ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Phoenix dactylifera chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_013991	CAG	4	741	752	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	292559491
2	NC_013991	AAGT	3	847	857	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	292559491
3	NC_013991	GAAA	3	2658	2668	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	292559492
4	NC_013991	AAAATA	4	2990	3013	24	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	8 %	292559492
5	NC_013991	GTAT	4	3369	3383	15	25 %	50 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
6	NC_013991	AT	6	3400	3411	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_013991	A	12	3859	3870	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013991	AAAT	3	4163	4174	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_013991	TATC	3	4479	4490	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
10	NC_013991	T	13	4854	4866	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013991	TCTCT	3	5036	5049	14	0 %	60 %	0 %	40 %	7 %	300388131
12	NC_013991	AGAA	3	5266	5277	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	300388131
13	NC_013991	TTTG	3	5542	5552	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	300388131
14	NC_013991	TATC	4	6103	6118	16	25 %	50 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
15	NC_013991	GAA	4	7408	7419	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_013991	A	13	8064	8076	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	292559495
17	NC_013991	GA	6	8343	8354	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
18	NC_013991	ATAA	4	8588	8602	15	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
19	NC_013991	TAT	5	8611	8626	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
20	NC_013991	AAAGAT	3	8718	8736	19	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	10 %	Non-Coding
21	NC_013991	TTA	4	9071	9082	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_013991	AT	6	9123	9134	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_013991	A	12	9184	9195	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_013991	TA	12	9194	9216	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_013991	AATA	3	9245	9255	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_013991	A	18	9263	9280	18	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
27	NC_013991	TATAAC	3	9539	9555	17	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
28	NC_013991	TTTA	3	9560	9572	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
29	NC_013991	GAAA	3	10611	10621	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
30	NC_013991	T	14	12349	12362	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
31	NC_013991	T	14	13149	13162	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	292559571
32	NC_013991	TAA	4	14215	14225	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_013991	TTTC	3	14822	14833	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
34	NC_013991	CATT	3	14838	14849	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
35	NC_013991	TTTC	3	14864	14874	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
36	NC_013991	AT	8	15000	15015	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
37	NC_013991	AT	7	15033	15045	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
38	NC_013991	AACT	3	16195	16206	12	50 %	25 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013991	AAAT	3	16349	16360	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_013991	AATC	3	17248	17258	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
41	NC_013991	TCAA	3	17561	17572	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	292559500
42	NC_013991	T	14	19327	19340	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	292559500
43	NC_013991	AT	6	20692	20702	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	292559500
44	NC_013991	TTA	4	21624	21634	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	292559572
45	NC_013991	TCT	4	22959	22969	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	292559572
46	NC_013991	TTCA	3	23439	23450	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	292559572
47	NC_013991	GTT	4	24392	24403	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	292559572
48	NC_013991	GAAAA	3	27037	27051	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	292559501
49	NC_013991	AATA	3	28721	28731	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
50	NC_013991	TGG	4	29009	29020	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
51	NC_013991	ATCA	3	29379	29389	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
52	NC_013991	A	13	29596	29608	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
53	NC_013991	TA	6	29715	29725	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
54	NC_013991	AT	8	29749	29763	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
55	NC_013991	A	15	29869	29883	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
56	NC_013991	TA	6	30100	30112	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
57	NC_013991	CTTT	3	30628	30639	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
58	NC_013991	TCT	4	30863	30875	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
59	NC_013991	ATC	4	32043	32054	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
60	NC_013991	CATT	3	32506	32517	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
61	NC_013991	T	14	33127	33140	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
62	NC_013991	TA	7	33206	33218	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
63	NC_013991	A	13	33278	33290	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
64	NC_013991	GAAA	3	34887	34898	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	292559505
65	NC_013991	AG	6	35994	36004	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
