ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tetra-nucleotide Perfect Repeats of Cucurbita pepo mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014050	ACCA	3	1937	1948	12	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_014050	AACA	3	4835	4846	12	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_014050	TTGG	4	6122	6137	16	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014050	AAAC	3	7167	7178	12	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_014050	AAAG	3	8191	8202	12	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014050	AGAA	3	10566	10577	12	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014050	TCTT	3	12152	12163	12	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_014050	GAAC	3	12555	12566	12	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_014050	GTCT	3	13609	13620	12	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_014050	TTAC	3	20235	20246	12	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_014050	ATAC	4	22427	22442	16	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_014050	GAAT	3	24103	24114	12	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014050	AATA	3	26499	26510	12	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014050	CTTT	3	28418	28429	12	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_014050	TGTC	3	29512	29523	12	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_014050	GTCT	5	29716	29735	20	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_014050	AGGC	3	33916	33927	12	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_014050	GCTT	3	36977	36988	12	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_014050	TTCA	3	39831	39842	12	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_014050	GCAA	3	40215	40226	12	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_014050	TATC	3	44452	44463	12	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_014050	TGAA	3	46763	46774	12	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014050	AGAA	5	55027	55046	20	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014050	CTTG	3	56946	56957	12	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_014050	CTTC	3	57283	57294	12	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_014050	TGCT	3	59451	59462	12	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_014050	AAAG	3	60932	60943	12	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014050	CTTC	3	65437	65448	12	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_014050	CTTT	3	66458	66469	12	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_014050	TGTT	3	68773	68784	12	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014050	AGAA	3	72054	72065	12	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014050	CTTT	3	77266	77277	12	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_014050	AAGA	5	78266	78285	20	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014050	TTCT	3	78551	78562	12	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_014050	TCTT	3	79076	79087	12	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_014050	CTTC	3	88368	88379	12	0 %	50 %	0 %	50 %	29531169
37	NC_014050	TTAG	3	89671	89682	12	25 %	50 %	25 %	0 %	29531169
38	NC_014050	CAAG	3	95366	95377	12	50 %	0 %	25 %	25 %	29531169
39	NC_014050	ATTC	3	95725	95736	12	25 %	50 %	0 %	25 %	29531169
40	NC_014050	ACCA	4	101786	101801	16	50 %	0 %	0 %	50 %	29531169
