ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Spathius agrili mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_014278	TTAA	3	312	323	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_014278	TAA	4	328	339	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_014278	TTAA	3	478	489	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_014278	TAA	4	494	505	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_014278	TTAA	3	596	607	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_014278	TAA	4	612	623	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_014278	TA	9	782	798	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	29982895
8	NC_014278	ATTT	3	1005	1016	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	29982895
9	NC_014278	TAA	4	1034	1045	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	29982895
10	NC_014278	ATA	4	1077	1088	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	29982895
11	NC_014278	TGA	4	1121	1131	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	29982895
12	NC_014278	AATTG	3	1140	1153	14	40 %	40 %	20 %	0 %	7 %	29982895
13	NC_014278	TTTA	3	1359	1370	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	29982895
14	NC_014278	TTAAT	3	1380	1393	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	29982895
15	NC_014278	TAA	4	1472	1482	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	29982895
16	NC_014278	ATT	4	1483	1494	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	29982895
17	NC_014278	TTGTTA	3	1588	1604	17	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	5 %	29982895
18	NC_014278	TAT	4	1632	1642	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	29982895
19	NC_014278	ATTTT	3	1723	1742	20	20 %	80 %	0 %	0 %	5 %	29982895
20	NC_014278	ATTTTT	3	1772	1790	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	10 %	29982895
21	NC_014278	TA	7	1804	1818	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
22	NC_014278	TAAT	3	2249	2260	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	29982895
23	NC_014278	ATT	7	2332	2353	22	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	29982895
24	NC_014278	TAT	5	2590	2604	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	29982895
25	NC_014278	TTATT	3	3406	3419	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	29982895
26	NC_014278	AAT	4	3678	3689	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	29982895
27	NC_014278	AAAT	3	4488	4498	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_014278	AGTT	3	4639	4650	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	29982895
29	NC_014278	AAAT	3	4657	4668	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	29982895
30	NC_014278	ATTT	3	4798	4809	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	29982895
31	NC_014278	TAT	4	5256	5267	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	29982895
32	NC_014278	TAAT	4	5341	5356	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	29982895
33	NC_014278	TTTA	3	5420	5431	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	29982895
34	NC_014278	TTTTA	3	5601	5614	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	29982895
35	NC_014278	TTG	4	6081	6092	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	29982895
36	NC_014278	AATTTT	3	6384	6401	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	29982895
37	NC_014278	GTA	4	6406	6417	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	29982895
38	NC_014278	TTAA	3	6719	6729	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
39	NC_014278	TAA	5	6969	6982	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	29982895
40	NC_014278	ATT	4	7545	7556	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	29982895
41	NC_014278	TAAA	3	7647	7658	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	29982895
42	NC_014278	TA	6	7668	7678	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	29982895
43	NC_014278	ATA	4	8104	8116	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	29982895
44	NC_014278	ATTAAA	3	8182	8199	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	29982895
45	NC_014278	AAT	5	8367	8382	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	29982895
46	NC_014278	ATAA	3	8608	8619	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	29982895
47	NC_014278	AAT	4	9018	9029	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	29982895
48	NC_014278	TTA	4	9034	9046	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	29982895
49	NC_014278	A	15	9699	9713	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	29982895
50	NC_014278	TA	6	9777	9788	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	29982895
51	NC_014278	AATT	3	9888	9899	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	29982895
52	NC_014278	TAAAA	3	9923	9937	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	29982895
53	NC_014278	TAT	4	9939	9949	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	29982895
54	NC_014278	TAA	4	10165	10175	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	29982896
55	NC_014278	ATT	4	10728	10738	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	29982896
56	NC_014278	TAATAT	3	10787	10804	18	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	29982896
57	NC_014278	AT	6	12361	12371	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	29982896
58	NC_014278	AAT	4	13185	13195	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	29982896
59	NC_014278	AATT	3	13363	13375	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
60	NC_014278	TAAT	3	13590	13601	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014278	TTAA	3	13687	13698	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014278	TAAA	3	13709	13720	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
63	NC_014278	TTTA	3	13744	13756	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
64	NC_014278	TAAA	3	13769	13779	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
65	NC_014278	ATT	4	14035	14046	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
66	NC_014278	ATTTAA	4	14076	14099	24	50 %	50 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding
67	NC_014278	AATTT	3	14179	14192	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
68	NC_014278	AAT	4	14321	14333	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
69	NC_014278	AAAT	3	14453	14463	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
70	NC_014278	TTTA	4	14558	14572	15	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
71	NC_014278	AATT	5	14576	14595	20	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
72	NC_014278	AATT	3	14617	14628	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
73	NC_014278	ATT	4	14792	14802	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
74	NC_014278	TTCT	3	14858	14869	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
75	NC_014278	TAAAT	3	14870	14885	16	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
76	NC_014278	TTA	4	14985	14997	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
77	NC_014278	ATTT	3	15210	15222	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Spathius agrili mitochondrion