ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Lathyrus sativus chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_014063	AAGT	3	1011	1021	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	295136901
2	NC_014063	AATA	3	1744	1754	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_014063	A	13	4348	4360	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
4	NC_014063	AATC	3	4533	4544	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
5	NC_014063	ATT	4	4655	4666	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_014063	TAAA	4	6374	6388	15	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
7	NC_014063	AATA	3	6525	6535	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_014063	T	17	6844	6860	17	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014063	A	12	6862	6873	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014063	TTATA	3	9049	9062	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
11	NC_014063	AAAG	3	9650	9660	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_014063	A	13	9709	9721	13	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014063	ATA	4	9759	9770	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014063	TAG	4	9852	9863	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_014063	TTTG	3	13172	13182	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_014063	TA	6	13675	13685	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_014063	A	13	14016	14028	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
18	NC_014063	AATT	3	15222	15233	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	295136909
19	NC_014063	A	13	15668	15680	13	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014063	AT	6	17080	17090	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	295136972
21	NC_014063	AT	6	17889	17899	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_014063	ACTT	3	18974	18985	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	295136910
23	NC_014063	CAT	4	19037	19047	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	295136910
24	NC_014063	TGC	4	19362	19373	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	295136910
25	NC_014063	TCTT	3	20166	20177	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	295136910
26	NC_014063	TTTC	3	20870	20881	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	295136911
27	NC_014063	ATC	4	22761	22772	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
28	NC_014063	TA	6	23350	23361	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
29	NC_014063	ATC	4	23936	23946	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
30	NC_014063	AT	6	25099	25109	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	295136913
31	NC_014063	ATTA	4	26296	26311	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
32	NC_014063	AAAT	3	27440	27451	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	295136916
33	NC_014063	ATT	4	28011	28022	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	295136916
34	NC_014063	ATAACC	3	28118	28136	19	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	10 %	295136916
35	NC_014063	GAAA	3	28628	28640	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
36	NC_014063	ATA	5	28870	28883	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	295136917
37	NC_014063	TA	9	29079	29095	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
38	NC_014063	A	14	29324	29337	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
39	NC_014063	A	12	30206	30217	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_014063	GAC	4	30533	30544	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
41	NC_014063	AGA	4	32320	32331	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	295136921
42	NC_014063	T	15	32667	32681	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
43	NC_014063	T	24	35227	35250	24	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	295136923
44	NC_014063	A	15	35414	35428	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	295136923
45	NC_014063	TATT	3	36081	36092	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
46	NC_014063	AACC	3	37172	37183	12	50 %	0 %	0 %	50 %	0 %	295136927
47	NC_014063	CAA	4	37437	37447	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	295136927
48	NC_014063	TGG	4	38414	38425	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
49	NC_014063	T	12	39342	39353	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014063	T	17	39852	39868	17	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014063	AT	8	40024	40038	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
52	NC_014063	TAAA	3	41130	41142	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
53	NC_014063	A	25	41270	41294	25	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
54	NC_014063	GAA	4	41419	41430	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	0 %	295136932
55	NC_014063	A	12	41653	41664	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	295136932
56	NC_014063	A	16	41679	41694	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	295136932
57	NC_014063	A	15	41731	41745	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	295136932
58	NC_014063	TA	6	42921	42932	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
59	NC_014063	AT	9	43894	43911	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	295136974
60	NC_014063	T	14	43959	43972	14	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	295136974
61	NC_014063	T	13	44060	44072	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	295136974
62	NC_014063	A	13	44778	44790	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	295136974
63	NC_014063	TAT	4	44994	45004	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	295136974
64	NC_014063	AGAA	3	45170	45181	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	295136974
65	NC_014063	TA	6	45939	45949	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	295136974
66	NC_014063	ACTT	3	46020	46030	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	295136974
67	NC_014063	AAT	5	46498	46513	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	295136974
68	NC_014063	A	15	46686	46700	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	295136974