66	NC_013991	GTTC	3	36023	36033	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
67	NC_013991	AT	6	36233	36243	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
68	NC_013991	TC	6	36613	36623	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	292559506
69	NC_013991	ATA	4	36755	36766	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
70	NC_013991	TTACT	3	36790	36804	15	20 %	60 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
71	NC_013991	AT	11	36849	36868	20	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
72	NC_013991	ATT	4	37769	37780	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
73	NC_013991	ATG	4	39261	39271	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	292559508
74	NC_013991	AAGA	3	40355	40366	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	292559509
75	NC_013991	AATG	3	40754	40765	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	292559509
76	NC_013991	GCA	4	41159	41170	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	292559509
77	NC_013991	TATTT	3	42495	42509	15	20 %	80 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013991	TTAA	3	42982	42993	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
79	NC_013991	TTAA	3	43336	43348	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	292559569
80	NC_013991	AAGAA	3	43517	43531	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	292559569
81	NC_013991	TTTC	3	43867	43878	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	292559569
82	NC_013991	TAT	4	44255	44266	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	292559569
83	NC_013991	AGT	4	46328	46339	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	292559510
84	NC_013991	GAAT	3	46703	46715	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
85	NC_013991	ATTAT	3	47132	47147	16	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
86	NC_013991	ATT	4	47303	47315	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
87	NC_013991	TTAT	4	47352	47367	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
88	NC_013991	AT	8	47400	47415	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
89	NC_013991	TA	7	47427	47439	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
90	NC_013991	TAAGA	3	47566	47580	15	60 %	20 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
91	NC_013991	AT	6	47727	47738	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
92	NC_013991	TTGA	3	47995	48007	13	25 %	50 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
93	NC_013991	AT	6	48305	48317	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
94	NC_013991	TA	6	49072	49083	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
95	NC_013991	T	14	51572	51585	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
96	NC_013991	TCTCTA	3	51658	51676	19	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	10 %	Non-Coding
97	NC_013991	AAAT	3	51728	51739	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
98	NC_013991	CTA	4	51819	51829	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
99	NC_013991	AT	6	51865	51877	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
100	NC_013991	GAAAA	3	51886	51900	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
101	NC_013991	TTGTT	3	52392	52405	14	0 %	80 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
102	NC_013991	TTTTTA	3	53015	53033	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
103	NC_013991	AAACT	3	53127	53141	15	60 %	20 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
104	NC_013991	TTTTC	3	54120	54134	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
105	NC_013991	TAAA	3	58357	58368	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	292559516
106	NC_013991	CTTA	4	58531	58546	16	25 %	50 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
107	NC_013991	C	13	58958	58970	13	0 %	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013991	A	12	58971	58982	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013991	AAAT	3	59804	59814	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	292559517
110	NC_013991	ATTT	3	61026	61037	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
111	NC_013991	TAGA	3	61133	61144	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
112	NC_013991	ATA	4	61320	61332	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
113	NC_013991	TA	9	61327	61343	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
114	NC_013991	AAT	4	61344	61354	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
115	NC_013991	ATATAA	4	61353	61376	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
116	NC_013991	TA	6	61418	61428	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
117	NC_013991	A	14	62743	62756	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	300388127
118	NC_013991	AATG	3	63419	63430	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	300388127
119	NC_013991	TTTCA	3	66858	66872	15	20 %	60 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013991	TAATA	3	66895	66909	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
121	NC_013991	A	14	67293	67306	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
122	NC_013991	ATTT	3	67405	67416	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
123	NC_013991	TTA	4	67475	67486	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
124	NC_013991	TTGAA	3	67796	67810	15	40 %	40 %	20 %	0 %	6 %	292559526
125	NC_013991	A	12	68836	68847	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
126	NC_013991	TAAT	3	69047	69057	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	292559528
127	NC_013991	TTA	7	69364	69385	22	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
128	NC_013991	TTC	4	69516	69527	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
129	NC_013991	AATA	3	69769	69780	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	292559529