41	NC_014050	GAAA	3	102819	102830	12	75 %	0 %	25 %	0 %	29531169
42	NC_014050	CTTT	3	104467	104478	12	0 %	75 %	0 %	25 %	29531169
43	NC_014050	ATTC	3	108745	108756	12	25 %	50 %	0 %	25 %	29531169
44	NC_014050	CTTT	3	118147	118158	12	0 %	75 %	0 %	25 %	29531169
45	NC_014050	TTTG	3	127091	127102	12	0 %	75 %	25 %	0 %	29531169
46	NC_014050	CCTG	3	127728	127739	12	0 %	25 %	25 %	50 %	29531169
47	NC_014050	GAAA	3	128164	128175	12	75 %	0 %	25 %	0 %	29531169
48	NC_014050	TTCT	3	134302	134313	12	0 %	75 %	0 %	25 %	29531169
49	NC_014050	TTCT	3	135166	135177	12	0 %	75 %	0 %	25 %	29531169
50	NC_014050	TCAA	3	135271	135282	12	50 %	25 %	0 %	25 %	29531169
51	NC_014050	CAGC	3	144515	144526	12	25 %	0 %	25 %	50 %	29531169
52	NC_014050	AGAA	4	148384	148399	16	75 %	0 %	25 %	0 %	29531169
53	NC_014050	TTGA	3	148400	148411	12	25 %	50 %	25 %	0 %	29531169
54	NC_014050	GAAT	3	148643	148654	12	50 %	25 %	25 %	0 %	29531169
55	NC_014050	CTGT	3	149870	149881	12	0 %	50 %	25 %	25 %	29531169
56	NC_014050	CTTT	3	155238	155249	12	0 %	75 %	0 %	25 %	29531169
57	NC_014050	AGAA	3	163047	163058	12	75 %	0 %	25 %	0 %	29531169
58	NC_014050	ATGA	3	163114	163125	12	50 %	25 %	25 %	0 %	29531169
59	NC_014050	AAGA	3	173989	174000	12	75 %	0 %	25 %	0 %	29531169
60	NC_014050	GTTC	3	180355	180366	12	0 %	50 %	25 %	25 %	29531169
61	NC_014050	GCAA	3	184676	184687	12	50 %	0 %	25 %	25 %	29531169
62	NC_014050	GAAG	3	190975	190986	12	50 %	0 %	50 %	0 %	29531169
63	NC_014050	ACAG	3	193976	193987	12	50 %	0 %	25 %	25 %	29531169
64	NC_014050	AAAC	3	195943	195954	12	75 %	0 %	0 %	25 %	29531169
65	NC_014050	GAAA	3	200083	200094	12	75 %	0 %	25 %	0 %	29531169
66	NC_014050	TGAA	3	207346	207357	12	50 %	25 %	25 %	0 %	29531169
67	NC_014050	GAAA	3	208162	208173	12	75 %	0 %	25 %	0 %	29531169
68	NC_014050	AGTA	5	209634	209653	20	50 %	25 %	25 %	0 %	29531169
69	NC_014050	TTTC	3	210105	210116	12	0 %	75 %	0 %	25 %	29531169
70	NC_014050	TAAC	3	211593	211604	12	50 %	25 %	0 %	25 %	29531169
71	NC_014050	AAAG	3	212181	212192	12	75 %	0 %	25 %	0 %	29531169
72	NC_014050	TACT	3	212309	212320	12	25 %	50 %	0 %	25 %	29531169
73	NC_014050	TAGC	3	214164	214175	12	25 %	25 %	25 %	25 %	29531169
74	NC_014050	TTAC	4	214442	214457	16	25 %	50 %	0 %	25 %	29531169
75	NC_014050	TTCC	3	214838	214849	12	0 %	50 %	0 %	50 %	29531169
76	NC_014050	TAGT	3	214974	214985	12	25 %	50 %	25 %	0 %	29531169
77	NC_014050	TCAT	3	216140	216151	12	25 %	50 %	0 %	25 %	29531169
78	NC_014050	TATG	3	216514	216525	12	25 %	50 %	25 %	0 %	29531169
79	NC_014050	TGAA	3	221438	221449	12	50 %	25 %	25 %	0 %	29531169
80	NC_014050	GTTT	4	223407	223422	16	0 %	75 %	25 %	0 %	29531169
81	NC_014050	ACCA	3	224880	224891	12	50 %	0 %	0 %	50 %	29531169
82	NC_014050	TTGG	3	228428	228439	12	0 %	50 %	50 %	0 %	29531169
83	NC_014050	GAAA	3	230852	230863	12	75 %	0 %	25 %	0 %	29531169
84	NC_014050	TGCT	3	235429	235440	12	0 %	50 %	25 %	25 %	29531169
85	NC_014050	ACCA	3	240924	240935	12	50 %	0 %	0 %	50 %	29531169
86	NC_014050	AACA	3	241423	241434	12	75 %	0 %	0 %	25 %	29531169
87	NC_014050	AATT	3	247001	247012	12	50 %	50 %	0 %	0 %	29531169
88	NC_014050	TATT	3	249666	249677	12	25 %	75 %	0 %	0 %	29531169
89	NC_014050	CCGA	3	259921	259932	12	25 %	0 %	25 %	50 %	29531169
90	NC_014050	AGCA	3	260936	260947	12	50 %	0 %	25 %	25 %	29531169
91	NC_014050	TTAA	3	265989	266000	12	50 %	50 %	0 %	0 %	29531169
92	NC_014050	ACAA	3	267474	267485	12	75 %	0 %	0 %	25 %	29531169
