ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Pisum sativum chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_014057	AAGT	3	967	977	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	295136976
2	NC_014057	AAAG	3	1541	1551	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_014057	AT	7	1869	1881	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
4	NC_014057	AAAT	3	3848	3858	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_014057	A	12	4214	4225	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_014057	ATT	5	4364	4378	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
7	NC_014057	AT	7	4565	4578	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
8	NC_014057	CAA	4	6177	6188	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014057	T	16	6377	6392	16	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
10	NC_014057	T	14	6785	6798	14	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014057	AAGA	3	8749	8759	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_014057	TCAT	3	12359	12369	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
13	NC_014057	ATTTAA	3	13816	13833	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
14	NC_014057	TTCTAT	3	13876	13893	18	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
15	NC_014057	TA	7	13929	13941	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
16	NC_014057	TTAA	3	14044	14054	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_014057	A	14	14221	14234	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
18	NC_014057	TTTG	3	14435	14446	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_014057	T	14	14658	14671	14	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014057	AATT	3	15516	15527	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	295136984
21	NC_014057	TAT	4	15732	15742	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_014057	A	17	15990	16006	17	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
23	NC_014057	T	12	18097	18108	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014057	TAA	4	18547	18559	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
25	NC_014057	TCAT	3	18746	18757	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
26	NC_014057	TA	6	18762	18773	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_014057	GTT	4	19244	19254	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	295136987
28	NC_014057	A	12	20717	20728	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
29	NC_014057	TCT	4	21529	21539	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
30	NC_014057	TA	6	21650	21661	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
31	NC_014057	A	16	22532	22547	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
32	NC_014057	GAA	4	22584	22596	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	295136988
33	NC_014057	A	12	22862	22873	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	295136988
34	NC_014057	GAT	4	23411	23421	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	295136988
35	NC_014057	GATT	3	23881	23893	13	25 %	50 %	25 %	0 %	7 %	295136988
36	NC_014057	CTTT	3	23981	23991	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	295136988
37	NC_014057	GAT	4	27541	27552	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	295136988
38	NC_014057	TGAA	3	28046	28056	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	295136988
39	NC_014057	TTA	4	28940	28951	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	295136989
40	NC_014057	TCT	4	29212	29223	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	295136989
41	NC_014057	GAAA	3	31202	31213	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	295136990
42	NC_014057	AAGA	3	31906	31917	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	295136991
43	NC_014057	GCA	4	32710	32721	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	295136991
44	NC_014057	TG	6	32747	32757	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	295136991
45	NC_014057	ATG	4	33090	33100	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	295136991
46	NC_014057	AT	6	34219	34229	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
47	NC_014057	A	19	34296	34314	19	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
48	NC_014057	TAA	4	34355	34365	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
49	NC_014057	AAAG	4	34884	34898	15	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
50	NC_014057	TTTTAT	3	34921	34938	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014057	ATG	4	36237	36248	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_014057	TA	6	36387	36398	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
53	NC_014057	TA	6	36408	36419	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
54	NC_014057	TA	7	36423	36435	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
55	NC_014057	TAA	4	36676	36686	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
56	NC_014057	TA	6	36813	36823	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
57	NC_014057	TCTT	3	37004	37015	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
58	NC_014057	CTC	4	37098	37108	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
59	NC_014057	GAAA	3	39424	39435	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	295136994
60	NC_014057	TCT	4	39485	39495	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	295136994
61	NC_014057	TA	6	39523	39533	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	295136994
62	NC_014057	GCTT	3	39827	39837	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	295136994
63	NC_014057	GA	6	40604	40615	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
64	NC_014057	TA	7	40832	40844	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
65	NC_014057	TC	6	41223	41233	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	295136995
66	NC_014057	TA	9	41523	41539	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
67	NC_014057	TA	7	42165	42177	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
68	NC_014057	AAAT	3	42195	42205	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
69	NC_014057	CTTA	3	43170	43180	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
