ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Syngamus trachea mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_013821	AAAT	3	10	20	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	288903285
2	NC_013821	GTTT	3	567	578	12	0 %	75 %	25 %	0 %	0 %	288903285
3	NC_013821	TTTA	4	1052	1067	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	288903285
4	NC_013821	TTAT	4	1938	1953	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	288903286
5	NC_013821	ATT	4	1960	1971	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	288903286
6	NC_013821	TAT	5	2068	2081	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	288903286
7	NC_013821	TTTTG	3	2653	2666	14	0 %	80 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
8	NC_013821	TTTA	3	3207	3218	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_013821	ATT	4	4813	4824	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	288903288
10	NC_013821	TAT	4	4933	4943	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	288903288
11	NC_013821	ATTT	3	5002	5013	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	288903288
12	NC_013821	CTTT	3	5411	5422	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	288903288
13	NC_013821	TTTATA	3	5873	5890	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	288903288
14	NC_013821	TAT	5	5906	5920	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	288903288
15	NC_013821	AT	12	6224	6248	25	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_013821	AT	6	6377	6387	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_013821	AT	7	6407	6420	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
18	NC_013821	AT	6	6478	6488	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_013821	AT	7	6508	6521	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
20	NC_013821	AT	6	6579	6589	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_013821	AT	7	6609	6622	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
22	NC_013821	GGTATT	3	6755	6773	19	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	10 %	Non-Coding
23	NC_013821	TA	6	6811	6822	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_013821	TTTAG	3	6890	6904	15	20 %	60 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
25	NC_013821	TTTTAT	3	7427	7444	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	288903290
26	NC_013821	AT	6	8213	8224	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_013821	TTTA	3	9339	9349	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	288903291
28	NC_013821	ATA	4	9398	9410	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	288903291
29	NC_013821	TAT	4	9455	9465	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	288903291
30	NC_013821	TTTA	3	9466	9477	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	288903291
31	NC_013821	TTTA	3	9494	9504	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	288903292
32	NC_013821	AT	7	9534	9546	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	288903292
33	NC_013821	ATT	4	10408	10418	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	288903293
34	NC_013821	TTTG	3	11592	11603	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	288903294
35	NC_013821	GTTTT	3	11849	11863	15	0 %	80 %	20 %	0 %	6 %	288903294
36	NC_013821	TTTA	3	12379	12389	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	288903294
37	NC_013821	TTTA	3	12412	12423	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	288903294
38	NC_013821	ATTT	3	12636	12648	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	288903295
39	NC_013821	ATTT	3	13065	13075	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	288903295
40	NC_013821	GTTT	3	13221	13232	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	288903295
41	NC_013821	TTAG	3	13521	13532	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	288903296
42	NC_013821	TTTA	3	13836	13846	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	288903296
43	NC_013821	TAA	5	14461	14475	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	288903296

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Syngamus trachea mitochondrion