ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Cotesia vestalis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_014272	ATA	4	166	176	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_014272	ATA	6	187	204	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
3	NC_014272	ATA	4	240	250	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_014272	TTAA	3	283	293	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_014272	ATTA	3	319	331	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
6	NC_014272	AAAAT	3	703	717	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
7	NC_014272	TAT	4	929	939	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	29982777
8	NC_014272	ATTT	3	1004	1015	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	29982777
9	NC_014272	AAT	4	1330	1341	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	29982777
10	NC_014272	TTAT	3	1384	1395	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	29982777
11	NC_014272	ATTTT	3	1406	1419	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	29982777
12	NC_014272	TAA	4	1420	1430	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	29982777
13	NC_014272	TAT	4	1628	1638	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	29982777
14	NC_014272	ATTT	4	1733	1748	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	29982777
15	NC_014272	ATTT	3	1773	1783	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	29982777
16	NC_014272	AATT	3	2236	2247	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	29982777
17	NC_014272	TAT	4	2324	2335	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	29982777
18	NC_014272	TAT	5	2576	2590	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	29982777
19	NC_014272	TTTA	4	3028	3043	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	29982777
20	NC_014272	ATTT	4	3174	3189	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	29982777
21	NC_014272	AATTA	3	3534	3548	15	60 %	40 %	0 %	0 %	0 %	29982777
22	NC_014272	TAATTT	3	3717	3734	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	29982777
23	NC_014272	ATT	5	4426	4440	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
24	NC_014272	ATT	4	4811	4821	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	29982777
25	NC_014272	TTTA	4	4827	4842	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	29982777
26	NC_014272	TTTAAA	3	4890	4906	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	29982777
27	NC_014272	TA	7	5069	5082	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	29982777
28	NC_014272	ATTT	4	5256	5271	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	29982777
29	NC_014272	TAT	4	5287	5298	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	29982777
30	NC_014272	ATA	4	5519	5530	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	29982778
31	NC_014272	TTTA	3	5534	5545	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	29982778
32	NC_014272	ATT	4	5590	5600	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	29982778
33	NC_014272	AT	6	5639	5649	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	29982778
34	NC_014272	CAAT	3	5797	5807	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	29982778
35	NC_014272	TAT	4	5813	5823	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	29982778
36	NC_014272	ATT	4	6345	6355	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	29982778
37	NC_014272	TAT	4	6459	6470	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	29982778
38	NC_014272	TA	6	6551	6561	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	29982778
39	NC_014272	TTTAA	3	6631	6644	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	29982778
40	NC_014272	TAT	4	6675	6686	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	29982778
41	NC_014272	TTAT	3	6779	6789	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	29982778
42	NC_014272	TTAA	3	6796	6807	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	29982778
43	NC_014272	ATTT	3	6862	6872	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	29982778
44	NC_014272	ATTT	3	6915	6925	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	29982778
45	NC_014272	ATTT	3	7213	7224	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	29982778
46	NC_014272	ATT	4	7667	7678	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	29982778
47	NC_014272	ATT	4	7834	7844	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	29982778
48	NC_014272	TA	8	7889	7904	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	29982778
49	NC_014272	AATTTT	3	8012	8029	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	29982778
50	NC_014272	T	13	8119	8131	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	29982778
51	NC_014272	ATTT	3	8169	8179	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	29982778
52	NC_014272	ATA	4	8215	8225	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	29982778
53	NC_014272	TAAAA	3	8246	8259	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	29982778
54	NC_014272	TATT	3	8319	8329	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	29982778
55	NC_014272	TTTTA	3	8338	8351	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	29982778
56	NC_014272	ATTT	3	8484	8495	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014272	TA	6	8594	8605	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
58	NC_014272	ATT	4	8701	8711	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	29982778
59	NC_014272	AAATTT	3	9081	9098	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
60	NC_014272	TTA	4	9217	9228	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	29982778
61	NC_014272	ATTAAT	3	9264	9281	18	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	29982778
62	NC_014272	ATTTT	3	9376	9389	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	29982778
63	NC_014272	AT	6	9434	9445	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	29982778
64	NC_014272	TTTA	3	9607	9619	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	29982778
65	NC_014272	TATT	7	9883	9910	28	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	29982778
66	NC_014272	AATTTT	3	10170	10187	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	29982778
67	NC_014272	ATT	5	10198	10211	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	29982778
68	NC_014272	TAAT	3	10512	10523	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	29982778
69	NC_014272	AAAAAT	3	10555	10572	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	29982778
70	NC_014272	ATA	4	10596	10606	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	29982778
71	NC_014272	TAAA	3	10685	10695	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	29982778
72	NC_014272	ATTG	3	10696	10708	13	25 %	50 %	25 %	0 %	7 %	29982778
73	NC_014272	TAAAA	3	10733	10746	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	29982778
74	NC_014272	AAAT	3	10817	10827	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	29982778
75	NC_014272	ATTAAA	4	10926	10949	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	4 %	29982778
76	NC_014272	TTA	4	11269	11280	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	29982778
77	NC_014272	TAA	4	11282	11292	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	29982778
78	NC_014272	TAT	4	11727	11738	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	29982778
79	NC_014272	TA	8	11778	11793	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	29982778
80	NC_014272	A	12	11938	11949	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	29982778
81	NC_014272	AATTC	3	11968	11981	14	40 %	40 %	0 %	20 %	7 %	29982778
82	NC_014272	TAAAAT	3	11999	12017	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	29982778
83	NC_014272	ATAA	4	12108	12124	17	75 %	25 %	0 %	0 %	5 %	29982778
84	NC_014272	ATTA	3	12421	12432	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	29982778
85	NC_014272	ATA	4	12437	12447	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	29982778
86	NC_014272	ATT	5	12538	12552	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	29982778
87	NC_014272	TAT	4	12603	12614	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	29982778
88	NC_014272	ATAATT	3	12754	12771	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	29982778
89	NC_014272	AAT	5	12855	12869	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	29982778
90	NC_014272	AATT	3	13338	13349	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014272	TAA	4	13438	13450	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
92	NC_014272	TAATT	3	13696	13709	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
93	NC_014272	AAATTT	3	14166	14184	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
94	NC_014272	TTAA	3	14659	14670	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
95	NC_014272	ATT	4	14705	14716	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
96	NC_014272	TTAAAA	4	15033	15056	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
97	NC_014272	ATTT	3	15292	15302	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
98	NC_014272	TAAT	3	15353	15363	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Cotesia vestalis mitochondrion