Team
Contact

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

All Imperfect Repeats of Olea europaea chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_013707TCAA43013151550 %25 %0 %25 %6 %Non-Coding
2NC_013707CTTT3336347120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
3NC_013707AGT43994101233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
4NC_013707T12482493120 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
5NC_013707T12482493120 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
6NC_013707AAGT3122212321150 %25 %25 %0 %9 %28379494
7NC_013707CCAAT3171217261540 %20 %0 %40 %0 %Non-Coding
8NC_013707CCAAT3171217261540 %20 %0 %40 %0 %Non-Coding
9NC_013707AAG4301030211266.67 %0 %33.33 %0 %8 %36582331
10NC_013707GAA4304030511266.67 %0 %33.33 %0 %8 %36582331
11NC_013707CATT3412741381225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
12NC_013707AG7461746301450 %0 %50 %0 %7 %Non-Coding
13NC_013707AG6461746281250 %0 %50 %0 %0 %Non-Coding
14NC_013707T1248614872120 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
15NC_013707T1248614872120 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
16NC_013707A124987499812100 %0 %0 %0 %8 %Non-Coding
17NC_013707TGAAA3508951021460 %20 %20 %0 %7 %Non-Coding
18NC_013707GTT451405150110 %66.67 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
19NC_013707AAAT3521552261275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
20NC_013707TA6632663371250 %50 %0 %0 %8 %36582331
21NC_013707TA6653365431150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
22NC_013707T1267976808120 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
23NC_013707T1267976808120 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
24NC_013707AAAT3683068411275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
25NC_013707AT6736373741250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
26NC_013707TA6886388731150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
27NC_013707ATAA3929293071675 %25 %0 %0 %6 %Non-Coding
28NC_013707ATAA3929293031275 %25 %0 %0 %0 %Non-Coding
29NC_013707ATAA4954295571675 %25 %0 %0 %6 %Non-Coding
30NC_013707ATAA3954295531275 %25 %0 %0 %0 %Non-Coding
31NC_013707A159556957015100 %0 %0 %0 %6 %Non-Coding
32NC_013707A129556956712100 %0 %0 %0 %0 %Non-Coding
33NC_013707GATTT3968296951420 %60 %20 %0 %7 %Non-Coding
34NC_013707CAA4975097611266.67 %0 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
35NC_013707TTTA3992799381225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
36NC_013707A18127671278418100 %0 %0 %0 %5 %Non-Coding
37NC_013707A15127671278115100 %0 %0 %0 %0 %Non-Coding
38NC_013707AAAT313433134431175 %25 %0 %0 %9 %28379495
39NC_013707TTTCT31346513478140 %80 %0 %20 %7 %28379495
40NC_013707T131412914141130 %100 %0 %0 %7 %Non-Coding
41NC_013707ATTT315368153781125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
42NC_013707TATT316679166911325 %75 %0 %0 %7 %Non-Coding
43NC_013707TGTT31702717037110 %75 %25 %0 %9 %28379495
44NC_013707A16174321744716100 %0 %0 %0 %6 %Non-Coding
45NC_013707A12174321744312100 %0 %0 %0 %0 %Non-Coding
46NC_013707T161773717752160 %100 %0 %0 %6 %36582331
47NC_013707T121773717748120 %100 %0 %0 %0 %36582331
48NC_013707T121924719258120 %100 %0 %0 %8 %36582331
49NC_013707T131964619658130 %100 %0 %0 %7 %36582331
50NC_013707T122018420195120 %100 %0 %0 %0 %36582331
51NC_013707T122018420195120 %100 %0 %0 %0 %36582331
52NC_013707GAAT323843238531150 %25 %25 %0 %9 %36582331
53NC_013707CCTA325649256591125 %25 %0 %50 %9 %28379496
54NC_013707ATCAA329050290641560 %20 %0 %20 %6 %Non-Coding