70	NC_014057	CTCGTA	3	44390	44407	18	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
71	NC_014057	TC	6	47812	47823	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
72	NC_014057	ATA	4	50806	50818	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
73	NC_014057	GGAAT	3	51091	51106	16	40 %	20 %	40 %	0 %	6 %	Non-Coding
74	NC_014057	A	14	51891	51904	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	295137049
75	NC_014057	TCT	4	53746	53758	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	295137049
76	NC_014057	CTA	4	54542	54552	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	295137049
77	NC_014057	A	15	55044	55058	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	295137049
78	NC_014057	TAA	4	56603	56614	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	295137049
79	NC_014057	A	19	56788	56806	19	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	295137049
80	NC_014057	A	14	57724	57737	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	295137049
81	NC_014057	A	18	59007	59024	18	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	295137049
82	NC_014057	AAAG	3	59242	59252	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	295137049
83	NC_014057	TA	9	60327	60344	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	295137049
84	NC_014057	TATTTA	3	60363	60380	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	295137049
85	NC_014057	TA	6	60387	60397	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	295137049
86	NC_014057	AGA	4	60610	60621	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	295137049
87	NC_014057	AAAT	3	60796	60808	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	295137049
88	NC_014057	AAAT	3	62578	62588	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	295137049
89	NC_014057	AATGA	3	62982	62996	15	60 %	20 %	20 %	0 %	6 %	295137049
90	NC_014057	AGAA	3	63261	63271	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	295137049
91	NC_014057	T	13	63605	63617	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	295137049
92	NC_014057	AGA	5	64046	64060	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	295137049
93	NC_014057	A	13	65040	65052	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	295137049
94	NC_014057	AATA	3	65082	65093	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	295137049
95	NC_014057	AT	6	65211	65221	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	295137049
96	NC_014057	T	12	65476	65487	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	295137049
97	NC_014057	ACTA	3	65824	65834	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	295137049
98	NC_014057	AATT	4	66904	66919	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	295137049
99	NC_014057	TA	7	66938	66950	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	295137049
100	NC_014057	T	13	67420	67432	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	295137049
101	NC_014057	T	12	67478	67489	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	295137049
102	NC_014057	ATT	4	68253	68264	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	295137049
103	NC_014057	TAA	4	69801	69811	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	295137049
104	NC_014057	TA	7	70504	70518	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	295137049
105	NC_014057	TTTGA	3	71163	71176	14	20 %	60 %	20 %	0 %	7 %	295137049
106	NC_014057	CT	6	72035	72045	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	295137049
107	NC_014057	AT	6	72100	72110	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	295137049
108	NC_014057	AT	6	72127	72137	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	295137049
109	NC_014057	TTTC	3	72783	72794	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	295137049
110	NC_014057	ATA	4	73281	73291	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	295137049
111	NC_014057	TA	8	73293	73307	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	295137049
112	NC_014057	ATA	4	73323	73335	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	295137049
113	NC_014057	ATC	4	73732	73742	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	295137049
114	NC_014057	TAAA	3	73760	73770	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	295137049
115	NC_014057	TCTT	3	74123	74133	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	295137049
116	NC_014057	AAT	4	74220	74231	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	295137049
117	NC_014057	A	16	74229	74244	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	295137049
118	NC_014057	T	14	74505	74518	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	295137049
119	NC_014057	TA	6	74598	74608	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	295137049
120	NC_014057	ATTT	3	75893	75904	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	295137049
121	NC_014057	ATT	4	75951	75962	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	295137049
122	NC_014057	T	15	75996	76010	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	295137049
123	NC_014057	GAAA	4	76035	76050	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	295137049
124	NC_014057	ATT	4	76207	76218	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	295137049
125	NC_014057	TAAA	3	77030	77041	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	295137049
126	NC_014057	CTGT	3	77289	77300	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	295137049
127	NC_014057	CAAT	3	77304	77314	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	295137049
128	NC_014057	AATT	3	78132	78144	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	295137049
129	NC_014057	AGC	4	79792	79803	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	295137049
130	NC_014057	TAA	4	79858	79868	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	295137049
131	NC_014057	TAG	4	80155	80165	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	295137049
132	NC_014057	T	12	81973	81984	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	295137049
133	NC_014057	A	17	82229	82245	17	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	295137049
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ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Pisum sativum chloroplast