ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Hartmannella vermiformis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_013986	TAT	4	7	19	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
2	NC_013986	TGT	4	290	301	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_013986	TTAT	3	2141	2151	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	29255944
4	NC_013986	AT	11	4024	4044	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	29255944
5	NC_013986	TTGAA	3	5140	5153	14	40 %	40 %	20 %	0 %	7 %	29255944
6	NC_013986	TCAG	3	5791	5803	13	25 %	25 %	25 %	25 %	7 %	29255945
7	NC_013986	A	17	6262	6278	17	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	29255945
8	NC_013986	TCGA	3	6654	6665	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	29255945
9	NC_013986	TGT	4	7874	7885	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29255945
10	NC_013986	TAA	5	8116	8129	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	29255945
11	NC_013986	ATTGT	3	8131	8145	15	20 %	60 %	20 %	0 %	6 %	29255945
12	NC_013986	AT	6	9212	9225	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	29255945
13	NC_013986	CTTT	3	9784	9794	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	29255945
14	NC_013986	ATTTTC	3	10926	10944	19	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	10 %	29255946
15	NC_013986	AAT	4	11348	11359	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	29255946
16	NC_013986	TTC	4	11650	11662	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	29255946
17	NC_013986	GAA	4	12124	12136	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	29255946
18	NC_013986	ATA	4	12444	12455	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	29255946
19	NC_013986	CAA	4	13129	13140	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	29255946
20	NC_013986	T	12	13856	13867	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	29255946
21	NC_013986	AATT	3	14077	14088	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	29255946
22	NC_013986	GTT	4	14533	14544	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	29255946
23	NC_013986	ATGA	3	14612	14623	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	29255946
24	NC_013986	AGAC	3	18879	18891	13	50 %	0 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding
25	NC_013986	T	14	21212	21225	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
26	NC_013986	TTTG	3	21555	21566	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	29255947
27	NC_013986	TTTTA	3	22239	22253	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	29255947
28	NC_013986	A	15	22845	22859	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	29255947
29	NC_013986	ATTT	3	23247	23257	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	29255947
30	NC_013986	ACAA	3	24333	24343	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	29255947
31	NC_013986	TTTG	3	24361	24371	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	29255947
32	NC_013986	TTTA	3	25296	25307	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
33	NC_013986	TTTC	3	25373	25383	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
34	NC_013986	TTTTA	3	27633	27646	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
35	NC_013986	TA	6	28384	28397	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
36	NC_013986	CATTT	3	28428	28441	14	20 %	60 %	0 %	20 %	7 %	29255947
37	NC_013986	TAA	5	29740	29753	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
38	NC_013986	ATTTT	3	30648	30662	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	29255947
39	NC_013986	AT	6	30998	31008	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	29255947
40	NC_013986	TAA	4	31401	31412	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	29255947
41	NC_013986	TTA	4	31747	31758	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	29255947
42	NC_013986	TTTG	3	32122	32133	12	0 %	75 %	25 %	0 %	0 %	29255947
43	NC_013986	TTTA	3	32367	32377	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	29255947
44	NC_013986	TATT	3	32610	32621	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	29255947
45	NC_013986	TATTT	3	32673	32687	15	20 %	80 %	0 %	0 %	0 %	29255947
46	NC_013986	CTTA	3	32868	32879	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	29255947
47	NC_013986	TTC	4	33241	33252	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	29255947
48	NC_013986	TAT	4	33476	33486	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	29255947
49	NC_013986	ATA	5	34091	34105	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	29255947
50	NC_013986	T	13	34886	34898	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	29255947
51	NC_013986	CTT	4	35007	35017	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	29255947
52	NC_013986	T	12	35043	35054	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	29255947
53	NC_013986	TTTA	5	35172	35190	19	25 %	75 %	0 %	0 %	10 %	29255947
54	NC_013986	GAA	4	35796	35807	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	29255947
55	NC_013986	AGTG	3	36060	36071	12	25 %	25 %	50 %	0 %	0 %	29255947
56	NC_013986	GGT	4	37684	37695	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	29255947
57	NC_013986	TTAT	3	39227	39238	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	29255947
58	NC_013986	CTTT	3	39370	39382	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	29255948
59	NC_013986	TTCT	3	41723	41734	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	29255948
60	NC_013986	TTTA	3	43021	43031	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	29255948
61	NC_013986	TAAT	3	43258	43269	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	29255948
62	NC_013986	TTTG	3	43321	43333	13	0 %	75 %	25 %	0 %	7 %	29255948
63	NC_013986	GA	6	43450	43460	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	29255948
64	NC_013986	TTTG	3	43532	43543	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	29255948
65	NC_013986	TTTTG	3	43617	43631	15	0 %	80 %	20 %	0 %	6 %	29255948
66	NC_013986	GTT	4	43914	43924	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	29255948
67	NC_013986	TAT	4	45461	45473	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	29255948
68	NC_013986	TTTA	3	45750	45760	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	29255948
69	NC_013986	TGT	4	46004	46015	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	29255948
70	NC_013986	T	12	46088	46099	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	29255948
71	NC_013986	TTAA	5	46164	46182	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	29255948
72	NC_013986	TA	6	47303	47313	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	29255948
73	NC_013986	TCT	4	47559	47570	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	29255948
74	NC_013986	ATA	4	48484	48495	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	29255948
75	NC_013986	ATA	4	48981	48992	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	29255948
76	NC_013986	TATT	3	49204	49214	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	29255948
77	NC_013986	TTGG	3	49267	49277	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	29255948
78	NC_013986	TTTA	3	49472	49484	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	29255948

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Hartmannella vermiformis mitochondrion