55NC_013707CAA429773297841266.67 %0 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
56NC_013707A12317693178012100 %0 %0 %0 %8 %Non-Coding
57NC_013707A17326593267517100 %0 %0 %0 %5 %Non-Coding
58NC_013707A13326593267113100 %0 %0 %0 %0 %Non-Coding
59NC_013707GTAT332966329781325 %50 %25 %0 %7 %Non-Coding
60NC_013707ATGA333442334521150 %25 %25 %0 %9 %Non-Coding
61NC_013707T143363633649140 %100 %0 %0 %7 %Non-Coding
62NC_013707TTCT33398533996120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
63NC_013707GAAA336052360631275 %0 %25 %0 %8 %36582331
64NC_013707TTG43645736467110 %66.67 %33.33 %0 %9 %36582331
65NC_013707TTC43690236913120 %66.67 %0 %33.33 %8 %36582331
66NC_013707CTTTTT33711437131180 %83.33 %0 %16.67 %5 %Non-Coding
67NC_013707T133712137133130 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
68NC_013707TA637465374751150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
69NC_013707TC63786737877110 %50 %0 %50 %9 %36582331
70NC_013707A12379223793312100 %0 %0 %0 %0 %Non-Coding
71NC_013707A12379223793312100 %0 %0 %0 %0 %Non-Coding
72NC_013707TAA438066380761166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
73NC_013707TA938127381431750 %50 %0 %0 %5 %Non-Coding
74NC_013707GAAT339744397541150 %25 %25 %0 %9 %28379496
75NC_013707GAT440439404501233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %28379496
76NC_013707GCA442338423491233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %28379496
77NC_013707ATTT343660436711225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
78NC_013707AATTTA343984440011850 %50 %0 %0 %5 %Non-Coding
79NC_013707TAA444031440411166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
80NC_013707A12440534406412100 %0 %0 %0 %0 %Non-Coding
81NC_013707A12440534406412100 %0 %0 %0 %0 %Non-Coding
82NC_013707A14460964610914100 %0 %0 %0 %7 %36582332
83NC_013707A13463404635213100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
84NC_013707GTA446416464261133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
85NC_013707GTT44662746637110 %66.67 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
86NC_013707T154807248086150 %100 %0 %0 %6 %Non-Coding
87NC_013707CTAAA448098481182160 %20 %0 %20 %9 %Non-Coding
88NC_013707TAT448196482081333.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
89NC_013707TA648202482131250 %50 %0 %0 %0 %Non-Coding
90NC_013707CATA350165501751150 %25 %0 %25 %9 %Non-Coding
91NC_013707CTTT35041450426130 %75 %0 %25 %7 %Non-Coding
92NC_013707TTA452792528031233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
93NC_013707TA652808528181150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
94NC_013707AGA453012530231266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
95NC_013707TTA453599536101233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
96NC_013707TAAA353868538781175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
97NC_013707TTTTA354527545401420 %80 %0 %0 %7 %Non-Coding
98NC_013707ATA456544565541166.67 %33.33 %0 %0 %9 %28379497
99NC_013707TATT356914569241125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
100NC_013707TGCA358215582271325 %25 %25 %25 %7 %28379497
101NC_013707GTTA459113591271525 %50 %25 %0 %6 %Non-Coding
102NC_013707TTA459310593221333.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
103NC_013707TAGA361463614741250 %25 %25 %0 %8 %Non-Coding
104NC_013707TAA461509615211366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
105NC_013707GAAA362978629891275 %0 %25 %0 %0 %Non-Coding
106NC_013707GAAA362978629891275 %0 %25 %0 %0 %Non-Coding
