Team
Contact

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

All Imperfect Repeats of Paramecium caudatum mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_014262A13486013100 %0 %0 %0 %0 %Non-Coding
2NC_014262A15849815100 %0 %0 %0 %6 %Non-Coding
3NC_014262A1814215918100 %0 %0 %0 %5 %Non-Coding
4NC_014262ATTTT32182321520 %80 %0 %0 %0 %Non-Coding
5NC_014262TTA4129513061233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
6NC_014262ATTT3141714281225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
7NC_014262A122958296912100 %0 %0 %0 %0 %Non-Coding
8NC_014262TAATT3301230261540 %60 %0 %0 %0 %29983025
9NC_014262AAAC3334133511175 %0 %0 %25 %9 %29983025
10NC_014262A143547356014100 %0 %0 %0 %7 %29983025
11NC_014262TGTAAA3356735851950 %33.33 %16.67 %0 %10 %29983025
12NC_014262AATG3369637071250 %25 %25 %0 %8 %29983025
13NC_014262A294306433429100 %0 %0 %0 %6 %29983025
14NC_014262A124453446412100 %0 %0 %0 %8 %29983025
15NC_014262AAAT3447044811275 %25 %0 %0 %8 %29983025
16NC_014262A134629464113100 %0 %0 %0 %7 %29983025
17NC_014262A124866487712100 %0 %0 %0 %0 %29983025
18NC_014262A125060507112100 %0 %0 %0 %8 %29983025
19NC_014262A145589560214100 %0 %0 %0 %0 %29983025
20NC_014262TAAA3587958891175 %25 %0 %0 %9 %29983025
21NC_014262A155908592215100 %0 %0 %0 %0 %29983025
22NC_014262ATAA3615261631275 %25 %0 %0 %8 %29983025
23NC_014262ATA4617761881266.67 %33.33 %0 %0 %8 %29983025
24NC_014262AAAT3630463151275 %25 %0 %0 %8 %29983025
25NC_014262T1364996511130 %100 %0 %0 %0 %29983025
26NC_014262A187134715118100 %0 %0 %0 %5 %29983025
27NC_014262A127233724412100 %0 %0 %0 %0 %29983025
28NC_014262A177321733717100 %0 %0 %0 %0 %29983025
29NC_014262A127375738612100 %0 %0 %0 %8 %29983025
30NC_014262AATA3750775171175 %25 %0 %0 %9 %29983025
31NC_014262A147740775314100 %0 %0 %0 %7 %29983025
32NC_014262AACA3787178821275 %0 %0 %25 %8 %29983025
33NC_014262A137901791313100 %0 %0 %0 %0 %29983025
34NC_014262CA6809281021150 %0 %0 %50 %9 %29983025
35NC_014262A138236824813100 %0 %0 %0 %7 %29983025
36NC_014262TTTA3847084801125 %75 %0 %0 %9 %29983025
37NC_014262TAAAA3883388471580 %20 %0 %0 %6 %Non-Coding
38NC_014262A169235925016100 %0 %0 %0 %6 %29983026
39NC_014262A139598961013100 %0 %0 %0 %7 %29983026
40NC_014262AACA3961796281275 %0 %0 %25 %8 %29983026
41NC_014262ATA4971297231266.67 %33.33 %0 %0 %8 %29983026
42NC_014262CAAA3978197911175 %0 %0 %25 %9 %29983026
43NC_014262CTG41028610296110 %33.33 %33.33 %33.33 %9 %29983026
44NC_014262ATAAAA310466104831883.33 %16.67 %0 %0 %0 %29983026
45NC_014262A12112871129812100 %0 %0 %0 %0 %Non-Coding
46NC_014262AAAG311320113311275 %0 %25 %0 %0 %Non-Coding
47NC_014262A12114921150312100 %0 %0 %0 %0 %29983026
48NC_014262AAAT611734117552275 %25 %0 %0 %9 %29983026
49NC_014262A12120371204812100 %0 %0 %0 %0 %29983026
50NC_014262TAAA312127121381275 %25 %0 %0 %8 %29983026
51NC_014262ATA412349123591166.67 %33.33 %0 %0 %9 %29983026
52NC_014262A13123701238213100 %0 %0 %0 %0 %29983026
