ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Perfect Repeats of Typha latifolia chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013823	TA	6	3367	3378	12	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013823	T	12	3722	3733	12	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013823	AT	6	9721	9732	12	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013823	AT	7	9779	9792	14	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013823	A	18	9903	9920	18	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013823	A	12	14970	14981	12	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013823	AT	7	15360	15373	14	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013823	AT	7	15414	15427	14	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013823	AT	6	16784	16795	12	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013823	T	14	17658	17671	14	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013823	T	16	24041	24056	16	0 %	100 %	0 %	0 %	289065080
12	NC_013823	CTAT	3	28843	28854	12	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_013823	A	18	29195	29212	18	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013823	ATA	4	34219	34230	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013823	AATAA	3	38402	38416	15	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013823	TA	8	48857	48872	16	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013823	TA	6	49417	49428	12	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013823	TA	7	49470	49483	14	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013823	T	12	49772	49783	12	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013823	AT	6	49866	49877	12	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013823	A	12	50264	50275	12	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013823	AAAT	4	50337	50352	16	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013823	TTTA	3	60687	60698	12	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013823	AGAA	3	60700	60711	12	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013823	A	13	60782	60794	13	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013823	AGAA	3	63151	63162	12	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013823	TTAT	3	63337	63348	12	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013823	TA	6	63454	63465	12	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013823	TA	9	63467	63484	18	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013823	TA	7	63495	63508	14	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013823	AATG	3	66272	66283	12	50 %	25 %	25 %	0 %	289065101
32	NC_013823	T	12	68106	68117	12	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013823	T	13	71797	71809	13	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013823	TTC	4	72587	72598	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_013823	A	12	76373	76384	12	100 %	0 %	0 %	0 %	289065113
36	NC_013823	TAT	5	76595	76609	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289065113
37	NC_013823	T	14	84655	84668	14	0 %	100 %	0 %	0 %	289065113
38	NC_013823	T	14	85765	85778	14	0 %	100 %	0 %	0 %	289065113
39	NC_013823	TTCT	3	87602	87613	12	0 %	75 %	0 %	25 %	289065113
40	NC_013823	AT	6	89203	89214	12	50 %	50 %	0 %	0 %	289065113
41	NC_013823	AGGT	3	111984	111995	12	25 %	25 %	50 %	0 %	289065148
42	NC_013823	AT	6	118807	118818	12	50 %	50 %	0 %	0 %	289065148
43	NC_013823	AAT	4	123593	123604	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289065148
44	NC_013823	TAT	4	123829	123840	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289065148
45	NC_013823	T	13	125089	125101	13	0 %	100 %	0 %	0 %	289065148
46	NC_013823	TTAA	3	130166	130177	12	50 %	50 %	0 %	0 %	289065148
47	NC_013823	TAAT	3	130180	130191	12	50 %	50 %	0 %	0 %	289065148
48	NC_013823	TAAT	3	130195	130206	12	50 %	50 %	0 %	0 %	289065148
49	NC_013823	T	12	131003	131014	12	0 %	100 %	0 %	0 %	289065148
50	NC_013823	T	13	131150	131162	13	0 %	100 %	0 %	0 %	289065148
51	NC_013823	GATT	3	131370	131381	12	25 %	50 %	25 %	0 %	289065148
52	NC_013823	CTAC	3	138717	138728	12	25 %	25 %	0 %	50 %	289065148
53	NC_013823	AT	6	161500	161511	12	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Perfect Repeats of Typha latifolia chloroplast