ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Oesophagostomum dentatum mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_013817	TTG	4	1030	1041	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	288903231
2	NC_013817	TTTA	4	1051	1066	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	288903231
3	NC_013817	TTTATT	3	1413	1430	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	288903231
4	NC_013817	TAT	5	2080	2093	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	288903232
5	NC_013817	TTTA	3	2528	2540	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
6	NC_013817	ATTT	3	2666	2676	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_013817	TAA	4	3143	3154	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_013817	TAT	4	3157	3168	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_013817	TTA	4	3468	3479	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_013817	ATT	4	3944	3956	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
11	NC_013817	TAT	6	4000	4018	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	288903234
12	NC_013817	ATT	5	4186	4199	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	288903234
13	NC_013817	ATTT	3	4375	4386	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	288903234
14	NC_013817	TTAT	3	4405	4415	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	288903234
15	NC_013817	TAT	5	4462	4476	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	288903234
16	NC_013817	TAAAT	3	4613	4628	16	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	288903234
17	NC_013817	TA	6	5604	5614	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_013817	TA	6	5628	5640	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
19	NC_013817	TA	7	5792	5805	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
20	NC_013817	AT	9	5808	5824	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
21	NC_013817	TTTAG	3	5930	5944	15	20 %	60 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
22	NC_013817	AGTTTT	3	5974	5991	18	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	5 %	288903235
23	NC_013817	TTTTAT	3	6468	6485	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	288903236
24	NC_013817	GTA	4	6593	6603	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	288903236
25	NC_013817	TA	6	7016	7027	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_013817	AT	6	7258	7269	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_013817	AATTT	3	7612	7626	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
28	NC_013817	GTGC	3	8183	8195	13	0 %	25 %	50 %	25 %	7 %	288903237
29	NC_013817	TTA	4	8534	8545	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	288903237
30	NC_013817	ATA	4	8581	8592	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	288903237
31	NC_013817	ATTT	5	8619	8639	21	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	288903237
32	NC_013817	TTTA	3	9239	9251	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	288903238
33	NC_013817	TTA	4	9641	9652	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	288903239
34	NC_013817	ATTT	3	9900	9911	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	288903239
35	NC_013817	TAAA	3	10246	10258	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	288903239
36	NC_013817	ATT	4	10323	10333	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
37	NC_013817	TTTA	3	10807	10818	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	288903240
38	NC_013817	GTTTT	3	11064	11078	15	0 %	80 %	20 %	0 %	6 %	288903240
39	NC_013817	TAT	4	12103	12113	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	288903241
40	NC_013817	ATTT	3	12281	12291	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	288903241
41	NC_013817	TATTTG	3	12444	12461	18	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	5 %	288903241
42	NC_013817	TTCTT	3	12929	12943	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	288903242
43	NC_013817	ATTT	3	13817	13827	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Oesophagostomum dentatum mitochondrion