ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Metastrongylus salmi mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_013815	TA	6	3	13	11	50 %	50 %	0 %	9 %	288903218
2	NC_013815	GTTT	3	566	577	12	0 %	75 %	25 %	0 %	288903218
3	NC_013815	TGT	4	1029	1039	11	0 %	66.67 %	33.33 %	9 %	288903218
4	NC_013815	ATTA	3	1831	1842	12	50 %	50 %	0 %	0 %	288903219
5	NC_013815	GTTTTT	3	1934	1951	18	0 %	83.33 %	16.67 %	5 %	288903219
6	NC_013815	TAT	4	2088	2098	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	288903219
7	NC_013815	AAGA	3	2647	2658	12	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
8	NC_013815	ATT	4	2674	2685	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_013815	AATT	3	2699	2709	11	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_013815	TGTTTT	3	2734	2752	19	0 %	83.33 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
11	NC_013815	ATTTT	3	3113	3127	15	20 %	80 %	0 %	6 %	Non-Coding
12	NC_013815	TTTA	3	3613	3623	11	25 %	75 %	0 %	9 %	288903220
13	NC_013815	T	25	3808	3832	25	0 %	100 %	0 %	8 %	288903220
14	NC_013815	GTT	4	3830	3842	13	0 %	66.67 %	33.33 %	7 %	288903220
15	NC_013815	T	12	3928	3939	12	0 %	100 %	0 %	0 %	288903221
16	NC_013815	T	13	3982	3994	13	0 %	100 %	0 %	0 %	288903221
17	NC_013815	GTT	4	4055	4065	11	0 %	66.67 %	33.33 %	9 %	288903221
18	NC_013815	TGG	4	4834	4845	12	0 %	33.33 %	66.67 %	8 %	288903221
19	NC_013815	T	17	4974	4990	17	0 %	100 %	0 %	5 %	288903221
20	NC_013815	TTTA	3	5610	5620	11	25 %	75 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_013815	AAAT	3	5710	5722	13	75 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
22	NC_013815	ATTT	3	5795	5807	13	25 %	75 %	0 %	7 %	Non-Coding
23	NC_013815	TTATT	4	6093	6113	21	20 %	80 %	0 %	9 %	288903222
24	NC_013815	TTG	4	6227	6238	12	0 %	66.67 %	33.33 %	8 %	288903222
25	NC_013815	T	14	6387	6400	14	0 %	100 %	0 %	7 %	288903223
26	NC_013815	TTTTAT	3	6433	6450	18	16.67 %	83.33 %	0 %	5 %	288903223
27	NC_013815	T	14	6515	6528	14	0 %	100 %	0 %	7 %	288903223
28	NC_013815	TTTA	3	6776	6788	13	25 %	75 %	0 %	7 %	Non-Coding
29	NC_013815	AT	6	7191	7202	12	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_013815	TAT	4	7263	7274	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
31	NC_013815	TTGA	3	7490	7500	11	25 %	50 %	25 %	9 %	Non-Coding
32	NC_013815	TTTA	4	8456	8471	16	25 %	75 %	0 %	6 %	288903224
33	NC_013815	T	25	8548	8572	25	0 %	100 %	0 %	8 %	288903224
34	NC_013815	TTTGTT	4	8631	8654	24	0 %	83.33 %	16.67 %	8 %	288903225
35	NC_013815	GTTTT	4	8785	8805	21	0 %	80 %	20 %	9 %	288903225
36	NC_013815	ATGA	3	9197	9207	11	50 %	25 %	25 %	9 %	288903225
37	NC_013815	GTTAA	3	9221	9235	15	40 %	40 %	20 %	6 %	Non-Coding
38	NC_013815	ATTT	3	9380	9391	12	25 %	75 %	0 %	8 %	288903226
39	NC_013815	TTTG	3	9580	9590	11	0 %	75 %	25 %	9 %	288903226
40	NC_013815	ATG	4	9611	9622	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	288903226
41	NC_013815	GTTT	4	9777	9792	16	0 %	75 %	25 %	6 %	288903226
42	NC_013815	T	13	9897	9909	13	0 %	100 %	0 %	7 %	288903226
43	NC_013815	TTG	4	10221	10232	12	0 %	66.67 %	33.33 %	8 %	288903226
44	NC_013815	TTTG	3	10747	10758	12	0 %	75 %	25 %	8 %	288903227
45	NC_013815	TATTT	3	10824	10838	15	20 %	80 %	0 %	6 %	288903227
46	NC_013815	T	15	11769	11783	15	0 %	100 %	0 %	6 %	288903228
47	NC_013815	ATTTT	3	11890	11903	14	20 %	80 %	0 %	7 %	288903228
48	NC_013815	ATTT	3	12220	12230	11	25 %	75 %	0 %	9 %	288903228
49	NC_013815	TTTGGG	3	12330	12348	19	0 %	50 %	50 %	10 %	288903228
50	NC_013815	T	15	12715	12729	15	0 %	100 %	0 %	6 %	288903229
51	NC_013815	ATT	4	13690	13700	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	288903229

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Metastrongylus salmi mitochondrion