT	6	13127	13137	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	29983050
59	NC_014280	AAT	4	13218	13228	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	29983050
60	NC_014280	TAAA	3	13335	13345	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	29983050
61	NC_014280	TAA	4	13452	13464	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	29983050
62	NC_014280	T	13	13542	13554	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	29983050
63	NC_014280	T	13	13566	13578	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	29983050
64	NC_014280	T	25	13769	13793	25	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	29983050
65	NC_014280	T	12	13959	13970	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	29983050
66	NC_014280	TTA	4	14108	14118	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	29983050
67	NC_014280	TA	6	14228	14238	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	29983050
68	NC_014280	AAAT	3	14934	14946	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	29983050
69	NC_014280	TTTAT	3	15301	15314	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	29983050
70	NC_014280	TAT	5	15405	15419	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	29983050
71	NC_014280	T	14	15714	15727	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	29983050
72	NC_014280	ATTTTT	3	15864	15882	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	10 %	29983050
73	NC_014280	TTAA	3	15899	15910	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	29983050
74	NC_014280	T	18	15975	15992	18	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	29983050
75	NC_014280	CAC	4	16064	16075	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	29983050
76	NC_014280	ATA	4	16211	16222	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	29983050
77	NC_014280	TTAA	4	16960	16976	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	29983050
78	NC_014280	A	23	17189	17211	23	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	29983050
79	NC_014280	TAAAAA	3	17235	17252	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	29983050
80	NC_014280	A	14	17511	17524	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	29983050
81	NC_014280	TAAA	3	17912	17923	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	29983050
82	NC_014280	TAA	4	17951	17962	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	29983050
83	NC_014280	AT	11	17996	18017	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	29983050
84	NC_014280	A	14	18033	18046	14	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	29983050
85	NC_014280	AATT	3	18125	18135	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	29983050
86	NC_014280	AAAATA	3	18221	18239	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	10 %	29983050
87	NC_014280	ATT	4	18325	18336	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	29983050
88	NC_014280	AAATT	3	18374	18387	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	29983050
89	NC_014280	ATT	4	18697	18707	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	29983050
90	NC_014280	A	12	19154	19165	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	29983050
91	NC_014280	AAATT	3	19239	19253	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	29983050
92	NC_014280	AAAT	3	19548	19559	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	29983050
93	NC_014280	AT	6	19687	19698	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	29983050
94	NC_014280	AAATA	3	19730	19745	16	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	29983050
95	NC_014280	TAAA	3	21477	21488	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	29983050
96	NC_014280	TTTTA	4	21789	21807	19	20 %	80 %	0 %	0 %	10 %	29983050
97	NC_014280	TA	6	21849	21859	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	29983050
98	NC_014280	ATTT	3	22043	22053	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	29983050
99	NC_014280	TA	7	22153	22166	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	29983050
100	NC_014280	TAT	4	22470	22481	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	29983050
101	NC_014280	AATA	3	22723	22734	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	29983050
102	NC_014280	T	15	23871	23885	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	29983050
103	NC_014280	TAT	4	23983	23994	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	29983050
104	NC_014280	TAAA	4	24594	24609	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	29983050
105	NC_014280	TA	6	25123	25133	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	29983050
106	NC_014280	ATA	4	25230	25241	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	29983050
107	NC_014280	ATA	4	25590	25600	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	29983050
108	NC_014280	AT	12	25741	25762	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	29983050
109	NC_014280	TAA	4	26239	26249	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	29983050
110	NC_014280	A	13	26578	26590	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	29983050
111	NC_014280	TAA	4	26760	26770	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	29983050
112	NC_014280	TAAAA	4	26789	26807	19	80 %	20 %	0 %	0 %	5 %	29983050
113	NC_014280	TAAT	3	26840	26851	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	29983050
114	NC_014280	ATA	4	26871	26882	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	29983050
115	NC_014280	A	12	26891	26902	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	29983050
116	NC_014280	TTAAA	3	26938	26951	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	29983050
117	NC_014280	TTTAAA	3	27075	27092	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	29983050
118	NC_014280	T	14	27159	27172	14	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	29983050
119	NC_014280	T	13	27175	27187	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	29983050
120	NC_014280	TTAAA	3	27274	27287	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	29983050
121	NC_014280	ATTTT	3	28086	28100	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	29983050
122	NC_014280	TTTTAT	3	28281	28299	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	29983050
123	NC_014280	ATTT	3	28332	28347	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	29983050
124	NC_014280	TAA	4	28604	28614	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	29983050
125	NC_014280	TAAA	3	28691	28701	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	29983050
126	NC_014280	TATT	3	28853	28864	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	29983050
127	NC_014280	A	14	29150	29163	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	29983050
128	NC_014280	ATA	4	29392	29403	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	29983050
129	NC_014280	ATA	4	29920	29931	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	29983050
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131	NC_014280	AATT	3	31640	31652	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	29983050
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ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Pythium ultimum mitochondrion