ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Sasakia charonda mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_014224	TTTAT	3	130	144	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
2	NC_014224	TACA	3	231	242	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
3	NC_014224	ATTT	4	262	277	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
4	NC_014224	ATT	4	537	547	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	297572360
5	NC_014224	TTTAT	4	910	928	19	20 %	80 %	0 %	0 %	10 %	297572360
6	NC_014224	TTTAAT	3	959	976	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	297572360
7	NC_014224	ATTA	4	1057	1071	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	297572360
8	NC_014224	ATT	4	1253	1265	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
9	NC_014224	T	12	1279	1290	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_014224	TAT	4	2060	2071	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	297572361
11	NC_014224	GAG	4	2145	2155	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	297572361
12	NC_014224	TTTA	4	2506	2521	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	297572361
13	NC_014224	AAT	4	2871	2882	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	297572361
14	NC_014224	TAT	5	2880	2893	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	297572361
15	NC_014224	ATT	4	2917	2927	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	297572361
16	NC_014224	TTAA	3	3204	3214	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	297572362
17	NC_014224	TTTA	3	3215	3225	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	297572362
18	NC_014224	AAT	4	3465	3476	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	297572362
19	NC_014224	TAATT	3	4086	4099	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	297572364
20	NC_014224	ATTT	3	4850	4861	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	297572365
21	NC_014224	T	15	5000	5014	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	297572365
22	NC_014224	TAT	4	5220	5231	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	297572365
23	NC_014224	T	13	5860	5872	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	297572366
24	NC_014224	AT	6	6374	6385	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	297572367
25	NC_014224	AATT	3	6395	6406	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	297572367
26	NC_014224	TAT	4	6684	6695	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	297572367
27	NC_014224	TTAA	3	6833	6844	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	297572367
28	NC_014224	AAAT	3	6923	6934	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	297572367
29	NC_014224	TTA	4	7202	7213	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	297572367
30	NC_014224	ATA	4	7307	7321	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	297572367
31	NC_014224	ATAA	3	7671	7681	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	297572367
32	NC_014224	TAA	4	7745	7757	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	297572367
33	NC_014224	TAA	4	8004	8014	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	297572367
34	NC_014224	ATCTA	3	8343	8356	14	40 %	40 %	0 %	20 %	7 %	297572368
35	NC_014224	AT	6	8503	8513	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	297572368
36	NC_014224	TAAA	3	8950	8960	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	297572368
37	NC_014224	AAAAT	3	9123	9136	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	297572368
38	NC_014224	TAA	4	9178	9188	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	297572368
39	NC_014224	TAT	4	9442	9453	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	297572368
40	NC_014224	TTA	6	9592	9610	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	297572369
41	NC_014224	ATT	4	9614	9624	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	297572369
42	NC_014224	TA	12	9756	9781	26	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	297572369
43	NC_014224	ATT	4	9884	9895	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
44	NC_014224	ATA	4	9913	9924	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
45	NC_014224	ATTTT	4	10060	10079	20	20 %	80 %	0 %	0 %	10 %	297572370
46	NC_014224	ATT	5	10096	10110	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	297572370
47	NC_014224	ATTT	4	10364	10379	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	297572370
48	NC_014224	GTA	4	10385	10396	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	297572370
49	NC_014224	TAT	5	10807	10820	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	297572371
50	NC_014224	ATTT	3	11046	11056	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	297572371
51	NC_014224	ATT	5	11450	11463	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	297572371
52	NC_014224	AAT	4	11644	11655	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
53	NC_014224	A	12	11813	11824	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	297572372
54	NC_014224	TAAA	3	12071	12082	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	297572372
55	NC_014224	TTAA	3	12112	12123	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	297572372
56	NC_014224	AAAT	3	12384	12394	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	297572372
57	NC_014224	TA	12	12627	12649	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
58	NC_014224	ATATTA	3	12695	12712	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
59	NC_014224	ATTA	4	13067	13082	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
60	NC_014224	TTTAAT	3	13378	13394	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
61	NC_014224	T	13	13403	13415	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
62	NC_014224	TAAT	4	13636	13651	16	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014224	AAATT	3	14026	14039	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
64	NC_014224	ATTT	3	14321	14331	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
65	NC_014224	TAATT	3	14658	14672	15	40 %	60 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014224	ATT	4	14771	14783	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
67	NC_014224	TAAA	3	14784	14795	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
68	NC_014224	T	19	14888	14906	19	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
69	NC_014224	ATA	4	15002	15012	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
70	NC_014224	AATA	3	15023	15034	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
71	NC_014224	ATT	4	15037	15049	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
72	NC_014224	AATT	3	15058	15070	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
73	NC_014224	TA	12	15137	15160	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Sasakia charonda mitochondrion