53NC_014262TAAAA312390124031480 %20 %0 %0 %7 %29983026
54NC_014262ATTTT312406124191420 %80 %0 %0 %7 %29983026
55NC_014262A14125411255414100 %0 %0 %0 %7 %29983026
56NC_014262A12125741258512100 %0 %0 %0 %0 %29983026
57NC_014262AAAC312670126811275 %0 %0 %25 %8 %29983026
58NC_014262AAAT512855128731975 %25 %0 %0 %10 %29983026
59NC_014262AAATAA312913129301883.33 %16.67 %0 %0 %0 %29983026
60NC_014262A12131161312712100 %0 %0 %0 %8 %29983026
61NC_014262A12133271333812100 %0 %0 %0 %8 %29983026
62NC_014262A14134811349414100 %0 %0 %0 %7 %29983026
63NC_014262TTTATT313771137881816.67 %83.33 %0 %0 %5 %29983026
64NC_014262AATT313982139931250 %50 %0 %0 %8 %29983026
65NC_014262CAAA314061140721275 %0 %0 %25 %8 %29983026
66NC_014262A13143111432313100 %0 %0 %0 %0 %Non-Coding
67NC_014262A15157701578415100 %0 %0 %0 %6 %Non-Coding
68NC_014262TGA415936159461133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %29983026
69NC_014262TAAA316934169441175 %25 %0 %0 %9 %29983026
70NC_014262AAAAT317560175741580 %20 %0 %0 %6 %29983026
71NC_014262TAAAAA317763177811983.33 %16.67 %0 %0 %10 %29983026
72NC_014262AAAC318270182811275 %0 %0 %25 %8 %29983026
73NC_014262TAA418641186511166.67 %33.33 %0 %0 %9 %29983026
74NC_014262A14188731888614100 %0 %0 %0 %7 %29983026
75NC_014262A12191721918312100 %0 %0 %0 %8 %29983026
76NC_014262A13193171932913100 %0 %0 %0 %0 %29983026
77NC_014262A13198021981413100 %0 %0 %0 %7 %29983026
78NC_014262TTTA320985209961225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
79NC_014262TTTA421056210711625 %75 %0 %0 %6 %Non-Coding
80NC_014262T162109021105160 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
81NC_014262A13212642127613100 %0 %0 %0 %0 %29983026
82NC_014262A16214532146816100 %0 %0 %0 %0 %29983026
83NC_014262AAGAA321494215071480 %0 %20 %0 %7 %29983026
84NC_014262A15216012161515100 %0 %0 %0 %6 %29983026
85NC_014262TAT421815218261233.33 %66.67 %0 %0 %8 %29983026
86NC_014262A13219392195113100 %0 %0 %0 %7 %29983026
87NC_014262A13220052201713100 %0 %0 %0 %0 %29983026
88NC_014262A16220682208316100 %0 %0 %0 %6 %29983026
89NC_014262TGAATT322254222711833.33 %50 %16.67 %0 %5 %29983026
90NC_014262T152250522519150 %100 %0 %0 %0 %29983026
91NC_014262TCA623224232411833.33 %33.33 %0 %33.33 %5 %29983026
92NC_014262GAATCA523236232653050 %16.67 %16.67 %16.67 %6 %29983026
93NC_014262T142327123284140 %100 %0 %0 %7 %29983026
94NC_014262TCA423401234121233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %29983026
95NC_014262T122386823879120 %100 %0 %0 %0 %29983026
96NC_014262TGTT32398123992120 %75 %25 %0 %8 %29983026
97NC_014262AATT324083240951350 %50 %0 %0 %7 %29983026
98NC_014262TTTA324096241061125 %75 %0 %0 %9 %29983026
99NC_014262T132425724269130 %100 %0 %0 %7 %29983027
100NC_014262TTCT32443724448120 %75 %0 %25 %8 %29983027
101NC_014262A13244872449913100 %0 %0 %0 %7 %29983027
102NC_014262TATT324534245451225 %75 %0 %0 %8 %29983027
103NC_014262T122507625087120 %100 %0 %0 %0 %29983027
