ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Hyphantria cunea mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_014058	ATT	4	116	126	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_014058	T	12	140	151	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_014058	T	15	250	264	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
4	NC_014058	T	17	294	310	17	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	295065651
5	NC_014058	ATTATA	3	1089	1106	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	295065651
6	NC_014058	TAT	5	1114	1127	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	295065651
7	NC_014058	TAA	4	1193	1204	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	295065651
8	NC_014058	TTTTC	3	1224	1237	14	0 %	80 %	0 %	20 %	7 %	295065651
9	NC_014058	TTAT	3	1263	1273	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	295065651
10	NC_014058	ATA	5	1283	1296	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
11	NC_014058	TAAA	3	1420	1430	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_014058	GAAA	3	2279	2290	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	295065652
13	NC_014058	TTTG	3	2293	2304	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	295065652
14	NC_014058	ATT	4	2895	2907	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	295065652
15	NC_014058	TAT	5	3184	3198	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	295065653
16	NC_014058	TTAA	3	3380	3392	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	295065653
17	NC_014058	T	18	3954	3971	18	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	295065654
18	NC_014058	AATTT	3	3972	3985	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	295065654
19	NC_014058	ATT	4	3998	4008	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	295065654
20	NC_014058	ATT	4	4201	4212	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	295065655
21	NC_014058	AATT	3	4430	4440	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	295065655
22	NC_014058	ATTT	3	4883	4894	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	295065656
23	NC_014058	TTTC	4	5034	5048	15	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	295065656
24	NC_014058	AAT	4	5651	5662	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	295065657
25	NC_014058	ATA	4	5673	5684	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	295065657
26	NC_014058	TAAT	4	6111	6126	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
27	NC_014058	A	12	6186	6197	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
28	NC_014058	ATA	8	6421	6444	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	295065658
29	NC_014058	TAAA	3	6472	6483	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	295065658
30	NC_014058	TAA	4	6690	6702	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	295065658
31	NC_014058	AAAT	3	7018	7029	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	295065658
32	NC_014058	ATA	5	7402	7415	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	295065658
33	NC_014058	TCAT	3	7623	7633	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	295065658
34	NC_014058	AAAT	3	7641	7651	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	295065658
35	NC_014058	TAA	4	7840	7852	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	295065658
36	NC_014058	TAT	4	8062	8073	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	295065658
37	NC_014058	ATT	4	8079	8089	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	295065658
38	NC_014058	TAT	4	8102	8113	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	295065658
39	NC_014058	A	16	8121	8136	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	295065658
40	NC_014058	AATT	4	8461	8477	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	295065659
41	NC_014058	AAATAT	3	9021	9037	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	295065659
42	NC_014058	TAAA	3	9056	9066	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	295065659
43	NC_014058	AAAT	3	9140	9150	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	295065659
44	NC_014058	TAT	4	9548	9559	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	295065659
45	NC_014058	A	15	9729	9743	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	295065660
46	NC_014058	TAT	5	10028	10042	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	295065661
47	NC_014058	TTTA	3	10196	10207	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	295065661
48	NC_014058	TATT	4	10457	10472	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	295065661
49	NC_014058	T	12	10824	10835	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	295065662
50	NC_014058	TAA	5	11129	11143	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	295065662
51	NC_014058	ATTT	3	11147	11157	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	295065662
52	NC_014058	CCATT	3	11215	11228	14	20 %	40 %	0 %	40 %	7 %	295065662
53	NC_014058	ATT	4	11257	11267	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	295065662
54	NC_014058	AATTTT	3	11451	11468	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	295065662
55	NC_014058	TAA	4	11543	11554	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	295065662
56	NC_014058	AATT	4	11803	11818	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	295065663
57	NC_014058	TTAA	3	12446	12457	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	295065663
58	NC_014058	TA	6	12760	12770	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
59	NC_014058	TTAT	6	12835	12858	24	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
60	NC_014058	AT	17	12849	12882	34	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
61	NC_014058	TAAA	3	13095	13106	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
62	NC_014058	TAA	4	13273	13285	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
63	NC_014058	TTTAA	3	13310	13323	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
64	NC_014058	TAATT	3	13621	13635	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
65	NC_014058	A	14	13653	13666	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
66	NC_014058	ATTA	3	13819	13830	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014058	TTAA	3	13831	13842	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
68	NC_014058	TA	23	13848	13892	45	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
69	NC_014058	ATA	4	14191	14201	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
70	NC_014058	AATT	3	14232	14243	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
71	NC_014058	AATT	4	14254	14269	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
72	NC_014058	AAATT	3	14454	14468	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
73	NC_014058	TA	6	14580	14591	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
74	NC_014058	AATTT	3	14918	14932	15	40 %	60 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014058	AAT	4	15024	15036	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
76	NC_014058	TA	6	15126	15136	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
77	NC_014058	T	24	15150	15173	24	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
78	NC_014058	AATT	3	15230	15240	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
79	NC_014058	AATT	3	15320	15332	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
80	NC_014058	TA	7	15363	15377	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
81	NC_014058	AT	10	15394	15412	19	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
82	NC_014058	TTAAAT	3	15416	15433	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Hyphantria cunea mitochondrion