ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Opisthopatus cinctipes mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_014273	AT	6	296	306	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	29982778
2	NC_014273	ATT	4	480	491	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	29982778
3	NC_014273	TATTT	3	646	659	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	29982778
4	NC_014273	ATT	4	720	730	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	29982778
5	NC_014273	TAT	4	904	914	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	29982778
6	NC_014273	TTTAAA	3	970	987	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	29982778
7	NC_014273	TAA	4	1016	1027	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	29982778
8	NC_014273	ATTT	4	2160	2175	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	29982779
9	NC_014273	AATG	3	2647	2658	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	29982779
10	NC_014273	AT	6	2792	2802	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	29982779
11	NC_014273	CTCTT	3	2905	2918	14	0 %	60 %	0 %	40 %	7 %	29982779
12	NC_014273	CTG	4	3139	3150	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	29982779
13	NC_014273	AT	6	3222	3232	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	29982779
14	NC_014273	AATTT	3	3632	3646	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	29982779
15	NC_014273	ATT	4	3671	3683	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	29982779
16	NC_014273	ATAA	3	3751	3762	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	29982779
17	NC_014273	TA	6	3830	3840	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	29982779
18	NC_014273	TTAATT	3	4143	4160	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	29982779
19	NC_014273	TATT	3	5340	5352	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	29982779
20	NC_014273	TATT	4	5362	5377	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	29982779
21	NC_014273	ATA	4	5711	5723	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	29982779
22	NC_014273	ATTTC	3	5753	5766	14	20 %	60 %	0 %	20 %	7 %	29982779
23	NC_014273	TAA	4	6235	6248	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	29982779
24	NC_014273	AAT	4	6364	6375	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	29982779
25	NC_014273	CAT	4	6585	6596	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	29982779
26	NC_014273	TAA	4	6823	6833	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	29982779
27	NC_014273	AAT	4	7075	7087	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	29982779
28	NC_014273	AAT	5	7282	7296	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	29982779
29	NC_014273	AAAATA	3	7334	7352	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	10 %	29982779
30	NC_014273	TTCA	3	7382	7392	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
31	NC_014273	TAT	4	7423	7433	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	29982779
32	NC_014273	AT	6	7568	7579	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	29982779
33	NC_014273	AATT	3	7943	7953	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	29982779
34	NC_014273	TA	6	8167	8177	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	29982779
35	NC_014273	ATA	4	8630	8640	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	29982779
36	NC_014273	AATA	3	8661	8673	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	29982779
37	NC_014273	TA	6	9045	9056	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_014273	ATTT	3	9157	9168	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	29982779
39	NC_014273	TTA	4	9313	9324	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	29982779
40	NC_014273	TTA	4	10227	10238	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	29982780
41	NC_014273	ATT	4	10580	10590	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	29982780
42	NC_014273	TCAAA	3	10942	10955	14	60 %	20 %	0 %	20 %	7 %	29982780
43	NC_014273	CTA	4	11093	11104	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	29982780
44	NC_014273	ATT	4	11836	11846	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
45	NC_014273	TTTA	3	12410	12421	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014273	ATT	5	12422	12435	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
47	NC_014273	AAT	4	12537	12547	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_014273	AAT	4	12864	12875	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
49	NC_014273	AT	7	13362	13375	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Opisthopatus cinctipes mitochondrion