ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Olea europaea chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_013707	AGT	4	399	410	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_013707	AAG	4	3010	3021	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	36582331
3	NC_013707	GAA	4	3040	3051	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	36582331
4	NC_013707	GTT	4	5140	5150	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_013707	CAA	4	9750	9761	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
6	NC_013707	CAA	4	29773	29784	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
7	NC_013707	TTG	4	36457	36467	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	36582331
8	NC_013707	TTC	4	36902	36913	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	36582331
9	NC_013707	TAA	4	38066	38076	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_013707	GAT	4	40439	40450	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	28379496
11	NC_013707	GCA	4	42338	42349	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	28379496
12	NC_013707	TAA	4	44031	44041	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_013707	GTA	4	46416	46426	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
14	NC_013707	GTT	4	46627	46637	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_013707	TAT	4	48196	48208	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
16	NC_013707	TTA	4	52792	52803	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_013707	AGA	4	53012	53023	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
18	NC_013707	TTA	4	53599	53610	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_013707	ATA	4	56544	56554	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	28379497
20	NC_013707	TTA	4	59310	59322	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
21	NC_013707	TAA	4	61509	61521	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
22	NC_013707	ATA	4	69361	69372	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_013707	TTG	4	70950	70960	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
24	NC_013707	ATT	4	74673	74683	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_013707	TCT	4	76446	76457	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	28379499
26	NC_013707	TTC	4	85135	85146	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	28379500
27	NC_013707	GAT	4	87168	87178	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	28379500
28	NC_013707	GAT	4	88550	88560	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_013707	GAT	4	91580	91591	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	28379501
30	NC_013707	TGA	4	93274	93285	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	28379501
31	NC_013707	TTC	4	101113	101124	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
32	NC_013707	AGA	4	112361	112371	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	28379501
33	NC_013707	TAA	4	113451	113462	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	36582332
34	NC_013707	AAG	4	113676	113687	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	36582332
35	NC_013707	TAT	4	113865	113875	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	36582332
36	NC_013707	GAA	4	114437	114448	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	36582332
37	NC_013707	AGA	4	117297	117308	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_013707	CTT	4	129389	129401	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	36582332
39	NC_013707	GAA	4	141332	141343	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_013707	ATC	4	150865	150876	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	28379503
41	NC_013707	ATC	4	153896	153906	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
42	NC_013707	ATC	4	155278	155288	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	36582332
43	NC_013707	GAT	4	155864	155874	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Olea europaea chloroplast