ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Phaeoceros laevis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_013765	TTTA	3	39	50	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	28479473
2	NC_013765	CGG	4	1361	1373	13	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	7 %	28479473
3	NC_013765	CTT	4	1914	1925	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	28479473
4	NC_013765	GGTA	3	2328	2339	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	28479473
5	NC_013765	ATC	4	2848	2858	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	28479473
6	NC_013765	TTC	4	3422	3432	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	28479473
7	NC_013765	TTTC	3	4650	4661	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	28479473
8	NC_013765	AAAT	3	6554	6565	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	28479473
9	NC_013765	AATA	3	6608	6619	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	28479473
10	NC_013765	G	12	7284	7295	12	0 %	0 %	100 %	0 %	8 %	28479473
11	NC_013765	TTTA	3	8582	8592	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	28479473
12	NC_013765	GCA	4	8884	8896	13	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	7 %	28479473
13	NC_013765	A	12	9411	9422	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	28479473
14	NC_013765	CTAT	3	9995	10007	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	28479473
15	NC_013765	CTC	4	10083	10095	13	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	7 %	28479473
16	NC_013765	GCC	4	10193	10205	13	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	7 %	28479473
17	NC_013765	TTTTGC	3	11018	11036	19	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	10 %	28479473
18	NC_013765	CTA	4	13910	13922	13	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	28479473
19	NC_013765	TTC	4	14065	14075	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	28479473
20	NC_013765	GAAA	3	14143	14154	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	28479473
21	NC_013765	TAAA	3	14544	14554	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	28479473
22	NC_013765	CG	6	15128	15138	11	0 %	0 %	50 %	50 %	9 %	28479473
23	NC_013765	CCG	4	15629	15641	13	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	7 %	28479473
24	NC_013765	GCG	4	15979	15990	12	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	8 %	28479473
25	NC_013765	AGA	4	16730	16740	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	28479473
26	NC_013765	GGCC	3	17762	17773	12	0 %	0 %	50 %	50 %	0 %	28479473
27	NC_013765	TTAT	3	18674	18684	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	28479473
28	NC_013765	CGC	4	19068	19079	12	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	8 %	28479473
29	NC_013765	TAT	5	21196	21209	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	28479473
30	NC_013765	GTG	4	21429	21439	11	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	28479473
31	NC_013765	TAAG	3	21823	21835	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	28479473
32	NC_013765	GTA	4	22372	22383	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	28479473
33	NC_013765	GAC	4	22540	22551	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	28479473
34	NC_013765	AGAT	3	24598	24609	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	28479473
35	NC_013765	AATG	3	24886	24897	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	28479473
36	NC_013765	AAG	4	25102	25113	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	28479473
37	NC_013765	AGCA	3	25602	25613	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	28479473
38	NC_013765	CCAA	3	26019	26029	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	28479473
39	NC_013765	GAAT	3	26610	26621	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	28479473
40	NC_013765	ACA	4	28850	28861	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	28479473
41	NC_013765	GGCC	3	31189	31199	11	0 %	0 %	50 %	50 %	9 %	28479473
42	NC_013765	TAGA	3	31897	31907	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	28479473
43	NC_013765	AG	7	34203	34215	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	28479473
44	NC_013765	GGCC	3	34490	34500	11	0 %	0 %	50 %	50 %	9 %	28479473
45	NC_013765	AACA	4	34760	34774	15	75 %	0 %	0 %	25 %	6 %	28479473
46	NC_013765	TCGC	3	35965	35975	11	0 %	25 %	25 %	50 %	9 %	28479473
47	NC_013765	CCT	4	37257	37267	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	28479473
48	NC_013765	AGA	4	38064	38075	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	0 %	28479473
49	NC_013765	CCCG	3	38152	38162	11	0 %	0 %	25 %	75 %	9 %	28479473
50	NC_013765	GA	6	39706	39716	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	28479473
51	NC_013765	ACAT	3	40047	40057	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	28479473
52	NC_013765	TTTA	3	40599	40610	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	28479473
53	NC_013765	TTGG	3	40753	40764	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	28479473
54	NC_013765	TA	6	43905	43915	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	28479473
55	NC_013765	GAAA	3	44521	44532	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	28479473
56	NC_013765	GA	6	44727	44737	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	28479473
57	NC_013765	AAGA	5	46863	46883	21	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	28479473
58	NC_013765	CGGC	3	49106	49117	12	0 %	0 %	50 %	50 %	0 %	28479473
59	NC_013765	AGAA	3	49778	49789	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	28479473
60	NC_013765	AAAGA	3	50077	50090	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	28479473
61	NC_013765	AGAAA	3	50125	50139	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	28479473
62	NC_013765	AGAAA	3	50171	50185	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	28479473
63	NC_013765	ATA	4	52876	52887	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	28479473
64	NC_013765	AAT	4	53495	53506	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	28479473
