ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Papilio maraho mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_014055	TTTAT	3	126	140	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
2	NC_014055	TATTT	4	276	295	20	20 %	80 %	0 %	0 %	5 %	295065637
3	NC_014055	ATTT	3	459	469	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	295065637
4	NC_014055	TAA	5	693	707	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	295065637
5	NC_014055	ATT	4	719	730	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	295065637
6	NC_014055	TATT	3	885	897	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	295065637
7	NC_014055	ATT	4	1022	1034	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	295065637
8	NC_014055	TTAA	3	1037	1047	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	295065637
9	NC_014055	TAT	4	1095	1106	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	295065637
10	NC_014055	TTTA	3	1136	1147	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	295065637
11	NC_014055	TAT	4	1228	1239	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	295065637
12	NC_014055	AATT	3	1674	1685	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	295065638
13	NC_014055	AGG	4	2105	2116	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	295065638
14	NC_014055	GAAA	3	2224	2235	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	295065638
15	NC_014055	TAA	7	2830	2850	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	4 %	295065638
16	NC_014055	ATT	4	2877	2887	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	295065638
17	NC_014055	AATT	3	3710	3720	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	295065639
18	NC_014055	T	25	3891	3915	25	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	295065640
19	NC_014055	TAA	5	3973	3986	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	295065640
20	NC_014055	AATT	3	4377	4387	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	295065641
21	NC_014055	AAG	4	4548	4559	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	295065641
22	NC_014055	TTA	4	4577	4587	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	295065641
23	NC_014055	TATTTA	3	5492	5510	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
24	NC_014055	TTTAA	3	5536	5550	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
25	NC_014055	TAAA	3	5553	5563	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	295065643
26	NC_014055	TAT	4	5566	5578	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	295065643
27	NC_014055	AAT	4	5822	5833	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	295065643
28	NC_014055	ATA	10	6302	6332	31	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	295065644
29	NC_014055	AT	6	6421	6431	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	295065644
30	NC_014055	TAAA	3	6498	6508	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	295065644
31	NC_014055	TAT	4	6663	6674	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	295065644
32	NC_014055	AAAT	3	6902	6913	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	295065644
33	NC_014055	TTA	4	7181	7192	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	295065644
34	NC_014055	AAT	5	7288	7302	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	295065644
35	NC_014055	ATTAA	4	7327	7346	20	60 %	40 %	0 %	0 %	10 %	295065644
36	NC_014055	CAAT	3	7469	7479	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	295065644
37	NC_014055	A	12	7525	7536	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	295065644
38	NC_014055	A	12	7969	7980	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	295065644
39	NC_014055	A	12	8002	8013	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	295065644
40	NC_014055	AAT	4	8739	8750	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	295065645
41	NC_014055	AAAAT	3	8965	8978	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	295065645
42	NC_014055	AAAAT	3	9104	9117	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	295065645
43	NC_014055	AATTT	4	9200	9219	20	40 %	60 %	0 %	0 %	10 %	295065645
44	NC_014055	TAT	4	9354	9365	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	295065645
45	NC_014055	ATAC	3	9566	9578	13	50 %	25 %	0 %	25 %	7 %	295065646
46	NC_014055	ATT	4	9843	9854	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
47	NC_014055	TTTA	3	10063	10074	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	295065647
48	NC_014055	ATT	5	10136	10149	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	295065647
49	NC_014055	TTTTA	3	10240	10253	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	295065647
50	NC_014055	T	14	10689	10702	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	295065648
51	NC_014055	ATT	4	10774	10787	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	295065648
52	NC_014055	ATTAT	3	11122	11137	16	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	295065648
53	NC_014055	AATTTT	3	11316	11333	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	295065648
54	NC_014055	TAAT	3	11556	11567	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	295065648
55	NC_014055	AATTA	4	12263	12282	20	60 %	40 %	0 %	0 %	10 %	295065649
56	NC_014055	AATT	3	12528	12540	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	295065649
57	NC_014055	AT	8	12557	12571	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	295065649
58	NC_014055	TA	7	12583	12595	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
59	NC_014055	TTATAA	3	12650	12667	18	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014055	TAT	5	12719	12732	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
61	NC_014055	ATA	5	13048	13061	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
62	NC_014055	TTAAA	3	13454	13468	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
63	NC_014055	ATTTAA	4	13612	13636	25	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
64	NC_014055	ATTA	3	13727	13738	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014055	ATTT	3	13881	13892	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
66	NC_014055	AT	6	13924	13935	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
67	NC_014055	T	14	13958	13971	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
68	NC_014055	AAATT	3	13986	13999	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
69	NC_014055	ATTT	3	14213	14224	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
70	NC_014055	ATTTA	3	14267	14281	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
71	NC_014055	AAAAT	3	14340	14353	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
72	NC_014055	TAA	4	14663	14675	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
73	NC_014055	AT	6	14826	14837	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
74	NC_014055	T	14	14850	14863	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
75	NC_014055	ATTAT	5	14873	14896	24	40 %	60 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
76	NC_014055	ATATTA	3	14916	14933	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
77	NC_014055	TAA	4	14926	14942	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
78	NC_014055	ATA	4	14953	14964	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
79	NC_014055	TTA	4	14962	14973	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
80	NC_014055	TA	11	14979	14999	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
81	NC_014055	AT	6	15066	15076	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
82	NC_014055	ATTAT	4	15118	15136	19	40 %	60 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
83	NC_014055	ATATTA	3	15163	15180	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
84	NC_014055	TAA	4	15173	15189	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
85	NC_014055	ATA	4	15200	15211	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
86	NC_014055	TTA	4	15209	15220	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
87	NC_014055	TA	12	15227	15249	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
88	NC_014055	TTA	4	15253	15263	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
89	NC_014055	TTTTCT	3	15293	15310	18	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
90	NC_014055	AT	6	15313	15323	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
91	NC_014055	ATTAT	4	15365	15383	19	40 %	60 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
92	NC_014055	ATATTA	3	15410	15427	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
93	NC_014055	TAA	4	15420	15436	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
94	NC_014055	ATA	4	15447	15458	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
95	NC_014055	TTA	4	15456	15467	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
96	NC_014055	TA	12	15474	15496	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
97	NC_014055	TTA	4	15500	15510	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
98	NC_014055	TTTTCT	3	15543	15560	18	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
99	NC_014055	AT	6	15563	15573	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
100	NC_014055	ATTAT	4	15615	15633	19	40 %	60 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
101	NC_014055	ATATTA	3	15660	15677	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
102	NC_014055	TAA	4	15670	15686	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
103	NC_014055	ATA	4	15697	15708	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
104	NC_014055	TTA	4	15706	15717	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
105	NC_014055	TA	12	15724	15746	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
106	NC_014055	TTA	4	15750	15760	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
107	NC_014055	AT	6	15815	15825	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
108	NC_014055	ATTAT	4	15867	15885	19	40 %	60 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
109	NC_014055	ATATTA	3	15912	15929	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
110	NC_014055	TAA	4	15922	15938	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
111	NC_014055	ATA	4	15949	15960	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
112	NC_014055	TTA	4	15955	15966	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
113	NC_014055	TA	7	16055	16068	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Papilio maraho mitochondrion