107NC_013707T136299463006130 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
108NC_013707T136299463006130 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
109NC_013707AT664596646061150 %50 %0 %0 %9 %28379498
110NC_013707TATAA465987660062060 %40 %0 %0 %5 %Non-Coding
111NC_013707A12660236603412100 %0 %0 %0 %8 %Non-Coding
112NC_013707AT666163661731150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
113NC_013707TTTC36745767468120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
114NC_013707A13678566786813100 %0 %0 %0 %0 %Non-Coding
115NC_013707A13678566786813100 %0 %0 %0 %0 %Non-Coding
116NC_013707T146865868671140 %100 %0 %0 %7 %Non-Coding
117NC_013707T126865868669120 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
118NC_013707AT669076690861150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
119NC_013707ATA469361693721266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
120NC_013707TA769386693981350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
121NC_013707GAAA370403704141275 %0 %25 %0 %8 %28379498
122NC_013707TAAAC370559705731560 %20 %0 %20 %0 %Non-Coding
123NC_013707TAAAC370559705731560 %20 %0 %20 %0 %Non-Coding
124NC_013707TTG47095070960110 %66.67 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
125NC_013707TGAA371524715351250 %25 %25 %0 %8 %Non-Coding
126NC_013707TTTC37155871570130 %75 %0 %25 %7 %Non-Coding
127NC_013707AAAG372841728521275 %0 %25 %0 %0 %28379499
128NC_013707A14733147332714100 %0 %0 %0 %7 %28379499
129NC_013707TTTCA374176741901520 %60 %0 %20 %6 %28379499
130NC_013707ATT474673746831133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
131NC_013707AATAG474925749431960 %20 %20 %0 %10 %Non-Coding
132NC_013707GGTT37607576086120 %50 %50 %0 %8 %28379499
133NC_013707TCT47644676457120 %66.67 %0 %33.33 %8 %28379499
134NC_013707CAAA576720767381975 %0 %0 %25 %10 %Non-Coding
135NC_013707A17777417775717100 %0 %0 %0 %5 %28379499
136NC_013707A12777417775212100 %0 %0 %0 %0 %28379499
137NC_013707T137807378085130 %100 %0 %0 %7 %28379499
138NC_013707AT679661796711150 %50 %0 %0 %9 %28379499
139NC_013707A14804288044114100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
140NC_013707A12804288043912100 %0 %0 %0 %0 %Non-Coding
141NC_013707T178067880694170 %100 %0 %0 %5 %28379499
142NC_013707T188308883105180 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
143NC_013707T188308883105180 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
144NC_013707AGAATT385031850491950 %33.33 %16.67 %0 %5 %Non-Coding
145NC_013707TTC48513585146120 %66.67 %0 %33.33 %8 %28379500
146NC_013707CAAT385208852181150 %25 %0 %25 %9 %28379500
147NC_013707TTTC38623286242110 %75 %0 %25 %9 %28379500
148NC_013707A12862968630712100 %0 %0 %0 %8 %Non-Coding
149NC_013707T168659986614160 %100 %0 %0 %6 %Non-Coding
150NC_013707GAT487168871781133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %28379500
151NC_013707GAT488550885601133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
152NC_013707ATCG391005910171325 %25 %25 %25 %7 %28379501
153NC_013707GAT491580915911233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %28379501
154NC_013707TGA493274932851233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %28379501
155NC_013707AATA394139941511375 %25 %0 %0 %7 %28379501
156NC_013707TATG396538965491225 %50 %25 %0 %8 %Non-Coding
157NC_013707TCCGG39676896782150 %20 %40 %40 %6 %Non-Coding
158NC_013707TTTCG39932799340140 %60 %20 %20 %7 %Non-Coding
159NC_013707TTTGTT39971999737190 %83.33 %16.67 %0 %10 %28379501
160NC_013707TTC4101113101124120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