93	NC_014050	AGAA	3	267563	267574	12	75 %	0 %	25 %	0 %	29531169
94	NC_014050	GAAA	4	272238	272253	16	75 %	0 %	25 %	0 %	29531169
95	NC_014050	TTTC	3	279690	279701	12	0 %	75 %	0 %	25 %	29531169
96	NC_014050	CTTT	4	280897	280912	16	0 %	75 %	0 %	25 %	29531169
97	NC_014050	GAAA	5	287569	287588	20	75 %	0 %	25 %	0 %	29531169
98	NC_014050	CTTG	3	289810	289821	12	0 %	50 %	25 %	25 %	29531169
99	NC_014050	ATCA	3	291060	291071	12	50 %	25 %	0 %	25 %	29531169
100	NC_014050	AAGA	3	291530	291541	12	75 %	0 %	25 %	0 %	29531169
101	NC_014050	CCAG	4	292369	292384	16	25 %	0 %	25 %	50 %	29531169
102	NC_014050	AGAA	3	293567	293578	12	75 %	0 %	25 %	0 %	29531169
103	NC_014050	AAAG	3	293639	293650	12	75 %	0 %	25 %	0 %	29531169
104	NC_014050	CAGT	3	293904	293915	12	25 %	25 %	25 %	25 %	29531169
105	NC_014050	GGAA	3	294232	294243	12	50 %	0 %	50 %	0 %	29531169
106	NC_014050	TCTT	4	295181	295196	16	0 %	75 %	0 %	25 %	29531169
107	NC_014050	TTTC	5	297452	297471	20	0 %	75 %	0 %	25 %	29531169
108	NC_014050	TTCT	4	297552	297567	16	0 %	75 %	0 %	25 %	29531169
109	NC_014050	AAAC	3	297841	297852	12	75 %	0 %	0 %	25 %	29531169
110	NC_014050	CAAA	3	297860	297871	12	75 %	0 %	0 %	25 %	29531169
111	NC_014050	CCTT	3	298221	298232	12	0 %	50 %	0 %	50 %	29531169
112	NC_014050	GATA	3	299420	299431	12	50 %	25 %	25 %	0 %	29531169
113	NC_014050	CTTT	4	299783	299798	16	0 %	75 %	0 %	25 %	29531169
114	NC_014050	CTTT	3	303637	303648	12	0 %	75 %	0 %	25 %	29531169
115	NC_014050	TCTA	3	304233	304244	12	25 %	50 %	0 %	25 %	29531169
116	NC_014050	AGCA	3	305694	305705	12	50 %	0 %	25 %	25 %	29531169
117	NC_014050	CTTC	3	306463	306474	12	0 %	50 %	0 %	50 %	29531169
118	NC_014050	GGAA	3	308202	308213	12	50 %	0 %	50 %	0 %	29531169
119	NC_014050	ATTC	3	308800	308811	12	25 %	50 %	0 %	25 %	29531169
120	NC_014050	CTTT	3	312199	312210	12	0 %	75 %	0 %	25 %	29531169
121	NC_014050	TTTC	3	314895	314906	12	0 %	75 %	0 %	25 %	29531169
122	NC_014050	TTAT	3	317266	317277	12	25 %	75 %	0 %	0 %	29531169
123	NC_014050	CTAT	3	319684	319695	12	25 %	50 %	0 %	25 %	29531169
124	NC_014050	CAAG	3	325905	325916	12	50 %	0 %	25 %	25 %	29531169
125	NC_014050	CTTT	3	330534	330545	12	0 %	75 %	0 %	25 %	29531169
126	NC_014050	TCAT	3	339625	339636	12	25 %	50 %	0 %	25 %	29531169
127	NC_014050	TGGT	3	340728	340739	12	0 %	50 %	50 %	0 %	29531169
128	NC_014050	AACG	3	346142	346153	12	50 %	0 %	25 %	25 %	29531169
129	NC_014050	AGCT	3	347568	347579	12	25 %	25 %	25 %	25 %	29531169
130	NC_014050	GCAA	3	348719	348730	12	50 %	0 %	25 %	25 %	29531169
131	NC_014050	CTCA	3	349016	349027	12	25 %	25 %	0 %	50 %	29531169
132	NC_014050	TCTT	3	349857	349868	12	0 %	75 %	0 %	25 %	29531169
133	NC_014050	TGGT	4	350304	350319	16	0 %	50 %	50 %	0 %	29531169
134	NC_014050	TCTT	3	351956	351967	12	0 %	75 %	0 %	25 %	29531169
135	NC_014050	AACC	3	353418	353429	12	50 %	0 %	0 %	50 %	29531169
136	NC_014050	GTAG	3	353624	353635	12	25 %	25 %	50 %	0 %	29531169
137	NC_014050	TATT	3	354199	354210	12	25 %	75 %	0 %	0 %	29531169
138	NC_014050	AAGA	3	369086	369097	12	75 %	0 %	25 %	0 %	29531169
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439	NC_014050	AAAG	3	981020	981031	12	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
440	NC_014050	GAAA	3	981638	981649	12	75 %	0 %	25 %	0 %	29531170

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tetra-nucleotide Perfect Repeats of Cucurbita pepo mitochondrion