ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Candida viswanathii mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_013809	CTA	4	69	80	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
2	NC_013809	TA	6	467	477	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_013809	TA	7	545	557	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
4	NC_013809	AGTA	3	717	727	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_013809	TAA	5	871	885	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
6	NC_013809	GCTTCA	3	990	1008	19	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	10 %	Non-Coding
7	NC_013809	TATT	3	1257	1268	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013809	ATATTT	3	1579	1595	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
9	NC_013809	TTATA	4	1949	1967	19	40 %	60 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
10	NC_013809	TTA	4	1968	1979	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_013809	TAT	4	2088	2099	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_013809	TA	6	2102	2115	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
13	NC_013809	TTA	4	2128	2138	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
14	NC_013809	TTAT	3	2256	2266	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_013809	TA	7	2688	2700	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
16	NC_013809	TA	6	2722	2732	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_013809	TA	6	2782	2792	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_013809	TA	6	2808	2821	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
19	NC_013809	TA	6	2929	2940	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_013809	TAT	4	2946	2958	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
21	NC_013809	TAT	5	2966	2979	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
22	NC_013809	AT	7	3005	3019	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
23	NC_013809	AAT	4	3045	3055	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
24	NC_013809	TAAC	3	3056	3066	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
25	NC_013809	TAA	4	3109	3121	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
26	NC_013809	AT	7	3281	3293	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
27	NC_013809	AT	11	3597	3618	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_013809	TTA	4	3691	3702	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
29	NC_013809	ATA	5	3731	3746	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
30	NC_013809	AT	6	3749	3761	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
31	NC_013809	TTAA	3	3882	3892	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
32	NC_013809	ATA	5	3903	3916	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
33	NC_013809	TATAA	4	4082	4101	20	60 %	40 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
34	NC_013809	ATTA	4	4186	4201	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
35	NC_013809	AT	6	4238	4248	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
36	NC_013809	AT	7	4281	4293	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
37	NC_013809	TAT	4	4400	4411	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013809	TTAA	3	4428	4439	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
39	NC_013809	TA	6	4548	4561	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
40	NC_013809	AT	7	4597	4609	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
41	NC_013809	TA	8	4686	4700	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
42	NC_013809	ATA	4	4749	4759	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_013809	CTTA	3	5133	5144	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
44	NC_013809	AT	6	5191	5201	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
45	NC_013809	AT	9	5341	5357	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
46	NC_013809	TAA	6	5470	5488	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
47	NC_013809	AT	7	5491	5503	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
48	NC_013809	ATT	4	5685	5696	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
49	NC_013809	TTA	4	6146	6157	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
50	NC_013809	TAA	5	6185	6199	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
51	NC_013809	TAT	4	6351	6362	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_013809	AT	13	6401	6424	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
53	NC_013809	TA	7	6432	6444	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
54	NC_013809	AT	8	7012	7027	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
55	NC_013809	ATA	4	7165	7176	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
56	NC_013809	AT	6	7312	7324	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
57	NC_013809	TAA	4	7831	7842	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
58	NC_013809	TA	6	7843	7853	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
59	NC_013809	AT	6	7915	7926	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
60	NC_013809	TCTA	3	8427	8437	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
61	NC_013809	TAT	4	8600	8610	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
62	NC_013809	ACTT	3	8808	8819	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
63	NC_013809	TAT	5	8839	8852	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
64	NC_013809	TA	6	8955	8965	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
65	NC_013809	AGAT	3	9152	9162	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	28890090
66	NC_013809	TAT	4	9229	9240	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	28890090
67	NC_013809	TTA	4	9256	9266	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	28890090
68	NC_013809	TA	8	9732	9748	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	28890090
69	NC_013809	TATT	3	10009	10020	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	28890090
70	NC_013809	TTA	4	10124	10135	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	28890090
71	NC_013809	TAT	4	10311	10325	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	28890090
72	NC_013809	ATT	4	10394	10405	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	28890090
73	NC_013809	ATT	4	10830	10840	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	28890090
74	NC_013809	TAG	4	11030	11041	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	28890090
75	NC_013809	AATT	3	11212	11223	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	28890090
76	NC_013809	AT	6	11283	11293	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	28890090
77	NC_013809	ACAT	3	11405	11415	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
