ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tetra-nucleotide Imperfect Repeats of Phaeoceros laevis mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_013765	TTTA	3	39	50	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	28479473
2	NC_013765	GGTA	3	2328	2339	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	28479473
3	NC_013765	TTTC	3	4650	4661	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	28479473
4	NC_013765	AAAT	3	6554	6565	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	28479473
5	NC_013765	AATA	3	6608	6619	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	28479473
6	NC_013765	TTTA	3	8582	8592	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	28479473
7	NC_013765	CTAT	3	9995	10007	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	28479473
8	NC_013765	GAAA	3	14143	14154	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	28479473
9	NC_013765	TAAA	3	14544	14554	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	28479473
10	NC_013765	GGCC	3	17762	17773	12	0 %	0 %	50 %	50 %	0 %	28479473
11	NC_013765	TTAT	3	18674	18684	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	28479473
12	NC_013765	TAAG	3	21823	21835	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	28479473
13	NC_013765	AGAT	3	24598	24609	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	28479473
14	NC_013765	AATG	3	24886	24897	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	28479473
15	NC_013765	AGCA	3	25602	25613	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	28479473
16	NC_013765	CCAA	3	26019	26029	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	28479473
17	NC_013765	GAAT	3	26610	26621	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	28479473
18	NC_013765	GGCC	3	31189	31199	11	0 %	0 %	50 %	50 %	9 %	28479473
19	NC_013765	TAGA	3	31897	31907	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	28479473
20	NC_013765	GGCC	3	34490	34500	11	0 %	0 %	50 %	50 %	9 %	28479473
21	NC_013765	AACA	4	34760	34774	15	75 %	0 %	0 %	25 %	6 %	28479473
22	NC_013765	TCGC	3	35965	35975	11	0 %	25 %	25 %	50 %	9 %	28479473
23	NC_013765	CCCG	3	38152	38162	11	0 %	0 %	25 %	75 %	9 %	28479473
24	NC_013765	ACAT	3	40047	40057	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	28479473
25	NC_013765	TTTA	3	40599	40610	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	28479473
26	NC_013765	TTGG	3	40753	40764	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	28479473
27	NC_013765	GAAA	3	44521	44532	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	28479473
28	NC_013765	AAGA	5	46863	46883	21	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	28479473
29	NC_013765	CGGC	3	49106	49117	12	0 %	0 %	50 %	50 %	0 %	28479473
30	NC_013765	AGAA	3	49778	49789	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	28479473
31	NC_013765	TCAT	3	53562	53572	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	28479473
32	NC_013765	TCCG	3	57660	57671	12	0 %	25 %	25 %	50 %	8 %	28479473
33	NC_013765	CTAG	3	57950	57961	12	25 %	25 %	25 %	25 %	0 %	28479473
34	NC_013765	AATA	3	58315	58325	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	28479473
35	NC_013765	AGGA	3	60868	60879	12	50 %	0 %	50 %	0 %	0 %	28479473
36	NC_013765	CTTC	4	62009	62023	15	0 %	50 %	0 %	50 %	6 %	28479473
37	NC_013765	CGAA	3	72196	72207	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	28479473
38	NC_013765	CTTT	3	73838	73849	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	28479473
39	NC_013765	AACC	3	76035	76046	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	28479473
40	NC_013765	TTTC	3	77129	77139	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	28479473
41	NC_013765	GAAG	3	77526	77537	12	50 %	0 %	50 %	0 %	0 %	28479473
42	NC_013765	AAGA	3	77786	77797	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	28479473
43	NC_013765	GGCT	3	78454	78464	11	0 %	25 %	50 %	25 %	9 %	28479473
44	NC_013765	AGGA	3	79400	79412	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	28479473
45	NC_013765	GGCC	3	80889	80899	11	0 %	0 %	50 %	50 %	9 %	28479473
46	NC_013765	AGCA	3	81369	81380	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	28479473
47	NC_013765	ATTT	3	83928	83938	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	28479473
48	NC_013765	CTTC	3	84250	84260	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	28479473
49	NC_013765	CGGC	3	84323	84334	12	0 %	0 %	50 %	50 %	0 %	28479473
50	NC_013765	TCCC	3	85898	85909	12	0 %	25 %	0 %	75 %	0 %	28479473
51	NC_013765	CCTT	4	90082	90096	15	0 %	50 %	0 %	50 %	6 %	28479473
52	NC_013765	CGAA	3	90634	90644	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	28479473
53	NC_013765	TACT	3	90950	90962	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	28479473
54	NC_013765	GGTC	4	91660	91674	15	0 %	25 %	50 %	25 %	6 %	28479473
55	NC_013765	CCTT	3	92376	92387	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	28479473
56	NC_013765	TGGC	3	92585	92597	13	0 %	25 %	50 %	25 %	7 %	28479473
57	NC_013765	TTTG	3	100055	100066	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	28479473
58	NC_013765	TACT	3	104076	104087	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	28479473
59	NC_013765	CTGT	3	105790	105800	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	28479473
