ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Vigna radiata chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_013843	TTG	4	2497	2508	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	289066807
2	NC_013843	ATG	4	2620	2631	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	289066807
3	NC_013843	ATT	4	2839	2849	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_013843	TAA	5	8060	8074	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
5	NC_013843	ATA	5	9918	9932	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
6	NC_013843	ATA	7	13383	13403	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_013843	ATA	4	13491	13501	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_013843	TAA	4	16479	16489	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_013843	TAT	4	16902	16912	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_013843	AAT	4	18536	18548	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	289066816
11	NC_013843	AGA	4	26512	26522	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	289066820
12	NC_013843	TAA	4	33581	33592	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_013843	TCT	4	34663	34674	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
14	NC_013843	AAC	4	40381	40392	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	289066827
15	NC_013843	GAA	4	41911	41923	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	289066827
16	NC_013843	AAT	4	48753	48764	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_013843	GTT	5	49404	49418	15	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	289066830
18	NC_013843	TGT	4	52768	52779	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	289066833
19	NC_013843	ATT	4	56411	56421	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_013843	TAA	4	56910	56920	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_013843	TAT	4	60040	60050	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	289066836
22	NC_013843	ATT	4	60875	60886	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_013843	TTA	4	67875	67886	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_013843	ATT	4	69438	69449	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_013843	CTG	4	70028	70039	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	289066850
26	NC_013843	ATA	4	71180	71191	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	289066850
27	NC_013843	AAT	4	75391	75402	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	289066850
28	NC_013843	TCT	4	78327	78337	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	289066850
29	NC_013843	TAT	7	81354	81375	22	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	289066850
30	NC_013843	ACG	4	81832	81843	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	289066850
31	NC_013843	CTT	4	81875	81886	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	289066850
32	NC_013843	GAT	4	82343	82353	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	289066850
33	NC_013843	GAT	4	83710	83720	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	289066850
34	NC_013843	TTA	4	97381	97392	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	289066880
35	NC_013843	AAT	5	98096	98109	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	289066880
36	NC_013843	ATT	4	109726	109738	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	289066880
37	NC_013843	TAT	6	109853	109869	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	289066880
38	NC_013843	ATT	4	110305	110315	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	289066880
39	NC_013843	ATA	4	111157	111168	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	289066880
40	NC_013843	TAA	4	113804	113816	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	289066880
41	NC_013843	TTA	4	117188	117198	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	289066880
42	NC_013843	TTA	4	134062	134072	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	289066880
43	NC_013843	TAA	4	134778	134789	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	289066880
44	NC_013843	ACC	4	143665	143675	11	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	9 %	289066883
45	NC_013843	ATC	4	148450	148460	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
46	NC_013843	ATC	4	149817	149827	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	289066885
47	NC_013843	GAA	5	150283	150297	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	289066885
48	NC_013843	AAT	8	150794	150817	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Vigna radiata chloroplast