69	NC_014063	T	13	47741	47753	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	295136974
70	NC_014063	ATT	4	47755	47765	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	295136974
71	NC_014063	TTTGT	3	47964	47977	14	0 %	80 %	20 %	0 %	7 %	295136974
72	NC_014063	ATGA	3	48122	48132	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	295136974
73	NC_014063	GGAA	3	48192	48203	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	295136974
74	NC_014063	AT	6	48415	48425	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	295136974
75	NC_014063	ATT	4	48470	48481	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	295136974
76	NC_014063	TATC	3	48571	48581	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	295136974
77	NC_014063	A	17	52055	52071	17	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	295136974
78	NC_014063	ATTC	3	52084	52094	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	295136974
79	NC_014063	T	14	52101	52114	14	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	295136974
80	NC_014063	GAA	4	52897	52909	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	295136974
81	NC_014063	AT	6	55185	55196	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	295136974
82	NC_014063	AT	6	56066	56076	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	295136974
83	NC_014063	AAGA	3	56184	56195	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	295136974
84	NC_014063	A	18	56513	56530	18	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	295136974
85	NC_014063	A	13	56623	56635	13	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	295136974
86	NC_014063	A	13	56692	56704	13	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	295136974
87	NC_014063	A	28	56759	56786	28	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	295136974
88	NC_014063	AGAA	3	57245	57256	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	295136974
89	NC_014063	AAT	4	57365	57376	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	295136974
90	NC_014063	AAT	4	57448	57459	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	295136974
91	NC_014063	AATT	3	58530	58541	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	295136974
92	NC_014063	T	12	58799	58810	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	295136974
93	NC_014063	GTT	4	60357	60368	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	295136974
94	NC_014063	GGGT	3	60694	60704	11	0 %	25 %	75 %	0 %	9 %	295136974
95	NC_014063	AT	6	60715	60725	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	295136974
96	NC_014063	CTA	4	60876	60886	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	295136974
97	NC_014063	TATT	3	61198	61209	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	295136974
98	NC_014063	TGC	4	61250	61261	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	295136974
99	NC_014063	T	13	61512	61524	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	295136974
100	NC_014063	ATATAG	4	61765	61786	22	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	9 %	295136974
101	NC_014063	AATT	3	62986	62998	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	295136974
102	NC_014063	TGT	4	63514	63525	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	295136974
103	NC_014063	ATTG	3	63799	63809	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	295136974
104	NC_014063	AAAAT	3	65704	65718	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	295136974
105	NC_014063	TTATTT	3	66355	66372	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	295136974
106	NC_014063	TA	7	66608	66621	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	295136974
107	NC_014063	TTC	4	67048	67059	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	295136974
108	NC_014063	A	12	67183	67194	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	295136974
109	NC_014063	T	15	67536	67550	15	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	295136974
110	NC_014063	ATTT	3	67559	67570	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	295136974
111	NC_014063	TTA	4	67584	67594	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	295136974
112	NC_014063	TA	6	67603	67613	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	295136974
113	NC_014063	TA	6	67626	67636	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	295136974
114	NC_014063	T	12	67649	67660	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	295136974
115	NC_014063	AAAG	3	67686	67696	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	295136974
116	NC_014063	ATA	4	68626	68637	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	295136974
117	NC_014063	CAGA	3	68659	68669	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	295136974
118	NC_014063	TCAGA	3	69034	69047	14	40 %	20 %	20 %	20 %	7 %	295136974
119	NC_014063	CAGAT	3	69113	69126	14	40 %	20 %	20 %	20 %	7 %	295136974
120	NC_014063	CAGAT	3	69182	69195	14	40 %	20 %	20 %	20 %	7 %	295136974
121	NC_014063	CAGAT	3	69251	69264	14	40 %	20 %	20 %	20 %	7 %	295136974
122	NC_014063	TTGA	3	69554	69566	13	25 %	50 %	25 %	0 %	7 %	295136974
123	NC_014063	TAT	4	70537	70548	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	295136974
124	NC_014063	ATTT	3	70653	70664	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	295136974
125	NC_014063	ACGA	3	71839	71849	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	295136974
126	NC_014063	TGAA	3	72237	72248	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	295136974
127	NC_014063	T	14	73603	73616	14	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	295136974
128	NC_014063	TGAA	3	73848	73859	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	295136974
129	NC_014063	A	15	73903	73917	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	295136974
130	NC_014063	TTTA	3	74125	74135	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	295136974
131	NC_014063	AAAT	3	75531	75541	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	295136974
132	NC_014063	AAAT	3	76942	76953	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	295136974
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ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Lathyrus sativus chloroplast