ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Lathyrus sativus chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_014063	ATT	4	4655	4666	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_014063	ATA	4	9759	9770	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014063	TAG	4	9852	9863	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_014063	CAT	4	19037	19047	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	295136910
5	NC_014063	TGC	4	19362	19373	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	295136910
6	NC_014063	ATC	4	22761	22772	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
7	NC_014063	ATC	4	23936	23946	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
8	NC_014063	ATT	4	28011	28022	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	295136916
9	NC_014063	ATA	5	28870	28883	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	295136917
10	NC_014063	GAC	4	30533	30544	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
11	NC_014063	AGA	4	32320	32331	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	295136921
12	NC_014063	CAA	4	37437	37447	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	295136927
13	NC_014063	TGG	4	38414	38425	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_014063	GAA	4	41419	41430	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	0 %	295136932
15	NC_014063	TAT	4	44994	45004	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	295136974
16	NC_014063	AAT	5	46498	46513	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	295136974
17	NC_014063	ATT	4	47755	47765	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	295136974
18	NC_014063	ATT	4	48470	48481	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	295136974
19	NC_014063	GAA	4	52897	52909	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	295136974
20	NC_014063	AAT	4	57365	57376	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	295136974
21	NC_014063	AAT	4	57448	57459	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	295136974
22	NC_014063	GTT	4	60357	60368	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	295136974
23	NC_014063	CTA	4	60876	60886	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	295136974
24	NC_014063	TGC	4	61250	61261	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	295136974
25	NC_014063	TGT	4	63514	63525	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	295136974
26	NC_014063	TTC	4	67048	67059	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	295136974
27	NC_014063	TTA	4	67584	67594	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	295136974
28	NC_014063	ATA	4	68626	68637	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	295136974
29	NC_014063	TAT	4	70537	70548	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	295136974
30	NC_014063	TAA	4	77297	77307	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	295136974
31	NC_014063	CTC	4	77723	77733	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	295136974
32	NC_014063	TAT	4	77991	78002	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	295136974
33	NC_014063	AGA	4	83177	83188	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	295136974
34	NC_014063	GAT	4	87702	87713	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	295136974
35	NC_014063	CTA	4	88066	88076	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	295136974
36	NC_014063	ATA	4	97886	97898	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	295136974
37	NC_014063	TCT	4	99194	99205	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	295136974
38	NC_014063	TAT	4	101913	101923	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	295136974
39	NC_014063	TTC	5	104372	104386	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	295136974
40	NC_014063	TCT	4	107832	107843	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	295136974
41	NC_014063	TCT	4	109614	109625	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	295136974
42	NC_014063	ATA	4	111067	111077	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	295136974
43	NC_014063	AGA	4	115043	115055	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	295136974
44	NC_014063	TAA	4	117038	117048	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	295136974
45	NC_014063	AGT	4	118135	118145	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
46	NC_014063	AAT	4	120077	120089	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	295136971

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Lathyrus sativus chloroplast