78	NC_013809	AT	6	12130	12141	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
79	NC_013809	AT	7	12192	12205	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
80	NC_013809	TATT	3	12224	12235	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
81	NC_013809	TA	6	12251	12261	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
82	NC_013809	TA	7	12265	12278	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
83	NC_013809	ATT	4	12709	12721	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
84	NC_013809	TA	6	13523	13535	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	28890090
85	NC_013809	TAT	5	13966	13979	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
86	NC_013809	TAA	4	13985	13997	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
87	NC_013809	TA	6	14026	14036	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
88	NC_013809	TATC	3	14322	14332	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
89	NC_013809	AT	6	14401	14411	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
90	NC_013809	TAT	5	14787	14804	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
91	NC_013809	TAT	22	14964	15026	63	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
92	NC_013809	ATT	4	15047	15061	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
93	NC_013809	AG	6	15093	15103	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
94	NC_013809	AT	6	15221	15231	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
95	NC_013809	ATT	4	15402	15413	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
96	NC_013809	TA	6	15998	16008	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	28890090
97	NC_013809	ATA	4	16124	16134	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	28890090
98	NC_013809	TAA	4	16302	16313	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	28890090
99	NC_013809	TAT	7	17369	17389	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	28890090
100	NC_013809	ATT	4	17412	17423	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	28890090
101	NC_013809	TAAAA	4	17790	17809	20	80 %	20 %	0 %	0 %	5 %	28890090
102	NC_013809	AT	12	17902	17924	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	28890090
103	NC_013809	ATTAT	3	18427	18441	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	28890090
104	NC_013809	AT	6	18515	18525	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	28890090
105	NC_013809	TAAA	3	19043	19054	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	28890090
106	NC_013809	TTA	4	19483	19494	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	28890090
107	NC_013809	TAA	4	19955	19966	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
108	NC_013809	TA	6	20082	20093	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
109	NC_013809	ATC	4	20180	20191	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
110	NC_013809	AAG	4	20274	20286	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
111	NC_013809	T	14	20343	20356	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
112	NC_013809	TA	23	20388	20433	46	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
113	NC_013809	TTTA	3	20527	20538	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
114	NC_013809	ATT	4	23178	23189	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	28890091
115	NC_013809	TTA	4	24154	24164	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	28890091
116	NC_013809	AT	6	24317	24327	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	28890091
117	NC_013809	AG	6	24343	24355	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
118	NC_013809	TTC	4	24409	24421	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
119	NC_013809	TAA	4	24794	24804	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
120	NC_013809	TA	6	24806	24820	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
121	NC_013809	ATA	4	25074	25084	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
122	NC_013809	ATAA	3	25143	25153	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
123	NC_013809	AATT	4	25353	25367	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
124	NC_013809	AAT	4	25607	25617	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
125	NC_013809	ATT	4	25616	25627	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
126	NC_013809	TA	6	25886	25896	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
127	NC_013809	TAAT	3	26098	26108	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
128	NC_013809	TTAA	3	26115	26126	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
129	NC_013809	AAAT	5	26140	26159	20	75 %	25 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
130	NC_013809	ATAA	4	26665	26679	15	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
131	NC_013809	TTA	4	26905	26915	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	28890091
132	NC_013809	TTTA	3	26951	26962	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
133	NC_013809	AT	6	27006	27017	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
134	NC_013809	AGCTTT	3	27262	27279	18	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	0 %	28890091
135	NC_013809	TTTA	3	27406	27417	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	28890091
136	NC_013809	TAT	4	27654	27665	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	28890091
137	NC_013809	ATA	5	27735	27748	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	28890091
138	NC_013809	ATTT	3	27895	27906	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	28890091
139	NC_013809	TAT	4	28345	28355	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	28890091
140	NC_013809	ATTAT	3	28815	28828	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	28890091
141	NC_013809	AT	13	29067	29092	26	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
142	NC_013809	AT	7	29341	29354	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
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195	NC_013809	ATATA	3	37262	37276	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
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197	NC_013809	TA	7	37341	37353	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
198	NC_013809	TAA	4	37430	37440	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
199	NC_013809	TAAA	3	37713	37723	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
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207	NC_013809	TGAAGC	3	39033	39051	19	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
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ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Candida viswanathii mitochondrion