60	NC_013765	CTTT	3	107597	107607	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	28479473
61	NC_013765	TTAC	3	108530	108540	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	28479473
62	NC_013765	CTTG	3	108619	108629	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	28479473
63	NC_013765	AAAT	3	117935	117946	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	28479473
64	NC_013765	AATT	3	118281	118291	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	28479473
65	NC_013765	GTAT	3	120475	120486	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	28479473
66	NC_013765	GCCG	3	121504	121514	11	0 %	0 %	50 %	50 %	9 %	28479473
67	NC_013765	GAAA	3	126938	126948	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	28479473
68	NC_013765	ATTA	3	127169	127180	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	28479473
69	NC_013765	TTAC	3	127696	127707	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	28479473
70	NC_013765	GGCC	4	129215	129229	15	0 %	0 %	50 %	50 %	6 %	28479473
71	NC_013765	AAAT	3	131007	131017	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	28479473
72	NC_013765	GAAG	3	131482	131493	12	50 %	0 %	50 %	0 %	0 %	28479473
73	NC_013765	CAAT	3	132339	132350	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	28479473
74	NC_013765	AAAC	3	133588	133598	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	28479473
75	NC_013765	TTCT	3	133983	133994	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	28479473
76	NC_013765	ACAA	3	134643	134653	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	28479473
77	NC_013765	GTGG	3	134966	134977	12	0 %	25 %	75 %	0 %	0 %	28479473
78	NC_013765	TCAT	3	136323	136334	12	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	28479473
79	NC_013765	CAAT	3	138576	138587	12	50 %	25 %	0 %	25 %	0 %	28479473
80	NC_013765	AAGG	3	139583	139593	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	28479473
81	NC_013765	TACC	4	140287	140302	16	25 %	25 %	0 %	50 %	6 %	28479473
82	NC_013765	TAGA	3	145313	145323	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	28479473
83	NC_013765	GCCT	3	153428	153439	12	0 %	25 %	25 %	50 %	8 %	28479473
84	NC_013765	AAGC	3	154514	154524	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	28479473
85	NC_013765	CTTT	3	155087	155097	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	28479473
86	NC_013765	CTTT	3	156749	156761	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	28479473
87	NC_013765	GATC	3	157682	157692	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	28479473
88	NC_013765	GAAA	3	158611	158621	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	28479473
89	NC_013765	AAAT	3	160686	160697	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	28479473
90	NC_013765	ACTC	3	167139	167149	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	28479473
91	NC_013765	CCTA	3	173877	173889	13	25 %	25 %	0 %	50 %	7 %	28479473
92	NC_013765	ATGC	3	177602	177612	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	28479473
93	NC_013765	AAAG	3	178393	178404	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	28479473
94	NC_013765	TTTC	3	179412	179422	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	28479473
95	NC_013765	GGCG	4	179956	179970	15	0 %	0 %	75 %	25 %	6 %	28479473
96	NC_013765	TTCA	3	181735	181745	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	28479473
97	NC_013765	AGAA	3	184311	184322	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	28479473
98	NC_013765	GGCC	3	185162	185172	11	0 %	0 %	50 %	50 %	9 %	28479473
99	NC_013765	TTAT	3	185591	185601	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	28479473
100	NC_013765	GTAT	3	188995	189005	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	28479473
101	NC_013765	ACGC	3	189281	189291	11	25 %	0 %	25 %	50 %	9 %	28479473
102	NC_013765	TTCT	3	189407	189418	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	28479473
103	NC_013765	AAAG	3	191372	191383	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	28479473
104	NC_013765	AATC	3	191562	191573	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	28479473
105	NC_013765	GGCC	3	192453	192463	11	0 %	0 %	50 %	50 %	9 %	28479473
106	NC_013765	ATAA	3	193103	193114	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	28479473
107	NC_013765	AGAA	3	193523	193534	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	28479473
108	NC_013765	ACTC	3	193725	193736	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	28479473
109	NC_013765	TATT	4	197455	197470	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	28479473
110	NC_013765	AAAC	3	198241	198252	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	28479473
111	NC_013765	AACC	3	198638	198650	13	50 %	0 %	0 %	50 %	7 %	28479473
112	NC_013765	AAAT	3	201910	201921	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	28479473
113	NC_013765	GGCC	3	206413	206423	11	0 %	0 %	50 %	50 %	9 %	28479473
114	NC_013765	TTAA	3	207635	207646	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	28479473
115	NC_013765	CTTT	3	208298	208309	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	28479473

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tetra-nucleotide Imperfect Repeats of Phaeoceros laevis mitochondrion