161NC_013707ATTTTT31011251011431916.67 %83.33 %0 %0 %10 %Non-Coding
162NC_013707ATTAGT41016571016782233.33 %50 %16.67 %0 %9 %Non-Coding
163NC_013707ATCC31047241047351225 %25 %0 %50 %8 %Non-Coding
164NC_013707TCTA31051191051301225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
165NC_013707AAGG31052571052671150 %0 %50 %0 %9 %Non-Coding
166NC_013707GAGG31079781079891225 %0 %75 %0 %8 %Non-Coding
167NC_013707AGGT31081911082021225 %25 %50 %0 %8 %Non-Coding
168NC_013707TAAG31093111093211150 %25 %25 %0 %9 %Non-Coding
169NC_013707ATTT31103731103831125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
170NC_013707GGAA31113911114011150 %0 %50 %0 %9 %28379501
171NC_013707AGA41123611123711166.67 %0 %33.33 %0 %9 %28379501
172NC_013707TAA41134511134621266.67 %33.33 %0 %0 %8 %36582332
173NC_013707AAG41136761136871266.67 %0 %33.33 %0 %8 %36582332
174NC_013707TAT41138651138751133.33 %66.67 %0 %0 %9 %36582332
175NC_013707GAA41144371144481266.67 %0 %33.33 %0 %8 %36582332
176NC_013707T16114861114876160 %100 %0 %0 %6 %Non-Coding
177NC_013707A1711533511535117100 %0 %0 %0 %5 %Non-Coding
178NC_013707A1511533511534915100 %0 %0 %0 %0 %Non-Coding
179NC_013707AGA41172971173081266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
180NC_013707T15117366117380150 %100 %0 %0 %6 %Non-Coding
181NC_013707T12117366117377120 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
182NC_013707AAAT31205591205701275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
183NC_013707AATTG31206361206501540 %40 %20 %0 %6 %Non-Coding
184NC_013707TCTA31223961224071225 %50 %0 %25 %8 %28379502
185NC_013707AATC31228311228421250 %25 %0 %25 %8 %28379502
186NC_013707AGAAA31230431230561480 %0 %20 %0 %7 %28379502
187NC_013707GT7125515125527130 %50 %50 %0 %7 %Non-Coding
188NC_013707TTTG3126411126422120 %75 %25 %0 %8 %36582332
189NC_013707TTTA31264821264931225 %75 %0 %0 %8 %36582332
190NC_013707TTTTGA31265361265531816.67 %66.67 %16.67 %0 %5 %36582332
191NC_013707CATT31273551273661225 %50 %0 %25 %8 %36582332
192NC_013707TCTTTT3128411128429190 %83.33 %0 %16.67 %5 %36582332
193NC_013707AAAG31289331289431175 %0 %25 %0 %9 %36582332
194NC_013707CTT4129389129401130 %66.67 %0 %33.33 %7 %36582332
195NC_013707CTTT3129827129837110 %75 %0 %25 %9 %36582332
196NC_013707TTCC3131055131065110 %50 %0 %50 %9 %36582332
197NC_013707ATAA41320711320851575 %25 %0 %0 %6 %Non-Coding
198NC_013707CTTA31331351331451125 %50 %0 %25 %9 %Non-Coding
199NC_013707CCTT3137189137199110 %50 %0 %50 %9 %Non-Coding
200NC_013707GGAT31377211377321225 %25 %50 %0 %8 %Non-Coding
201NC_013707ACTAAT41407781407992250 %33.33 %0 %16.67 %9 %Non-Coding
202NC_013707AAAAAT31413131413311983.33 %16.67 %0 %0 %10 %Non-Coding
203NC_013707GAA41413321413431266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
204NC_013707ACCGG31456731456871520 %0 %40 %40 %6 %Non-Coding
205NC_013707CATAC31466311466441440 %20 %0 %40 %7 %28379502
206NC_013707TATT31483051483171325 %75 %0 %0 %7 %28379503
207NC_013707TGAT31493161493281325 %50 %25 %0 %7 %28379503
208NC_013707ATC41508651508761233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %28379503
209NC_013707CGAT31514391514511325 %25 %25 %25 %7 %28379503
210NC_013707ATTT31520691520801225 %75 %0 %0 %8 %28379503
211NC_013707ATC41538961539061133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
212NC_013707ATC41552781552881133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %36582332
213NC_013707ACAAAA31558401558571883.33 %0 %0 %16.67 %5 %Non-Coding
214NC_013707GAT41558641558741133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %Non-Coding