ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Chattonella marina mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_013837	AATTTT	3	323	341	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	28906515
2	NC_013837	TTTA	3	1274	1284	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	28906515
3	NC_013837	ATTT	3	1561	1571	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_013837	TTATT	3	1632	1646	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
5	NC_013837	AAAT	3	1781	1792	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_013837	TAA	4	1813	1824	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	28906515
7	NC_013837	TTTA	3	3085	3096	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	28906515
8	NC_013837	CTA	4	3928	3938	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	28906515
9	NC_013837	AATT	3	4898	4909	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	28906515
10	NC_013837	T	17	5531	5547	17	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	28906516
11	NC_013837	ATA	4	6012	6023	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	28906516
12	NC_013837	AATT	3	6336	6347	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	28906516
13	NC_013837	TTAA	3	6569	6580	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013837	ATAA	4	6657	6672	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
15	NC_013837	T	13	6912	6924	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	28906516
16	NC_013837	AATT	3	7807	7817	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	28906516
17	NC_013837	ATA	4	7849	7859	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	28906516
18	NC_013837	ATAA	3	8270	8281	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_013837	TTTA	3	8670	8681	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_013837	ATA	4	8876	8886	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_013837	AAAAC	3	9311	9324	14	80 %	0 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
22	NC_013837	AAT	4	9681	9692	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_013837	TTAA	3	10265	10276	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_013837	ATTT	3	10485	10496	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_013837	TATT	3	10691	10701	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	28906516
26	NC_013837	AACA	3	13023	13033	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
27	NC_013837	ATTC	3	13093	13103	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
28	NC_013837	ATTT	3	14500	14510	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_013837	ACAA	3	14583	14593	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
30	NC_013837	TTG	4	15495	15506	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	28906516
31	NC_013837	TAAA	4	15670	15684	15	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
32	NC_013837	TAAA	4	16339	16354	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
33	NC_013837	CTTT	3	17838	17849	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
34	NC_013837	AAAT	4	18458	18473	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
35	NC_013837	AATAA	3	18480	18494	15	80 %	20 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013837	GGTAT	3	18704	18718	15	20 %	40 %	40 %	0 %	6 %	28906516
37	NC_013837	GAGT	3	18998	19009	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_013837	ATT	4	20002	20012	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	28906516
39	NC_013837	TTTA	3	20023	20034	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	28906516
40	NC_013837	ATT	4	21585	21596	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	28906517
41	NC_013837	TAT	5	21839	21853	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	28906517
42	NC_013837	AGG	4	21930	21941	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	28906517
43	NC_013837	TAA	4	22499	22510	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	28906517
44	NC_013837	ATT	4	23767	23778	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	28906517
45	NC_013837	GTTT	3	24380	24391	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	28906517
46	NC_013837	TTA	4	25352	25362	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	28906517
47	NC_013837	AAAG	3	26041	26052	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	28906517
48	NC_013837	ATT	4	28067	28079	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	28906517
49	NC_013837	GTT	4	29113	29124	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	28906517
50	NC_013837	AATA	3	30069	30080	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	28906517
51	NC_013837	TTGG	3	30175	30185	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
52	NC_013837	AATT	3	30259	30269	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	28906517
53	NC_013837	ATT	7	30757	30778	22	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
54	NC_013837	TA	7	31613	31626	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	28906517
55	NC_013837	AATT	3	31727	31739	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	28906517
56	NC_013837	A	15	32069	32083	15	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013837	A	12	32594	32605	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	28906517
58	NC_013837	TTTA	3	32701	32711	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
59	NC_013837	TAT	5	32811	32824	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	28906517
60	NC_013837	AATT	3	33039	33049	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	28906517
61	NC_013837	TTTTA	3	33398	33412	15	20 %	80 %	0 %	0 %	0 %	28906517
62	NC_013837	ATAA	3	33470	33481	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013837	TTAT	4	33496	33511	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	28906517
64	NC_013837	AAATA	3	33648	33661	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	28906517
65	NC_013837	ATA	4	34025	34035	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	28906517
66	NC_013837	A	13	34484	34496	13	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	28906517
67	NC_013837	TAA	4	34643	34653	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	28906518
68	NC_013837	TTAA	3	35360	35371	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
69	NC_013837	TAAC	3	35517	35527	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	28906518
70	NC_013837	AATT	3	35529	35539	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	28906518
71	NC_013837	A	13	35614	35626	13	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	28906518
72	NC_013837	TCTAAA	3	36036	36053	18	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	5 %	28906518
73	NC_013837	AATT	3	36113	36124	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	28906518
74	NC_013837	T	12	38071	38082	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	28906518
75	NC_013837	T	13	38364	38376	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	28906518
76	NC_013837	AATC	3	38956	38967	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	28906518
77	NC_013837	TTG	4	39170	39181	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	28906518
78	NC_013837	TGT	4	39188	39199	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	28906518
79	NC_013837	ATAA	3	39572	39583	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	28906518
80	NC_013837	TTTAAA	3	41011	41029	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	28906519
81	NC_013837	TTTA	3	41060	41071	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	28906519
82	NC_013837	GTCT	3	41152	41164	13	0 %	50 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding
83	NC_013837	TAAA	3	42495	42506	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	28906519
84	NC_013837	CTT	4	44268	44279	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	28906519
85	NC_013837	AAAT	3	44651	44662	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

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