ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Cucurbita pepo mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_014050	AT	6	3148	3159	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_014050	AT	8	11762	11776	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
3	NC_014050	AT	6	13186	13197	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_014050	CA	7	20931	20943	13	50 %	0 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
5	NC_014050	AT	7	22419	22432	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
6	NC_014050	CT	6	22630	22640	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
7	NC_014050	TA	6	40509	40519	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_014050	AC	6	43172	43183	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
9	NC_014050	AG	6	46552	46562	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_014050	GT	6	49386	49396	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_014050	AT	6	61630	61641	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_014050	AG	7	62381	62393	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
13	NC_014050	TA	6	67251	67261	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
14	NC_014050	AG	7	80913	80926	14	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
15	NC_014050	AT	7	81309	81322	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
16	NC_014050	TC	7	81534	81546	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
17	NC_014050	CT	6	86706	86717	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	29531169
18	NC_014050	AT	7	92082	92094	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	29531169
19	NC_014050	CT	7	96487	96499	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	29531169
20	NC_014050	AG	6	102525	102536	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	29531169
21	NC_014050	CT	6	103949	103959	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	29531169
22	NC_014050	CT	6	111060	111071	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	29531169
23	NC_014050	AG	6	111181	111192	12	50 %	0 %	50 %	0 %	0 %	29531169
24	NC_014050	GA	6	111554	111564	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	29531169
25	NC_014050	AG	7	112173	112185	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	29531169
26	NC_014050	AG	6	114432	114442	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	29531169
27	NC_014050	AT	8	115119	115134	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	29531169
28	NC_014050	CA	6	115531	115542	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	29531169
29	NC_014050	TC	6	115773	115784	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	29531169
30	NC_014050	AT	6	118470	118480	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	29531169
31	NC_014050	TA	6	121565	121575	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	29531169
32	NC_014050	CT	6	130262	130273	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	29531169
33	NC_014050	AG	6	132577	132587	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	29531169
34	NC_014050	CT	6	138158	138169	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	29531169
35	NC_014050	AG	7	142504	142516	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	29531169
36	NC_014050	GA	6	144447	144457	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	29531169
37	NC_014050	GA	7	148597	148609	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	29531169
38	NC_014050	CT	6	149537	149547	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	29531169
39	NC_014050	TA	6	153280	153291	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	29531169
40	NC_014050	CT	6	156743	156754	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	29531169
41	NC_014050	TC	6	164757	164767	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	29531169
42	NC_014050	CT	6	170220	170231	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	29531169
43	NC_014050	AG	7	171096	171108	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	29531169
44	NC_014050	GA	6	172766	172777	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	29531169
45	NC_014050	AG	6	176007	176018	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	29531169
46	NC_014050	CT	6	176819	176829	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	29531169
47	NC_014050	CT	6	179832	179843	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	29531169
48	NC_014050	GA	6	182394	182404	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	29531169
49	NC_014050	TA	6	183245	183255	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	29531169
50	NC_014050	AG	6	188699	188709	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	29531169
51	NC_014050	CT	6	196578	196588	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	29531169
52	NC_014050	AT	6	196609	196619	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	29531169
53	NC_014050	GA	6	200553	200563	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	29531169
54	NC_014050	GA	6	200671	200681	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	29531169
55	NC_014050	TC	6	201271	201283	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	29531169
56	NC_014050	AG	6	206755	206766	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	29531169
57	NC_014050	GA	6	207798	207808	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	29531169
58	NC_014050	TC	6	210121	210132	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	29531169
59	NC_014050	TA	6	212141	212151	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	29531169
60	NC_014050	TC	6	214044	214054	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	29531169
61	NC_014050	AG	6	216363	216374	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	29531169
62	NC_014050	AT	6	217865	217875	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	29531169
63	NC_014050	TA	6	220870	220880	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	29531169
64	NC_014050	GA	6	228120	228131	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	29531169
65	NC_014050	TG	6	231537	231548	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	29531169
66	NC_014050	CT	6	233150	233161	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	29531169
67	NC_014050	AT	6	240733	240743	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	29531169
68	NC_014050	GA	7	241758	241771	14	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	29531169
69	NC_014050	AT	6	244781	244792	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	29531169
70	NC_014050	CT	6	249656	249666	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	29531169
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131	NC_014050	TC	6	410346	410356	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	29531168
132	NC_014050	CT	6	411127	411137	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	29531168
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ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Cucurbita pepo mitochondrion