ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Gomphocerus licenti mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_013847	AAATA	4	349	367	19	80 %	20 %	0 %	0 %	5 %	288904188
2	NC_013847	TTAG	3	779	789	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	288904188
3	NC_013847	TTA	4	935	946	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	288904188
4	NC_013847	TTAA	3	1237	1249	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	288904188
5	NC_013847	AAT	4	1533	1544	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	288904177
6	NC_013847	ATTT	4	2466	2481	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	288904177
7	NC_013847	TAT	4	3139	3150	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	288904187
8	NC_013847	TATTT	3	3919	3932	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	288904178
9	NC_013847	CTT	4	3965	3975	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	288904178
10	NC_013847	ATA	4	4008	4019	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	288904178
11	NC_013847	ATT	4	4123	4135	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	288904179
12	NC_013847	ATTT	3	4829	4841	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	288904180
13	NC_013847	AAT	4	5576	5587	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	288904181
14	NC_013847	TAA	4	5806	5817	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	288904181
15	NC_013847	TAA	4	6093	6103	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_013847	AAT	4	6333	6344	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	288904189
17	NC_013847	CAAA	3	6357	6367	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	288904189
18	NC_013847	AAT	4	6853	6863	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	288904189
19	NC_013847	TTA	4	7195	7206	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	288904189
20	NC_013847	TAA	4	7304	7315	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	288904189
21	NC_013847	AAG	4	7382	7392	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	288904189
22	NC_013847	AAG	4	7444	7454	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	288904189
23	NC_013847	ATA	4	7538	7550	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	288904189
24	NC_013847	TGAA	3	7757	7768	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	288904189
25	NC_013847	AAACA	4	9176	9194	19	80 %	0 %	0 %	20 %	10 %	288904182
26	NC_013847	AAT	4	9582	9593	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	288904183
27	NC_013847	AAT	4	9961	9972	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	288904184
28	NC_013847	TAT	4	9969	9981	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	288904184
29	NC_013847	TATT	3	10080	10091	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	288904184
30	NC_013847	ATT	4	10160	10171	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	288904184
31	NC_013847	AAT	4	10174	10185	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	288904184
32	NC_013847	TAA	4	10320	10331	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	288904184
33	NC_013847	ATT	4	10766	10776	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	288904185
34	NC_013847	ATTC	3	10997	11008	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	288904185
35	NC_013847	TATT	3	11231	11241	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	288904185
36	NC_013847	AAT	4	11392	11403	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	288904185
37	NC_013847	ATA	4	12039	12049	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	288904186
38	NC_013847	TAA	4	12179	12191	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	288904186
39	NC_013847	TAAAA	3	12251	12264	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	288904186
40	NC_013847	TAA	4	13457	13468	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
41	NC_013847	TTA	5	13505	13518	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
42	NC_013847	AAAT	3	13519	13531	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
43	NC_013847	TTTA	3	13812	13823	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
44	NC_013847	AAT	4	13953	13963	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
45	NC_013847	AATTA	5	14180	14203	24	60 %	40 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding
46	NC_013847	TTAA	3	14736	14746	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
47	NC_013847	AAAT	3	14806	14817	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
48	NC_013847	CAAA	3	14881	14892	12	75 %	0 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013847	A	13	14915	14927	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
50	NC_013847	CAA	4	14970	14981	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013847	ATT	4	15183	15195	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
52	NC_013847	TAT	4	15222	15233	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
53	NC_013847	ATAATT	3	15255	15272	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
54	NC_013847	TA	6	15290	15300	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
55	NC_013847	ATA	4	15463	15475	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
56	NC_013847	T	15	15557	15571	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Gomphocerus licenti mitochondrion