ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Candida sojae mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_013839	ATT	4	242	254	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
2	NC_013839	ATA	4	886	898	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
3	NC_013839	AAT	5	1354	1369	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	28890350
4	NC_013839	ATT	4	5128	5139	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	28890350
5	NC_013839	ATA	7	5469	5489	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	28890350
6	NC_013839	AGA	9	6188	6214	27	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
7	NC_013839	ATT	5	6312	6326	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
8	NC_013839	TAA	4	6432	6443	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_013839	TAA	6	7093	7111	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
10	NC_013839	TAA	4	7836	7846	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	28890351
11	NC_013839	ATA	4	7849	7861	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	28890351
12	NC_013839	TAA	4	8566	8576	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	28890351
13	NC_013839	TAA	4	8725	8735	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	28890351
14	NC_013839	ATC	4	9071	9081	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	28890351
15	NC_013839	ATA	4	9164	9175	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_013839	ATA	4	9794	9805	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_013839	ATT	6	10537	10554	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013839	TAG	4	11004	11015	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_013839	AAT	4	11727	11737	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	28890351
20	NC_013839	TAT	7	12834	12855	22	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_013839	ATA	4	13670	13680	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	28890351
22	NC_013839	TAA	5	13698	13711	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	28890351
23	NC_013839	ATT	4	14586	14597	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_013839	ATT	4	14644	14656	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
25	NC_013839	AGA	5	14843	14857	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
26	NC_013839	ATA	4	15062	15074	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
27	NC_013839	AAG	4	15923	15933	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	28890351
28	NC_013839	TAC	4	15942	15953	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	28890351
29	NC_013839	AGC	4	16444	16455	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	28890351
30	NC_013839	TAA	6	16656	16673	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	28890351
31	NC_013839	TAA	4	16788	16799	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	28890351
32	NC_013839	ATA	4	16862	16873	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	28890351
33	NC_013839	ATA	4	17513	17523	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
34	NC_013839	TTA	4	18733	18745	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
35	NC_013839	TAG	5	19603	19617	15	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
36	NC_013839	TTA	4	19772	19782	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
37	NC_013839	TAA	4	20065	20076	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_013839	AAT	4	20270	20282	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
39	NC_013839	TAT	4	21214	21225	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	28890351
40	NC_013839	TTA	4	21241	21251	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	28890351
41	NC_013839	ATA	9	22060	22086	27	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
42	NC_013839	CTA	4	23907	23918	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
43	NC_013839	ATA	6	24369	24386	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
44	NC_013839	ATT	5	25748	25762	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
45	NC_013839	GAT	4	25841	25851	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	28890352
46	NC_013839	TTA	4	26187	26197	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	28890352
47	NC_013839	TTA	4	27076	27086	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	28890352
48	NC_013839	AGT	4	28020	28030	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
49	NC_013839	TTA	4	28479	28490	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
50	NC_013839	TCT	9	28708	28734	27	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
51	NC_013839	ATT	4	28794	28805	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_013839	TAT	4	30102	30112	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	28890352
53	NC_013839	AAT	4	30578	30589	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
54	NC_013839	TAT	4	33716	33726	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
55	NC_013839	TAA	4	33770	33780	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
56	NC_013839	TAT	4	34190	34202	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
57	NC_013839	TAT	4	35076	35088	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	28890352
58	NC_013839	ATA	4	35240	35252	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
59	NC_013839	ATT	4	35292	35303	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	28890352
60	NC_013839	TAT	4	35949	35959	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	28890352
61	NC_013839	TAT	4	36160	36171	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	28890352
62	NC_013839	GCT	4	36854	36865	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	28890352
63	NC_013839	TAA	4	37654	37665	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	28890352
64	NC_013839	TAT	4	38454	38464	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Candida sojae mitochondrion