Team
Contact

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Oncidium Gower Ramsey chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_014056TTC418381849120 %66.67 %0 %33.33 %8 %295311713
2NC_014056ATA5341234261566.67 %33.33 %0 %0 %6 %Non-Coding
3NC_014056TAA4661666271266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
4NC_014056TAT4845984691133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
5NC_014056ATT414449144601233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
6NC_014056TCT41466514676120 %66.67 %0 %33.33 %0 %Non-Coding
7NC_014056TGC41515015161120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %295311721
8NC_014056TCT41542815439120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
9NC_014056TCT41722817238110 %66.67 %0 %33.33 %9 %295311722
10NC_014056TTC42169421705120 %66.67 %0 %33.33 %8 %295311723
11NC_014056GTT42276422775120 %66.67 %33.33 %0 %8 %295311723
12NC_014056TTA431047310581233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
13NC_014056TGC43328333293110 %33.33 %33.33 %33.33 %9 %295311727
14NC_014056ATG438234382441133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %295311731
15NC_014056TTG44357843588110 %66.67 %33.33 %0 %9 %295311733
16NC_014056GTT44433344344120 %66.67 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
17NC_014056TTC44591545926120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
18NC_014056AGG446182461941333.33 %0 %66.67 %0 %7 %Non-Coding
19NC_014056ATT450966509781333.33 %66.67 %0 %0 %7 %295311735
20NC_014056TTG45349653506110 %66.67 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
21NC_014056TAT456161561721233.33 %66.67 %0 %0 %8 %295311738
22NC_014056GTT45789257902110 %66.67 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
23NC_014056TAT462471624811133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
24NC_014056TTC46797967990120 %66.67 %0 %33.33 %8 %295311779
25NC_014056TAT468621686331333.33 %66.67 %0 %0 %7 %295311779
26NC_014056TAA472360723711266.67 %33.33 %0 %0 %8 %295311779
27NC_014056CTT47956279573120 %66.67 %0 %33.33 %8 %295311779
28NC_014056ATT481278812881133.33 %66.67 %0 %0 %9 %295311779
29NC_014056CTT48311283123120 %66.67 %0 %33.33 %8 %295311779
30NC_014056GAT484951849611133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %295311779
31NC_014056GAT487826878371233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %295311779
32NC_014056TGA489514895251233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %295311779
33NC_014056TAC497079970901233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %295311779
34NC_014056CTT49734497355120 %66.67 %0 %33.33 %8 %295311785
35NC_014056AAG497489975001266.67 %0 %33.33 %0 %8 %295311785
36NC_014056CTT49763597647130 %66.67 %0 %33.33 %7 %295311785
37NC_014056TAT498179981911333.33 %66.67 %0 %0 %7 %295311785
38NC_014056ATA41084081084201366.67 %33.33 %0 %0 %7 %295311785
39NC_014056TAT41093071093171133.33 %66.67 %0 %0 %9 %295311785
40NC_014056GAA41109151109261266.67 %0 %33.33 %0 %8 %295311785
41NC_014056GAT41124981125081133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %295311785
42NC_014056ATA41126271126381266.67 %33.33 %0 %0 %8 %295311785
43NC_014056ATA41149071149181266.67 %33.33 %0 %0 %8 %295311785
44NC_014056ATA41152651152761266.67 %33.33 %0 %0 %8 %295311785
45NC_014056ATT41159441159551233.33 %66.67 %0 %0 %8 %295311785
46NC_014056AAT41161391161501266.67 %33.33 %0 %0 %8 %295311785
47NC_014056CTT4117597117608120 %66.67 %0 %33.33 %8 %295311785
48NC_014056TTC5119141119155150 %66.67 %0 %33.33 %6 %295311785
49NC_014056TAA41306161306281366.67 %33.33 %0 %0 %7 %295311785
50NC_014056GAG41309631309741233.33 %0 %66.67 %0 %8 %295311785
51NC_014056GTA41317191317301233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %295311785
52NC_014056TAA41378521378631266.67 %33.33 %0 %0 %8 %295311775
53NC_014056TCA41392871392991333.33 %33.33 %0 %33.33 %7 %295311775
54NC_014056ATC41409721409831233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %295311775
55NC_014056ATC41438481438581133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding