ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Typha latifolia chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_013823	AT	7	1279	1292	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
2	NC_013823	TA	11	3335	3355	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_013823	TA	7	3365	3378	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
4	NC_013823	AT	7	6622	6634	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
5	NC_013823	AT	9	9169	9185	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
6	NC_013823	AT	7	9721	9733	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
7	NC_013823	AT	17	9764	9796	33	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_013823	AT	7	9828	9841	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
9	NC_013823	AT	7	9848	9861	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
10	NC_013823	TC	6	10730	10740	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
11	NC_013823	AT	7	15359	15373	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
12	NC_013823	AT	7	15414	15428	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
13	NC_013823	AT	7	16781	16795	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
14	NC_013823	TA	7	31469	31481	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
15	NC_013823	AG	6	38109	38119	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_013823	TA	12	38325	38348	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_013823	AT	11	38984	39003	20	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
18	NC_013823	TG	6	43308	43318	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	289065089
19	NC_013823	CT	6	46906	46917	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	289065090
20	NC_013823	TA	19	48846	48882	37	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_013823	AT	6	49385	49395	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_013823	TA	12	49407	49428	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_013823	AT	6	49431	49441	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
24	NC_013823	TA	6	49455	49468	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
25	NC_013823	TA	11	49467	49488	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_013823	TA	6	49496	49509	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
27	NC_013823	TA	7	49511	49525	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
28	NC_013823	AT	7	49866	49880	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
29	NC_013823	AG	6	50137	50148	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_013823	AT	6	51203	51214	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
31	NC_013823	TA	7	51542	51555	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
32	NC_013823	AT	6	60340	60350	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_013823	TA	7	63407	63421	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
34	NC_013823	TA	31	63454	63514	61	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
35	NC_013823	AC	6	70515	70525	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
36	NC_013823	GT	6	87023	87034	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	289065113
37	NC_013823	AT	6	87473	87484	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	289065113
38	NC_013823	AT	7	89203	89216	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	289065113
39	NC_013823	GA	6	95122	95132	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	289065113
40	NC_013823	TG	6	118776	118786	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	289065148
41	NC_013823	AT	8	118807	118821	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	289065148
42	NC_013823	TA	6	118849	118859	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	289065148
43	NC_013823	AT	6	123360	123370	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	289065148
44	NC_013823	TA	7	123733	123745	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	289065148
45	NC_013823	AT	6	125112	125122	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	289065148
46	NC_013823	GA	6	136910	136920	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	289065148
47	NC_013823	TC	6	155582	155592	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	289065151
48	NC_013823	AT	7	161500	161513	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Typha latifolia chloroplast