130	NC_013991	AGGAAG	3	69812	69829	18	50 %	0 %	50 %	0 %	5 %	Non-Coding
131	NC_013991	AT	7	69951	69966	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
132	NC_013991	AATA	3	70039	70050	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
133	NC_013991	AAAT	3	70483	70493	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
134	NC_013991	CTTA	3	70547	70559	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
135	NC_013991	AAATA	3	71212	71225	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
136	NC_013991	TGA	4	71889	71901	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	300388130
137	NC_013991	A	12	72298	72309	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	300388130
138	NC_013991	TTTA	3	72490	72501	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	300388130
139	NC_013991	TAT	5	72784	72799	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	300388130
140	NC_013991	ATAA	3	73029	73040	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	300388130
141	NC_013991	TTTCT	3	73264	73277	14	0 %	80 %	0 %	20 %	7 %	300388130
142	NC_013991	TCT	4	73310	73321	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	300388130
143	NC_013991	TTTC	3	77200	77210	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	300388130
144	NC_013991	CTTT	3	79977	79988	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	300388130
145	NC_013991	TCC	4	80351	80362	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	300388130
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147	NC_013991	T	14	82733	82746	14	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	300388130
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150	NC_013991	TTTTA	3	84438	84452	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	300388130
151	NC_013991	ATTT	3	84467	84478	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	300388130
152	NC_013991	CATA	3	84546	84557	12	50 %	25 %	0 %	25 %	0 %	300388130
153	NC_013991	TTCT	3	84586	84597	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	300388130
154	NC_013991	CTT	4	86895	86906	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	300388130
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156	NC_013991	TTCT	3	90422	90432	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	300388130
157	NC_013991	GAT	4	91770	91781	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	300388130
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159	NC_013991	TGA	4	93485	93496	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	300388130
160	NC_013991	AATA	3	94347	94359	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	300388130
161	NC_013991	TTTC	3	94409	94420	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	300388130
162	NC_013991	CTTA	3	95529	95539	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	300388130
163	NC_013991	TCTA	3	96587	96598	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	300388130
164	NC_013991	TCCGG	3	97341	97355	15	0 %	20 %	40 %	40 %	6 %	300388130
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169	NC_013991	TCTA	3	106051	106062	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	300388128
170	NC_013991	GAGG	3	108904	108915	12	25 %	0 %	75 %	0 %	8 %	300388128
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172	NC_013991	TAAG	3	110236	110246	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	300388128
173	NC_013991	CT	6	112245	112255	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	300388128
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176	NC_013991	A	13	115755	115767	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	300388128
177	NC_013991	TA	8	115768	115782	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	300388128
178	NC_013991	TA	6	115786	115796	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	300388128
179	NC_013991	ATT	4	116749	116759	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	300388128
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190	NC_013991	GATG	3	120851	120862	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	300388128
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192	NC_013991	AT	7	123655	123667	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	300388128
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210	NC_013991	T	16	130164	130179	16	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	300388128
211	NC_013991	CTTTT	4	131126	131144	19	0 %	80 %	0 %	20 %	5 %	300388128
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217	NC_013991	ACTAAT	4	142286	142308	23	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	8 %	300388128
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219	NC_013991	GTA	4	143393	143404	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	300388128
220	NC_013991	ACCGG	3	147305	147319	15	20 %	0 %	40 %	40 %	6 %	Non-Coding
221	NC_013991	TAGA	3	148063	148074	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
222	NC_013991	TGAA	3	150240	150251	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	292559566
223	NC_013991	ATCA	3	151215	151227	13	50 %	25 %	0 %	25 %	7 %	292559566
224	NC_013991	TGAT	3	151310	151322	13	25 %	50 %	25 %	0 %	7 %	292559566
225	NC_013991	ATC	4	152880	152891	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	292559566
226	NC_013991	ATTT	3	154102	154113	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	292559566
227	NC_013991	ATC	4	155924	155934	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
228	NC_013991	CATT	3	157968	157978	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
229	NC_013991	TAATA	3	158402	158415	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
230	NC_013991	TAATA	3	158419	158432	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Phoenix dactylifera chloroplast