65	NC_013765	TCAT	3	53562	53572	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	28479473
66	NC_013765	TCCG	3	57660	57671	12	0 %	25 %	25 %	50 %	8 %	28479473
67	NC_013765	GCC	4	57764	57776	13	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	7 %	28479473
68	NC_013765	CTAG	3	57950	57961	12	25 %	25 %	25 %	25 %	0 %	28479473
69	NC_013765	AATA	3	58315	58325	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	28479473
70	NC_013765	CAT	4	58679	58691	13	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	28479473
71	NC_013765	CTT	4	59809	59819	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	28479473
72	NC_013765	CGG	4	60206	60218	13	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	7 %	28479473
73	NC_013765	TC	6	60224	60234	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	28479473
74	NC_013765	AGGA	3	60868	60879	12	50 %	0 %	50 %	0 %	0 %	28479473
75	NC_013765	CGT	5	61929	61943	15	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	6 %	28479473
76	NC_013765	CTTC	4	62009	62023	15	0 %	50 %	0 %	50 %	6 %	28479473
77	NC_013765	AGA	4	66985	66996	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	28479473
78	NC_013765	TAA	4	68260	68271	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	28479473
79	NC_013765	CGG	4	70238	70249	12	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	8 %	28479473
80	NC_013765	CAA	4	71163	71174	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	28479473
81	NC_013765	AAGAA	3	71477	71491	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	28479473
82	NC_013765	CGAA	3	72196	72207	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	28479473
83	NC_013765	C	18	72502	72519	18	0 %	0 %	0 %	100 %	5 %	28479473
84	NC_013765	AG	6	73124	73134	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	28479473
85	NC_013765	GTCTT	3	73576	73590	15	0 %	60 %	20 %	20 %	6 %	28479473
86	NC_013765	CTTT	3	73838	73849	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	28479473
87	NC_013765	AACC	3	76035	76046	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	28479473
88	NC_013765	CTT	4	76191	76201	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	28479473
89	NC_013765	TTTC	3	77129	77139	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	28479473
90	NC_013765	GAAG	3	77526	77537	12	50 %	0 %	50 %	0 %	0 %	28479473
91	NC_013765	AAGA	3	77786	77797	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	28479473
92	NC_013765	CTT	4	77851	77862	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	28479473
93	NC_013765	ACT	4	78410	78421	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	28479473
94	NC_013765	GGCT	3	78454	78464	11	0 %	25 %	50 %	25 %	9 %	28479473
95	NC_013765	AGGA	3	79400	79412	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	28479473
96	NC_013765	CTG	4	80574	80585	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	28479473
97	NC_013765	GGCC	3	80889	80899	11	0 %	0 %	50 %	50 %	9 %	28479473
98	NC_013765	AGCA	3	81369	81380	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	28479473
99	NC_013765	ATT	4	81498	81508	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	28479473
100	NC_013765	CG	6	81591	81601	11	0 %	0 %	50 %	50 %	9 %	28479473
101	NC_013765	CGC	4	81658	81669	12	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28479473
102	NC_013765	TTA	4	82284	82295	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	28479473
103	NC_013765	ATTT	3	83928	83938	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	28479473
104	NC_013765	CTTC	3	84250	84260	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	28479473
105	NC_013765	CGGC	3	84323	84334	12	0 %	0 %	50 %	50 %	0 %	28479473
106	NC_013765	CTG	4	84562	84572	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	28479473
107	NC_013765	TCCC	3	85898	85909	12	0 %	25 %	0 %	75 %	0 %	28479473
108	NC_013765	GGC	4	88220	88231	12	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28479473
109	NC_013765	CGC	4	88919	88930	12	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	8 %	28479473
110	NC_013765	AAG	4	89381	89392	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	28479473
111	NC_013765	TCT	4	89531	89541	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	28479473
112	NC_013765	GCTGTT	3	89764	89781	18	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	28479473
113	NC_013765	CCTT	4	90082	90096	15	0 %	50 %	0 %	50 %	6 %	28479473
114	NC_013765	CTT	4	90114	90125	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	28479473
115	NC_013765	CGC	4	90563	90573	11	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	9 %	28479473
116	NC_013765	CGAA	3	90634	90644	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	28479473
117	NC_013765	TACT	3	90950	90962	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	28479473
118	NC_013765	GCC	4	91307	91319	13	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	7 %	28479473
119	NC_013765	GCG	4	91334	91346	13	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	7 %	28479473
120	NC_013765	GGTC	4	91660	91674	15	0 %	25 %	50 %	25 %	6 %	28479473
121	NC_013765	CCTT	3	92376	92387	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	28479473
122	NC_013765	CCG	4	92415	92426	12	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	8 %	28479473
123	NC_013765	TGGC	3	92585	92597	13	0 %	25 %	50 %	25 %	7 %	28479473
124	NC_013765	C	20	92720	92739	20	0 %	0 %	0 %	100 %	5 %	28479473
125	NC_013765	CCG	4	92743	92754	12	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28479473
126	NC_013765	CCG	4	94617	94629	13	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	7 %	28479473
127	NC_013765	ATC	4	94777	94787	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	28479473
128	NC_013765	GAG	4	95555	95567	13	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	7 %	28479473
129	NC_013765	G	44	96980	97023	44	0 %	0 %	100 %	0 %	6 %	28479473
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285	NC_013765	ATAGA	3	209100	209114	15	60 %	20 %	20 %	0 %	0 %	28479473

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Phaeoceros laevis mitochondrion