ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Mecistocirrus digitatus mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_013848	GTTT	3	566	577	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	288904191
2	NC_013848	TGT	4	1029	1039	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	288904191
3	NC_013848	A	13	1669	1681	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
4	NC_013848	TAGA	3	1981	1992	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	288904192
5	NC_013848	TAA	4	2064	2076	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	288904192
6	NC_013848	TAT	4	2184	2194	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	288904192
7	NC_013848	ATAAAA	3	2739	2757	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
8	NC_013848	AAATT	3	2938	2952	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
9	NC_013848	ATTTT	3	3198	3212	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
10	NC_013848	ATTTT	3	3277	3291	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
11	NC_013848	TTAAA	3	3442	3455	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
12	NC_013848	TTAA	3	3468	3478	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_013848	TA	6	3681	3691	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	288904193
14	NC_013848	TTTAAT	3	4085	4102	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	288904194
15	NC_013848	ATT	5	4191	4204	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	288904194
16	NC_013848	AGTT	3	4556	4567	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	288904194
17	NC_013848	CTTTGT	3	4950	4966	17	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	5 %	288904194
18	NC_013848	TAA	4	5026	5037	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	288904194
19	NC_013848	TTTAAT	3	5291	5308	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	288904194
20	NC_013848	TTTA	3	5527	5539	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	288904194
21	NC_013848	ATATTA	3	5781	5798	18	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013848	TATAAT	3	5809	5825	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
23	NC_013848	AT	11	6001	6025	25	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_013848	AATT	3	6090	6100	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_013848	ATA	4	6115	6126	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_013848	TTA	5	6184	6198	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
27	NC_013848	ATT	4	6217	6227	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_013848	TAAT	4	6296	6311	16	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013848	TTTA	3	6336	6346	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
30	NC_013848	TAAAAA	3	6417	6435	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
31	NC_013848	AAGTAA	3	6477	6494	18	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
32	NC_013848	TATTA	3	6576	6590	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
33	NC_013848	GT	6	6642	6652	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
34	NC_013848	TAAAA	3	6689	6702	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
35	NC_013848	TAAAA	4	6723	6743	21	80 %	20 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
36	NC_013848	AAT	4	6772	6782	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
37	NC_013848	ATA	4	6781	6792	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_013848	GTTT	3	7145	7155	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	288904195
39	NC_013848	AATT	3	7811	7821	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_013848	AAT	4	8148	8159	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
41	NC_013848	AT	6	8387	8398	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
42	NC_013848	ATTT	3	8447	8457	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_013848	TTG	4	9021	9032	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	288904197
44	NC_013848	AATAT	3	9325	9339	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	288904197
45	NC_013848	AAT	4	9818	9829	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	288904197
46	NC_013848	TTTAA	3	9857	9870	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	288904197
47	NC_013848	TTTA	3	9915	9925	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	288904198
48	NC_013848	TATT	4	9936	9951	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	288904198
49	NC_013848	TTTA	3	10477	10489	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	288904198
50	NC_013848	GTTAA	3	10509	10523	15	40 %	40 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
51	NC_013848	AAT	5	10760	10775	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	288904199
52	NC_013848	TTTA	3	10811	10821	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	288904199
53	NC_013848	TAA	4	11131	11141	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	288904199
54	NC_013848	TGT	4	11222	11233	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	288904199
55	NC_013848	TAAA	3	11743	11754	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
56	NC_013848	ATA	4	11757	11768	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
57	NC_013848	AAT	4	11939	11949	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	288904200
58	NC_013848	TTTA	3	12188	12199	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	288904200
59	NC_013848	GTT	4	12481	12492	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	288904200
60	NC_013848	ATTTTT	3	12622	12640	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	288904200
61	NC_013848	ATTT	3	12812	12822	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	288904200
62	NC_013848	AAATT	3	12860	12873	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	288904200
63	NC_013848	TGT	4	12982	12993	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	288904200
64	NC_013848	ATT	4	13823	13834	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	288904201
65	NC_013848	ATT	4	13923	13934	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	288904202
66	NC_013848	AT	6	13959	13970	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	288904202
67	NC_013848	ATT	4	13993	14003	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	288904202
68	NC_013848	TAA	4	14069	14080	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	288904202
69	NC_013848	TA	6	14189	14199	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	288904202
70	NC_013848	AATTTT	3	14223	14240	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	288904202
71	NC_013848	TTATA	3	14320	14335	16	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	288904202
72	NC_013848	TTTA	3	14432	14442	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	288904202
73	NC_013848	TAA	5	14705	14719	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	288904202
74	NC_013848	TAA	4	14735	14746	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	288904202
75	NC_013848	TAA	4	15104	15116	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	288904202

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Mecistocirrus digitatus mitochondrion