104NC_014262T132538925401130 %100 %0 %0 %7 %29983027
105NC_014262T162543125446160 %100 %0 %0 %6 %29983027
106NC_014262TAAA325603256131175 %25 %0 %0 %9 %29983027
107NC_014262A12256272563812100 %0 %0 %0 %8 %29983027
108NC_014262A13256872569913100 %0 %0 %0 %0 %29983027
109NC_014262TTTG32586125871110 %75 %25 %0 %9 %Non-Coding
110NC_014262TAT425988259981133.33 %66.67 %0 %0 %9 %29983027
111NC_014262TTA426381263921233.33 %66.67 %0 %0 %8 %29983027
112NC_014262ACC426511265221233.33 %0 %0 %66.67 %8 %29983027
113NC_014262TTTCT32672526738140 %80 %0 %20 %7 %29983027
114NC_014262TTTA326784267941125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
115NC_014262A15267962681015100 %0 %0 %0 %0 %Non-Coding
116NC_014262TAAA326829268401275 %25 %0 %0 %8 %29983027
117NC_014262AAAAT326875268901680 %20 %0 %0 %6 %29983027
118NC_014262AAAAT326894269071480 %20 %0 %0 %7 %29983027
119NC_014262ATAAAA326913269301883.33 %16.67 %0 %0 %5 %29983027
120NC_014262T152697026984150 %100 %0 %0 %6 %29983027
121NC_014262TAAA427005270201675 %25 %0 %0 %6 %29983027
122NC_014262ATAAAA427039270622483.33 %16.67 %0 %0 %4 %29983027
123NC_014262A17270712708717100 %0 %0 %0 %0 %29983027
124NC_014262A13271382715013100 %0 %0 %0 %7 %29983027
125NC_014262A16272342724916100 %0 %0 %0 %0 %29983027
126NC_014262TAT428129281391133.33 %66.67 %0 %0 %9 %29983027
127NC_014262A15286842869815100 %0 %0 %0 %6 %29983027
128NC_014262ATCAAA328717287341866.67 %16.67 %0 %16.67 %5 %29983027
129NC_014262A12287312874212100 %0 %0 %0 %0 %29983027
130NC_014262ACA428796288061166.67 %0 %0 %33.33 %9 %29983027
131NC_014262ATAA329013290231175 %25 %0 %0 %9 %29983027
132NC_014262TTTA329486294971225 %75 %0 %0 %8 %29983027
133NC_014262TAAAAA329896299141983.33 %16.67 %0 %0 %10 %29983028
134NC_014262A12300213003212100 %0 %0 %0 %8 %29983028
135NC_014262ATTTT330164301781520 %80 %0 %0 %6 %29983028
136NC_014262ATT530218302321533.33 %66.67 %0 %0 %6 %29983028
137NC_014262TA630365303761250 %50 %0 %0 %8 %29983028
138NC_014262A18303963041318100 %0 %0 %0 %0 %29983028
139NC_014262TAAA330868308781175 %25 %0 %0 %9 %29983028
140NC_014262T193124331261190 %100 %0 %0 %5 %29983028
141NC_014262T153190231916150 %100 %0 %0 %6 %29983028
142NC_014262TCA431941319511133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %29983028
143NC_014262TCTT33197031980110 %75 %0 %25 %9 %29983028
144NC_014262T143198531998140 %100 %0 %0 %7 %29983028
145NC_014262T143200332016140 %100 %0 %0 %7 %29983028
146NC_014262CTT43231732328120 %66.67 %0 %33.33 %8 %29983028
147NC_014262A12330633307412100 %0 %0 %0 %0 %29983028
148NC_014262T133310333115130 %100 %0 %0 %0 %29983028
149NC_014262AAAT333116331261175 %25 %0 %0 %9 %29983028
150NC_014262ATTT333511335211125 %75 %0 %0 %9 %29983028
151NC_014262TCT43382833839120 %66.67 %0 %33.33 %8 %29983028
152NC_014262T123416234173120 %100 %0 %0 %8 %29983028
153NC_014262A12354263543712100 %0 %0 %0 %8 %29983028
154NC_014262T243585635879240 %100 %0 %0 %8 %29983028
