ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Citrullus lanatus mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_014043	CTA	4	1048	1059	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	29531164
2	NC_014043	TCT	4	3563	3575	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
3	NC_014043	AAG	4	4332	4342	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_014043	TTA	4	4566	4577	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_014043	TTC	4	11728	11740	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
6	NC_014043	CAG	5	18814	18828	15	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
7	NC_014043	TTC	4	21081	21092	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
8	NC_014043	CTT	4	21498	21509	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014043	TTC	4	25408	25420	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
10	NC_014043	TCT	8	25656	25679	24	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
11	NC_014043	CAT	4	26570	26580	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
12	NC_014043	AGG	4	27107	27118	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_014043	ACC	4	30044	30055	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	29531165
14	NC_014043	CGC	4	33393	33404	12	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	8 %	29531166
15	NC_014043	TAA	4	34042	34053	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	29531166
16	NC_014043	TAT	4	34729	34741	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	29531166
17	NC_014043	AGA	4	35002	35014	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	29531166
18	NC_014043	AAC	5	35632	35646	15	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	6 %	29531166
19	NC_014043	ACA	4	38647	38658	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
20	NC_014043	TCT	4	39241	39252	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
21	NC_014043	CTT	4	40609	40620	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014043	AAG	4	40847	40859	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
23	NC_014043	CAA	4	41492	41502	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
24	NC_014043	GCT	4	41765	41775	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
25	NC_014043	TAT	4	43793	43804	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_014043	TTA	5	45429	45442	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
27	NC_014043	GCT	4	45473	45485	13	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
28	NC_014043	AGC	4	46236	46247	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
29	NC_014043	AAT	4	47943	47954	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_014043	TCT	4	48666	48677	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
31	NC_014043	ACA	4	48947	48958	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
32	NC_014043	AGA	4	50606	50616	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_014043	TTA	5	52537	52551	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
34	NC_014043	TCT	4	54045	54056	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
35	NC_014043	GAA	4	56575	56586	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
36	NC_014043	TAT	4	56594	56605	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_014043	CTA	4	60340	60351	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
38	NC_014043	TCT	4	60598	60609	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
39	NC_014043	TCA	4	64668	64679	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
40	NC_014043	AGA	4	64943	64954	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
41	NC_014043	TGC	4	66181	66192	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
42	NC_014043	CTA	4	66307	66318	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
43	NC_014043	TCT	4	66554	66564	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
44	NC_014043	CTT	4	67176	67186	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	29531163
45	NC_014043	TAA	4	69942	69954	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
46	NC_014043	GTA	4	70865	70875	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	29531164
47	NC_014043	AGA	4	72161	72172	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	29531164
48	NC_014043	CCT	4	77802	77813	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	29531164
49	NC_014043	CTT	4	78795	78805	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	29531164
50	NC_014043	CAC	4	80029	80039	11	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	9 %	29531164
51	NC_014043	AGA	4	84756	84767	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	29531164
52	NC_014043	CTA	4	87618	87628	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	29531164
53	NC_014043	AGA	4	88377	88387	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	29531164
54	NC_014043	GTA	4	89035	89045	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	29531164
55	NC_014043	GAG	4	90277	90288	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	29531164
56	NC_014043	TAA	4	90953	90964	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	29531164
57	NC_014043	TTG	4	90990	91001	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29531164
58	NC_014043	CAG	4	95022	95033	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	29531164
59	NC_014043	ACA	4	95332	95343	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	29531164
60	NC_014043	TTG	4	98318	98329	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	29531164
61	NC_014043	GAG	4	99042	99054	13	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	7 %	29531164
62	NC_014043	GAA	4	101388	101399	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	0 %	29531164
63	NC_014043	TAT	5	102554	102567	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	29531164
64	NC_014043	TCA	5	102775	102790	16	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	6 %	29531164
65	NC_014043	AGA	4	104516	104527	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	29531164
66	NC_014043	TTC	7	107261	107281	21	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	29531164
67	NC_014043	TCT	4	107645	107655	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	29531164
68	NC_014043	GTC	4	114511	114522	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	29531164
69	NC_014043	GTT	4	118556	118566	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	29531164
70	NC_014043	TTA	5	121791	121805	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	29531164
71	NC_014043	TGC	4	123930	123941	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	29531164
72	NC_014043	GCT	4	124081	124092	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29531164
73	NC_014043	GGA	5	125113	125127	15	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	6 %	29531164
74	NC_014043	CTT	4	126986	126997	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	29531164
75	NC_014043	AGA	4	127913	127924	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	29531164
76	NC_014043	ATT	4	128456	128467	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	29531164
77	NC_014043	TTC	4	129046	129057	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	29531164
78	NC_014043	TCT	4	130813	130823	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	29531164
79	NC_014043	CTT	4	131648	131658	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	29531164
80	NC_014043	TCC	4	136694	136705	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	29531164
81	NC_014043	TCC	4	139511	139522	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	29531164
82	NC_014043	AAT	4	141047	141058	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	29531164
83	NC_014043	GAC	4	143104	143115	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	29531164
84	NC_014043	TAC	4	146452	146463	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	29531164
85	NC_014043	TTC	4	146530	146541	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	29531164
86	NC_014043	AAT	4	151784	151795	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	29531164
87	NC_014043	ATA	4	155862	155872	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	29531164
88	NC_014043	TTA	4	159210	159222	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	29531164
89	NC_014043	GAA	4	159991	160001	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	29531164
90	NC_014043	GGA	5	168695	168709	15	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	6 %	29531164
91	NC_014043	ACA	4	168745	168755	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	29531164
92	NC_014043	GAA	4	171957	171969	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	29531164
