ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Trichostrongylus vitrinus mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_013807	TTA	4	601	612	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	288900693
2	NC_013807	TAA	4	2781	2792	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_013807	TAA	5	2890	2904	15	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
4	NC_013807	ATA	4	2943	2956	14	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
5	NC_013807	ATG	4	3861	3871	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	288900695
6	NC_013807	ATT	5	4142	4155	14	33.33 %	66.67 %	0 %	7 %	288900696
7	NC_013807	TAT	4	4262	4272	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	288900696
8	NC_013807	TTA	4	5230	5242	13	33.33 %	66.67 %	0 %	7 %	288900696
9	NC_013807	TAT	4	5734	5747	14	33.33 %	66.67 %	0 %	7 %	Non-Coding
10	NC_013807	TTA	4	6215	6225	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	288900697
11	NC_013807	ATT	4	6227	6238	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	288900697
12	NC_013807	ATT	4	6526	6537	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	288900698
13	NC_013807	GTA	4	6681	6691	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	288900698
14	NC_013807	TAA	4	6818	6828	11	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_013807	ATA	4	7340	7350	11	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_013807	TAA	4	7801	7812	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	288900699
17	NC_013807	ATT	4	8081	8092	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	288900699
18	NC_013807	AAT	4	8492	8503	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	288900699
19	NC_013807	ATA	4	8565	8577	13	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	288900699
20	NC_013807	ATT	4	9806	9819	14	33.33 %	66.67 %	0 %	7 %	288900701
21	NC_013807	TAA	4	9855	9865	11	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	288900701
22	NC_013807	TAT	4	10137	10150	14	33.33 %	66.67 %	0 %	7 %	288900701
23	NC_013807	ATT	4	11223	11234	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	288900702
24	NC_013807	TTG	4	12415	12426	12	0 %	66.67 %	33.33 %	8 %	288900703
25	NC_013807	TAT	4	13294	13305	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	288900704
26	NC_013807	ATA	5	13311	13325	15	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	288900704
27	NC_013807	TAA	5	13342	13356	15	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	288900704

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Trichostrongylus vitrinus mitochondrion