ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Cylicocyclus insignis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_013808	TA	6	3	13	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	288900706
2	NC_013808	TGT	4	1957	1969	13	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	288900707
3	NC_013808	TTAT	3	1970	1981	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	288900707
4	NC_013808	ATT	4	1987	1997	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	288900707
5	NC_013808	AATT	3	3216	3226	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_013808	TTTAA	3	3419	3432	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
7	NC_013808	TTAA	3	3904	3915	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	288900709
8	NC_013808	TAATTA	4	3951	3974	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	288900709
9	NC_013808	ATT	4	3994	4005	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	288900709
10	NC_013808	TTTAT	3	4054	4068	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	288900709
11	NC_013808	ATT	5	4137	4150	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	288900709
12	NC_013808	ATTT	3	4326	4337	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	288900709
13	NC_013808	TTA	5	4412	4426	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	288900709
14	NC_013808	GTTC	3	4503	4514	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	288900709
15	NC_013808	TTTA	3	4745	4756	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	288900709
16	NC_013808	TTA	4	5457	5467	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	288900709
17	NC_013808	TATTT	3	5469	5482	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	288900709
18	NC_013808	AT	13	5595	5618	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_013808	TTA	4	5667	5679	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
20	NC_013808	AT	9	5787	5803	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
21	NC_013808	TTTAG	3	5910	5924	15	20 %	60 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
22	NC_013808	TATT	3	6112	6123	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	288900710
23	NC_013808	ATA	4	6246	6256	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	288900710
24	NC_013808	TTTTAT	3	6486	6503	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	288900711
25	NC_013808	TTTTAA	3	7008	7025	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
26	NC_013808	AT	6	7309	7320	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_013808	GTTT	3	7537	7547	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_013808	TTTTG	4	8336	8354	19	0 %	80 %	20 %	0 %	10 %	288900712
29	NC_013808	AAT	4	8492	8503	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	288900712
30	NC_013808	TTTA	3	9151	9163	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	288900713
31	NC_013808	TATT	3	9467	9478	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	288900714
32	NC_013808	TTA	4	9567	9578	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	288900714
33	NC_013808	TGTTAA	3	9925	9942	18	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	5 %	288900714
34	NC_013808	TTAT	3	11678	11690	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	288900716
35	NC_013808	TAAG	3	12130	12140	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	288900716
36	NC_013808	ATTT	3	12255	12265	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	288900716
37	NC_013808	GTTT	3	12411	12422	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	288900716
38	NC_013808	TATTT	4	12555	12573	19	20 %	80 %	0 %	0 %	5 %	288900717
39	NC_013808	TTAA	3	12713	12724	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	288900717
40	NC_013808	TATT	4	12913	12928	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	288900717
41	NC_013808	TTTA	3	13028	13038	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	288900717
42	NC_013808	TAGT	3	13550	13560	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	288900717
43	NC_013808	AAT	4	13657	13668	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	288900717

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Cylicocyclus insignis mitochondrion