155NC_014262TAAA435905359201675 %25 %0 %0 %6 %29983028
156NC_014262ATATTT335952359691833.33 %66.67 %0 %0 %5 %29983028
157NC_014262TTCT33624836259120 %75 %0 %25 %8 %29983028
158NC_014262AAC436284362951266.67 %0 %0 %33.33 %8 %29983028
159NC_014262TTC43635936370120 %66.67 %0 %33.33 %8 %29983028
160NC_014262A12364893650012100 %0 %0 %0 %0 %29983028
161NC_014262CTTTT33659436608150 %80 %0 %20 %6 %29983028
162NC_014262A13371063711813100 %0 %0 %0 %0 %29983028
163NC_014262TTTTTA337245372611716.67 %83.33 %0 %0 %5 %29983028
164NC_014262ATTT337437374471125 %75 %0 %0 %9 %29983028
165NC_014262A12376333764412100 %0 %0 %0 %8 %29983028
166NC_014262TTTAAA337848378661950 %50 %0 %0 %10 %29983028
167NC_014262A15379633797715100 %0 %0 %0 %6 %29983028
168NC_014262TAAA337997380071175 %25 %0 %0 %9 %29983028
169NC_014262TAAAA338032380451480 %20 %0 %0 %7 %29983028
170NC_014262AATA338046380561175 %25 %0 %0 %9 %29983028
171NC_014262A12381413815212100 %0 %0 %0 %0 %29983028
172NC_014262A17381843820017100 %0 %0 %0 %5 %29983028
173NC_014262A12384323844312100 %0 %0 %0 %0 %29983028
174NC_014262A18385423855918100 %0 %0 %0 %5 %29983028
175NC_014262A18386343865118100 %0 %0 %0 %5 %29983028
176NC_014262TAAA338652386631275 %25 %0 %0 %8 %29983028
177NC_014262TAAAA338725387391580 %20 %0 %0 %6 %29983028
178NC_014262A12387483875912100 %0 %0 %0 %0 %29983028
179NC_014262TAAA338876388861175 %25 %0 %0 %9 %29983028
180NC_014262ATA439339393501266.67 %33.33 %0 %0 %8 %29983028
181NC_014262CTTTT33941839431140 %80 %0 %20 %7 %29983028
182NC_014262A12394563946712100 %0 %0 %0 %8 %29983028
183NC_014262AAATAA340122401391883.33 %16.67 %0 %0 %5 %29983029
184NC_014262A15401424015615100 %0 %0 %0 %6 %29983029
185NC_014262A15404494046315100 %0 %0 %0 %0 %29983029
186NC_014262A12404964050712100 %0 %0 %0 %0 %29983029
187NC_014262AAAAG440513405311980 %0 %20 %0 %5 %29983029
188NC_014262AT640629406401250 %50 %0 %0 %8 %29983029
189NC_014262T124066740678120 %100 %0 %0 %0 %29983029
190NC_014262AAAT540708407272075 %25 %0 %0 %5 %29983029
191NC_014262AAAATA440813408362483.33 %16.67 %0 %0 %8 %29983029
192NC_014262AAAAT940813408594780 %20 %0 %0 %8 %29983029
193NC_014262AATAAA541075411043083.33 %16.67 %0 %0 %6 %29983029
194NC_014262A13412114122313100 %0 %0 %0 %0 %29983029
195NC_014262A13412724128413100 %0 %0 %0 %0 %29983029
196NC_014262A14413374135014100 %0 %0 %0 %7 %29983029
197NC_014262TCT54148741501150 %66.67 %0 %33.33 %6 %29983029
198NC_014262A16420434205816100 %0 %0 %0 %6 %29983029
199NC_014262T134247742489130 %100 %0 %0 %7 %29983029
200NC_014262A12427344274512100 %0 %0 %0 %8 %29983029
201NC_014262AGA542780427941566.67 %0 %33.33 %0 %6 %29983029
202NC_014262ATAAA342818428321580 %20 %0 %0 %6 %29983029
203NC_014262A18431254314218100 %0 %0 %0 %5 %29983029
204NC_014262AAAAG343174431871480 %0 %20 %0 %7 %29983029
205NC_014262AGT443337433481233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %29983029
206NC_014262A14433734338614100 %0 %0 %0 %7 %29983029