ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Strongylus vulgaris mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_013818	TA	6	3	13	11	50 %	50 %	0 %	9 %	294368068
2	NC_013818	AT	6	890	900	11	50 %	50 %	0 %	9 %	294368068
3	NC_013818	TGT	4	1029	1039	11	0 %	66.67 %	33.33 %	9 %	294368068
4	NC_013818	ATTT	4	1050	1065	16	25 %	75 %	0 %	6 %	294368068
5	NC_013818	ATAAG	3	1645	1659	15	60 %	20 %	20 %	6 %	Non-Coding
6	NC_013818	TAGA	3	1876	1887	12	50 %	25 %	25 %	8 %	294368069
7	NC_013818	ATT	4	1971	1981	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	294368069
8	NC_013818	TG	6	2019	2029	11	0 %	50 %	50 %	9 %	294368069
9	NC_013818	TAT	5	2076	2089	14	33.33 %	66.67 %	0 %	7 %	294368069
10	NC_013818	TTTA	3	2533	2545	13	25 %	75 %	0 %	7 %	Non-Coding
11	NC_013818	TTTA	3	2588	2599	12	25 %	75 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_013818	TATTTT	3	2809	2826	18	16.67 %	83.33 %	0 %	5 %	Non-Coding
13	NC_013818	TAATA	3	2945	2959	15	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013818	TTTA	3	3128	3138	11	25 %	75 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_013818	ATG	4	3866	3876	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	294368070
16	NC_013818	TTTAT	3	4063	4077	15	20 %	80 %	0 %	6 %	294368071
17	NC_013818	ATT	5	4146	4159	14	33.33 %	66.67 %	0 %	7 %	294368071
18	NC_013818	TTATA	3	4188	4202	15	40 %	60 %	0 %	6 %	294368071
19	NC_013818	TTTA	3	4754	4765	12	25 %	75 %	0 %	8 %	294368071
20	NC_013818	TATT	3	4971	4981	11	25 %	75 %	0 %	9 %	294368071
21	NC_013818	TA	7	5652	5666	15	50 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
22	NC_013818	TGAT	3	5762	5773	12	25 %	50 %	25 %	8 %	Non-Coding
23	NC_013818	TA	6	5839	5849	11	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
24	NC_013818	TTGGT	3	5919	5933	15	0 %	60 %	40 %	6 %	Non-Coding
25	NC_013818	TATT	3	5949	5961	13	25 %	75 %	0 %	7 %	Non-Coding
26	NC_013818	ATTTT	3	6033	6046	14	20 %	80 %	0 %	7 %	Non-Coding
27	NC_013818	AGTTTT	3	6139	6156	18	16.67 %	66.67 %	16.67 %	5 %	294368072
28	NC_013818	TTAT	3	6378	6389	12	25 %	75 %	0 %	8 %	294368072
29	NC_013818	TTTTAT	3	6654	6671	18	16.67 %	83.33 %	0 %	5 %	294368073
30	NC_013818	GGTA	3	6792	6802	11	25 %	25 %	50 %	9 %	294368073
31	NC_013818	TTG	4	7859	7871	13	0 %	66.67 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
32	NC_013818	TAT	4	8759	8770	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	294368074
33	NC_013818	TAT	5	8862	8876	15	33.33 %	66.67 %	0 %	6 %	294368074
34	NC_013818	ATA	4	8911	8922	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	294368074
35	NC_013818	TTTTAT	3	8962	8980	19	16.67 %	83.33 %	0 %	5 %	294368074
36	NC_013818	ATGT	3	9050	9061	12	25 %	50 %	25 %	8 %	294368075
37	NC_013818	ATATT	3	9078	9091	14	40 %	60 %	0 %	7 %	294368075
38	NC_013818	TTTA	3	9600	9612	13	25 %	75 %	0 %	7 %	294368075
39	NC_013818	TTTATT	3	10632	10650	19	16.67 %	83.33 %	0 %	10 %	294368076
40	NC_013818	T	18	11190	11207	18	0 %	100 %	0 %	5 %	294368077
41	NC_013818	GTTTT	3	11454	11467	14	0 %	80 %	20 %	7 %	294368077
42	NC_013818	TTA	4	11491	11502	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	294368077
43	NC_013818	TTAT	3	12115	12127	13	25 %	75 %	0 %	7 %	294368078
44	NC_013818	ATTT	3	12689	12699	11	25 %	75 %	0 %	9 %	294368078
45	NC_013818	TTA	4	13025	13035	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	294368079
46	NC_013818	TA	6	13223	13234	12	50 %	50 %	0 %	8 %	294368079
47	NC_013818	TTTA	3	13463	13473	11	25 %	75 %	0 %	9 %	294368079
48	NC_013818	TAT	4	13715	13726	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	294368079
49	NC_013818	TAT	4	13965	13976	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	294368079
50	NC_013818	GTTA	3	13990	14001	12	25 %	50 %	25 %	8 %	294368079
51	NC_013818	TTA	4	14087	14098	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	294368079

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Strongylus vulgaris mitochondrion