93	NC_014043	GGC	4	173558	173569	12	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	8 %	29531164
94	NC_014043	CGT	4	174910	174922	13	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	7 %	29531164
95	NC_014043	GCC	4	175339	175349	11	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	9 %	29531164
96	NC_014043	AGT	4	175696	175707	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	29531164
97	NC_014043	CGT	4	179502	179512	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	29531164
98	NC_014043	ATG	4	180770	180780	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	29531164
99	NC_014043	ACA	4	183086	183096	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	29531164
100	NC_014043	TCC	4	187488	187500	13	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	7 %	29531164
101	NC_014043	TTG	4	187964	187975	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	29531164
102	NC_014043	ATG	4	190370	190381	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	29531164
103	NC_014043	CAT	4	193920	193931	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	29531164
104	NC_014043	CAA	4	194025	194036	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	29531164
105	NC_014043	TAA	4	194431	194443	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	29531164
106	NC_014043	GAA	5	195217	195231	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	29531164
107	NC_014043	ACT	4	196558	196568	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	29531164
108	NC_014043	GGA	4	196712	196723	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	29531164
109	NC_014043	GAG	4	199663	199673	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	29531164
110	NC_014043	CTT	4	205846	205858	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	29531164
111	NC_014043	GTA	4	206361	206372	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	29531164
112	NC_014043	AAG	4	209396	209407	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	29531164
113	NC_014043	TAC	4	216575	216586	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	29531164
114	NC_014043	CTT	4	216693	216703	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	29531164
115	NC_014043	TAC	4	218106	218116	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	29531164
116	NC_014043	CTA	4	218949	218960	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	29531164
117	NC_014043	AAG	4	221448	221460	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	29531164
118	NC_014043	GAA	4	222306	222317	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	29531164
119	NC_014043	GAG	4	227287	227297	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	29531164
120	NC_014043	CTC	4	231585	231596	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	29531164
121	NC_014043	TGT	4	235505	235516	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	29531164
122	NC_014043	TTA	4	236510	236521	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	29531164
123	NC_014043	GCT	4	238216	238227	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	29531164
124	NC_014043	TAA	5	239021	239034	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	29531164
125	NC_014043	AAG	4	242221	242232	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	29531164
126	NC_014043	AGA	4	242644	242655	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	29531164
127	NC_014043	TCT	4	246426	246437	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	29531164
128	NC_014043	AGA	5	249017	249031	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	0 %	29531164
129	NC_014043	AGT	4	249038	249049	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	29531164
130	NC_014043	TTC	4	250400	250410	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	29531164
131	NC_014043	AAG	4	253555	253566	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	29531164
132	NC_014043	ATA	4	253784	253794	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	29531164
133	NC_014043	GGA	4	254598	254609	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	29531164
134	NC_014043	CCT	4	255133	255143	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	29531164
135	NC_014043	GCG	4	261473	261484	12	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	8 %	29531164
136	NC_014043	TCA	4	262013	262024	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	29531164
137	NC_014043	GTC	4	266782	266793	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29531164
138	NC_014043	CGG	4	270223	270234	12	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	8 %	29531164
139	NC_014043	TCT	4	270362	270372	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	29531164
140	NC_014043	TTC	4	270416	270428	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	29531164
141	NC_014043	GAT	4	272807	272817	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	29531164
142	NC_014043	TCT	4	276419	276430	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	29531164
143	NC_014043	CTG	4	278765	278776	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	29531164
144	NC_014043	TAA	4	289241	289252	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	29531164
145	NC_014043	TAA	4	289492	289503	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	29531164
146	NC_014043	AGA	4	291666	291678	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	29531164
147	NC_014043	TCT	4	293352	293363	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	29531164
148	NC_014043	GAA	4	302004	302016	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	29531164
149	NC_014043	TCT	4	303726	303736	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	29531164
150	NC_014043	TGC	4	304108	304119	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	29531164
151	NC_014043	ATG	4	304466	304477	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	29531164
152	NC_014043	AAT	4	306764	306775	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	29531164
153	NC_014043	GTT	4	308059	308069	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	29531164
154	NC_014043	TAG	4	309240	309250	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	29531164
155	NC_014043	CTC	4	309813	309824	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	29531164
156	NC_014043	CAA	4	311696	311707	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	29531164
157	NC_014043	AAG	4	316825	316835	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	29531164
158	NC_014043	GAA	4	321312	321322	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	29531164
159	NC_014043	ATC	4	322065	322075	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	29531164
160	NC_014043	GAA	5	322531	322545	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	29531164
161	NC_014043	TTC	4	326816	326827	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	29531164
162	NC_014043	TTA	4	327444	327455	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	29531164
163	NC_014043	TTC	4	329364	329374	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	29531164
164	NC_014043	CGG	4	336358	336369	12	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	8 %	29531164
165	NC_014043	ACT	4	339553	339565	13	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	29531165
166	NC_014043	TTG	4	341059	341070	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	29531165
167	NC_014043	CAC	4	341558	341569	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	29531165
168	NC_014043	CAT	4	341704	341714	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	29531165
169	NC_014043	GAT	5	344625	344638	14	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	29531165
170	NC_014043	GCC	4	344833	344844	12	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	8 %	29531165
171	NC_014043	ATA	4	346489	346501	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	29531165
172	NC_014043	AAT	4	346507	346518	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
173	NC_014043	CAG	4	355319	355330	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
174	NC_014043	AAC	4	356766	356776	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
175	NC_014043	TAA	4	359607	359618	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
176	NC_014043	TAT	4	364871	364882	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
177	NC_014043	CAT	4	366262	366272	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	29531164
178	NC_014043	TCT	4	368299	368310	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
179	NC_014043	CAC	4	374865	374877	13	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	7 %	Non-Coding
180	NC_014043	TTC	5	375928	375942	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Citrullus lanatus mitochondrion