ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Anomochloa marantoidea chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_014062	CAG	4	692	703	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	295065708
2	NC_014062	AAG	4	3257	3267	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	295065709
3	NC_014062	TTG	4	11226	11236	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	295065714
4	NC_014062	ATA	4	12709	12721	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
5	NC_014062	ATT	4	17385	17396	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_014062	TTC	4	18499	18510	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
7	NC_014062	AGA	5	21376	21390	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	295065718
8	NC_014062	AAC	4	24029	24040	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	295065719
9	NC_014062	AAT	4	26465	26476	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	295065719
10	NC_014062	GTT	5	33256	33270	15	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	295065722
11	NC_014062	AGG	4	36968	36979	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	295065725
12	NC_014062	ATT	4	38756	38767	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_014062	ATG	4	40271	40281	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	295065727
14	NC_014062	CTA	4	41834	41845	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	295065728
15	NC_014062	AAG	4	44302	44313	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	295065729
16	NC_014062	AAT	4	46805	46816	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_014062	AGT	4	47318	47329	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	295065730
18	NC_014062	TGG	4	48769	48780	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_014062	CTT	4	50700	50712	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
20	NC_014062	GAA	4	59760	59772	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
21	NC_014062	GAA	4	59776	59786	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_014062	GAA	4	60372	60382	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_014062	TTC	4	62299	62310	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	295065740
24	NC_014062	ATT	6	65238	65255	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
25	NC_014062	TCA	4	66850	66860	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
26	NC_014062	TCT	5	67150	67163	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
27	NC_014062	TCT	4	76139	76151	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	295065707
28	NC_014062	ATA	4	88560	88570	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	295065707
29	NC_014062	TAC	4	90376	90387	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	295065707
30	NC_014062	AAG	4	90774	90785	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	295065751
31	NC_014062	AGG	4	91470	91481	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	295065751
32	NC_014062	GGA	4	100063	100073	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	295065751
33	NC_014062	TAA	4	105498	105509	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	295065751
34	NC_014062	AAG	4	105723	105734	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	295065751
35	NC_014062	AAG	4	106482	106493	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	295065751
36	NC_014062	CAG	4	107263	107273	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	295065751
37	NC_014062	AAT	4	107341	107352	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	295065751
38	NC_014062	TAT	4	111328	111338	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	295065751
39	NC_014062	CAG	4	111468	111479	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	295065751
40	NC_014062	TCT	4	114221	114231	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	295065751
41	NC_014062	GAT	4	114579	114589	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	295065751
42	NC_014062	TAA	4	116708	116718	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	295065751
43	NC_014062	TCT	4	119276	119287	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	295065751
44	NC_014062	CCT	4	120612	120622	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	295065751
45	NC_014062	CCT	4	129206	129217	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	295065751
46	NC_014062	TCT	4	129904	129915	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	295065751
47	NC_014062	GTA	4	130300	130311	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	295065751

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Anomochloa marantoidea chloroplast