ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Kryptoperidinium foliaceum chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_014267	ATAA	4	1656	1671	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	29983029
2	NC_014267	AT	7	3233	3245	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
3	NC_014267	ATT	4	4031	4043	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	29983030
4	NC_014267	T	12	6403	6414	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014267	TA	6	6426	6436	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_014267	ACA	4	6696	6706	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	29983030
7	NC_014267	TTTA	3	7422	7433	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_014267	CAA	4	7603	7614	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	29983031
9	NC_014267	AATT	3	8144	8155	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	29983031
10	NC_014267	TAT	5	10247	10261	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	29983031
11	NC_014267	GGT	4	11509	11520	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	29983031
12	NC_014267	TTTA	3	12177	12188	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_014267	ATA	4	12477	12487	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
14	NC_014267	TAA	4	14729	14739	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_014267	TAT	4	14794	14805	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_014267	ATA	5	15068	15082	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	29983031
17	NC_014267	GCA	4	15145	15156	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	29983031
18	NC_014267	AAG	4	15190	15201	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	29983031
19	NC_014267	TGT	4	15894	15905	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	29983031
20	NC_014267	CAC	4	15920	15931	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	29983031
21	NC_014267	AAT	4	17390	17401	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	29983031
22	NC_014267	TAT	4	17999	18009	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	29983031
23	NC_014267	AATT	3	18624	18635	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_014267	ATTA	4	19100	19114	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
25	NC_014267	AAATTT	3	19214	19231	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
26	NC_014267	AACAA	3	19403	19417	15	80 %	0 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
27	NC_014267	TAT	4	19478	19488	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_014267	TA	6	20356	20366	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_014267	TAA	5	20466	20479	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
30	NC_014267	TAT	4	20484	20495	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
31	NC_014267	AT	8	20759	20773	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	29983032
32	NC_014267	ATA	4	22639	22649	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	29983032
33	NC_014267	TAT	4	23020	23030	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
34	NC_014267	AATT	3	23047	23058	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014267	TTTA	3	23157	23168	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	29983032
36	NC_014267	ATT	4	23553	23564	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_014267	AGA	4	24383	24394	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	29983032
38	NC_014267	CAA	4	24537	24548	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	29983032
39	NC_014267	ATT	4	25123	25134	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_014267	TAA	4	25147	25159	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
41	NC_014267	TAT	5	26513	26528	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
42	NC_014267	TTA	4	26713	26724	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	29983033
43	NC_014267	TAAA	3	26778	26790	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	29983033
44	NC_014267	TTC	4	26877	26888	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	29983033
45	NC_014267	GCA	4	27469	27480	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	29983033
46	NC_014267	AT	7	27630	27643	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
47	NC_014267	TCAA	3	29401	29412	12	50 %	25 %	0 %	25 %	0 %	29983033
48	NC_014267	TTA	4	29734	29745	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	29983033
49	NC_014267	ATTG	3	30383	30393	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	29983033
50	NC_014267	GTA	4	30641	30651	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
51	NC_014267	ATATT	3	30805	30818	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
52	NC_014267	TAT	4	30874	30885	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
53	NC_014267	TTA	4	30986	30997	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	29983033
54	NC_014267	TAT	4	31166	31177	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	29983033
55	NC_014267	TGG	4	31929	31939	11	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	29983034
56	NC_014267	TCTT	3	35088	35099	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	29983034
57	NC_014267	TAA	4	35116	35127	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	29983034
58	NC_014267	TAAAAT	3	35397	35414	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	29983034
59	NC_014267	TTG	4	35901	35912	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	29983034
60	NC_014267	TTG	4	36327	36338	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	29983034
61	NC_014267	TTG	4	36493	36503	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	29983034
62	NC_014267	AAT	4	36631	36643	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	29983034
63	NC_014267	TCT	4	37702	37713	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	29983034
64	NC_014267	TCT	4	37891	37902	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	29983034
65	NC_014267	TA	6	38593	38603	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
66	NC_014267	AT	6	38684	38694	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
67	NC_014267	AAG	4	40591	40602	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	29983035
68	NC_014267	ATGTTA	3	45019	45037	19	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	5 %	29983035
69	NC_014267	CAAA	4	46743	46758	16	75 %	0 %	0 %	25 %	6 %	29983035
70	NC_014267	AATA	3	49386	49397	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	29983035
71	NC_014267	TAT	4	50274	50286	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	29983035
72	NC_014267	GTTT	3	50628	50639	12	0 %	75 %	25 %	0 %	0 %	29983035
