ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Sasakia charonda kuriyamaensis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_014223	TTTAT	3	130	144	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
2	NC_014223	TACA	3	231	242	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
3	NC_014223	ATTT	4	262	277	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
4	NC_014223	ATT	4	537	547	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	297572346
5	NC_014223	TTTAT	4	910	928	19	20 %	80 %	0 %	0 %	10 %	297572346
6	NC_014223	TTTAAT	3	959	976	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	297572346
7	NC_014223	ATTA	4	1057	1071	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	297572346
8	NC_014223	ATT	4	1226	1238	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	297572346
9	NC_014223	TAT	4	2060	2071	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	297572347
10	NC_014223	GAG	4	2145	2155	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	297572347
11	NC_014223	TTTA	4	2506	2521	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	297572347
12	NC_014223	AAT	4	2871	2882	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	297572347
13	NC_014223	TAT	5	2880	2893	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	297572347
14	NC_014223	ATT	4	2917	2927	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	297572347
15	NC_014223	TTAA	3	3204	3214	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	297572348
16	NC_014223	TTTA	3	3215	3225	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	297572348
17	NC_014223	AAT	4	3465	3476	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	297572348
18	NC_014223	TAATT	3	4086	4099	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	297572350
19	NC_014223	ATTT	3	4850	4861	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	297572351
20	NC_014223	T	15	5000	5014	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	297572351
21	NC_014223	TAT	4	5220	5231	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	297572351
22	NC_014223	T	13	5860	5872	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	297572352
23	NC_014223	AT	6	6357	6368	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	297572353
24	NC_014223	AATT	3	6378	6389	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	297572353
25	NC_014223	TAT	4	6667	6678	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	297572353
26	NC_014223	TTAA	3	6816	6827	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	297572353
27	NC_014223	AAAT	3	6906	6917	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	297572353
28	NC_014223	TTA	4	7185	7196	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	297572353
29	NC_014223	ATA	4	7290	7304	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	297572353
30	NC_014223	ATAA	3	7654	7664	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	297572353
31	NC_014223	TAA	4	7728	7740	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	297572353
32	NC_014223	TAA	4	7987	7997	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	297572353
33	NC_014223	ATCTA	3	8324	8337	14	40 %	40 %	0 %	20 %	7 %	297572354
34	NC_014223	AT	6	8484	8494	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	297572354
35	NC_014223	TAAA	3	8931	8941	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	297572354
36	NC_014223	AAAAT	3	9104	9117	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	297572354
37	NC_014223	TAA	4	9159	9169	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	297572354
38	NC_014223	TAT	4	9423	9434	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	297572354
39	NC_014223	TTA	6	9573	9591	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	297572355
40	NC_014223	ATT	4	9595	9605	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	297572355
41	NC_014223	TA	12	9737	9762	26	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	297572355
42	NC_014223	ATT	4	9865	9876	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_014223	ATA	4	9894	9905	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	297572356
44	NC_014223	ATTTT	4	10040	10059	20	20 %	80 %	0 %	0 %	10 %	297572356
45	NC_014223	ATT	5	10076	10090	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	297572356
46	NC_014223	ATTT	4	10344	10359	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	297572356
47	NC_014223	GTA	4	10365	10376	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	297572356
48	NC_014223	TAT	5	10787	10800	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	297572357
49	NC_014223	ATTT	3	11026	11036	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	297572357
50	NC_014223	ATT	5	11429	11442	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
51	NC_014223	AAT	4	11623	11634	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_014223	A	12	11792	11803	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	297572358
53	NC_014223	TAAA	3	12050	12061	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	297572358
54	NC_014223	TTAA	3	12091	12102	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	297572358
55	NC_014223	AAAT	3	12363	12373	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	297572358
56	NC_014223	TA	12	12606	12628	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
57	NC_014223	ATATTA	3	12674	12691	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
58	NC_014223	ATTA	4	13046	13061	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
59	NC_014223	TTTAAT	3	13357	13373	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
60	NC_014223	T	13	13382	13394	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
61	NC_014223	TAAT	4	13614	13629	16	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014223	AAATT	3	14004	14017	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
63	NC_014223	ATTT	3	14299	14309	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
64	NC_014223	TAATT	3	14636	14650	15	40 %	60 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014223	ATT	4	14749	14761	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
66	NC_014223	TAAA	3	14762	14773	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
67	NC_014223	T	19	14866	14884	19	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
68	NC_014223	ATA	4	14980	14990	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
69	NC_014223	AATA	3	15001	15012	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
70	NC_014223	ATT	4	15015	15027	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
71	NC_014223	AATT	3	15036	15048	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
72	NC_014223	TA	12	15115	15138	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Sasakia charonda kuriyamaensis mitochondrion