ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Hexa-nucleotide Imperfect Repeats of Citrullus lanatus mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_014043	TTGCTT	3	16012	16030	19	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
2	NC_014043	AAACGA	3	23152	23169	18	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
3	NC_014043	GAAGGA	3	29663	29681	19	50 %	0 %	50 %	0 %	10 %	Non-Coding
4	NC_014043	ATAGAT	4	37782	37804	23	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	4 %	Non-Coding
5	NC_014043	CTCTTC	3	38509	38526	18	0 %	50 %	0 %	50 %	5 %	Non-Coding
6	NC_014043	TCATTC	7	44228	44269	42	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	2 %	29531166
7	NC_014043	GGGAGA	3	44556	44574	19	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10 %	Non-Coding
8	NC_014043	TCTTTT	3	101069	101085	17	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	5 %	29531164
9	NC_014043	ACACCG	3	101800	101817	18	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	5 %	29531164
10	NC_014043	TGGTTT	3	103045	103063	19	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10 %	29531164
11	NC_014043	CTCTTT	3	109364	109381	18	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	5 %	29531164
12	NC_014043	ATTATA	3	153576	153594	19	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	29531164
13	NC_014043	TTCCTT	3	162629	162646	18	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	5 %	29531164
14	NC_014043	TTTTCT	3	172588	172605	18	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	5 %	29531164
15	NC_014043	CCTCCC	3	173775	173792	18	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	5 %	29531164
16	NC_014043	TATTAG	3	185653	185675	23	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	4 %	29531164
17	NC_014043	CCGATT	3	210025	210043	19	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	5 %	29531164
18	NC_014043	ACTAGA	3	223092	223108	17	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	5 %	29531164
19	NC_014043	AATGAG	7	240195	240236	42	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	2 %	29531164
20	NC_014043	CTTCAG	3	251034	251052	19	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	5 %	29531164
21	NC_014043	TTTCTT	3	260792	260810	19	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	5 %	29531164
22	NC_014043	CTTTTT	3	279966	279983	18	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	5 %	29531164
23	NC_014043	TCATAT	3	289043	289060	18	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	5 %	29531164
24	NC_014043	TGCCGA	4	318122	318145	24	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	4 %	29531164
25	NC_014043	GAGAAA	3	319678	319694	17	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	5 %	29531164
26	NC_014043	GTGAAG	3	343505	343523	19	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	5 %	29531165
27	NC_014043	TTCTTT	3	346616	346634	19	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
28	NC_014043	ATAGAT	3	349230	349253	24	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	8 %	29531165
29	NC_014043	AGGAGT	4	376402	376425	24	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Hexa-nucleotide Imperfect Repeats of Citrullus lanatus mitochondrion