73	NC_014267	TTAT	3	51248	51258	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	29983035
74	NC_014267	AAAAT	3	51437	51451	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
75	NC_014267	TAA	5	51925	51939	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
76	NC_014267	TAT	4	51944	51958	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
77	NC_014267	ATCT	3	52376	52386	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
78	NC_014267	CTG	5	54688	54702	15	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	6 %	29983035
79	NC_014267	AT	6	55006	55017	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
80	NC_014267	ATTT	3	55021	55033	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
81	NC_014267	TGA	4	56748	56759	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	29983036
82	NC_014267	ATT	5	58516	58530	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	29983036
83	NC_014267	TGAG	3	60541	60551	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	29983036
84	NC_014267	AAATTA	3	61539	61556	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	29983036
85	NC_014267	TAA	4	61951	61962	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
86	NC_014267	ATT	4	61973	61983	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
87	NC_014267	ATT	4	62209	62220	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	29983036
88	NC_014267	CTAA	3	62724	62736	13	50 %	25 %	0 %	25 %	7 %	29983036
89	NC_014267	ATA	4	63906	63916	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
90	NC_014267	AAT	4	64175	64186	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	29983036
91	NC_014267	GTTATC	3	64324	64342	19	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
92	NC_014267	AATT	3	64545	64555	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
93	NC_014267	TTAA	3	64556	64566	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
94	NC_014267	AGA	4	64704	64714	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
95	NC_014267	AATG	3	65025	65035	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
96	NC_014267	TAATTT	3	66976	66994	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	29983037
97	NC_014267	TTTA	3	68182	68193	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	29983037
98	NC_014267	CAA	4	68588	68599	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
99	NC_014267	CATT	3	70011	70022	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
100	NC_014267	TAA	4	70099	70110	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
101	NC_014267	GAAA	3	73445	73455	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
102	NC_014267	AGGT	3	75847	75858	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
103	NC_014267	GTAA	3	76996	77007	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
104	NC_014267	TA	6	78778	78788	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	29983037
105	NC_014267	TAA	4	79523	79534	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	29983037
106	NC_014267	TTC	4	80698	80709	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
107	NC_014267	TCGA	3	81514	81525	12	25 %	25 %	25 %	25 %	0 %	29983037
108	NC_014267	ATA	4	82489	82499	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
109	NC_014267	TCAAA	3	82664	82678	15	60 %	20 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
110	NC_014267	TTTCTT	3	83061	83078	18	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	5 %	29983037
111	NC_014267	TAA	4	83362	83372	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	29983037
112	NC_014267	CTT	4	83793	83804	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	29983037
113	NC_014267	AAAT	3	86372	86383	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	29983037
114	NC_014267	TGG	4	87097	87107	11	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	29983038
115	NC_014267	TCG	4	87214	87224	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	29983038
116	NC_014267	TTAT	3	88082	88092	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
117	NC_014267	CAG	4	88295	88306	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	29983038
118	NC_014267	AGA	4	88603	88614	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	29983038
119	NC_014267	AATT	3	89697	89708	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	29983038
120	NC_014267	ATTC	3	90710	90720	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	29983038
121	NC_014267	TTAAA	4	90726	90746	21	60 %	40 %	0 %	0 %	4 %	29983038
122	NC_014267	ATG	4	91233	91244	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	29983039
123	NC_014267	TAAAAA	3	92988	93006	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	10 %	29983039
124	NC_014267	AATA	3	94770	94781	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	29983039
125	NC_014267	AATT	3	95328	95339	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
126	NC_014267	CAT	4	97118	97129	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	29983040
127	NC_014267	CAAA	3	97234	97244	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	29983040
128	NC_014267	A	16	97930	97945	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	29983040
129	NC_014267	TAGT	4	98417	98432	16	25 %	50 %	25 %	0 %	6 %	29983040
130	NC_014267	CAAA	3	98514	98524	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	29983040
131	NC_014267	GAT	4	99334	99345	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	29983040
132	NC_014267	CA	6	99839	99849	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	29983040
133	NC_014267	TTAA	3	100133	100144	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	29983040
134	NC_014267	TGA	4	101536	101546	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	29983040
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161	NC_014267	AATT	3	129541	129552	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	29983043
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164	NC_014267	ATAA	3	133178	133188	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	29983043
165	NC_014267	TA	6	133285	133298	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
166	NC_014267	AACT	3	133518	133529	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
167	NC_014267	ATTTTT	3	133858	133876	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
168	NC_014267	CTTT	3	138842	138852	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
169	NC_014267	GAAG	3	140007	140018	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
170	NC_014267	TAA	4	140352	140363	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Kryptoperidinium foliaceum chloroplast