ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Cryptomonas paramecium plastid

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_013703	TAT	4	1864	1874	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_013703	TGC	4	2232	2242	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	283794867
3	NC_013703	TGT	4	2537	2548	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	283794867
4	NC_013703	TTC	4	2759	2770	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	283794867
5	NC_013703	CTA	4	3514	3525	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	283794867
6	NC_013703	TTCC	3	3596	3607	12	0 %	50 %	0 %	50 %	0 %	283794868
7	NC_013703	TA	6	7022	7032	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_013703	TTTA	3	7499	7509	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	283794871
9	NC_013703	ATA	4	8677	8687	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	283794872
10	NC_013703	TATT	3	9770	9781	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	283794872
11	NC_013703	CTGT	3	11649	11660	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	283794874
12	NC_013703	TTTG	3	12873	12884	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_013703	GTT	4	13515	13527	13	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	283794876
14	NC_013703	TTGG	3	14605	14615	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	283794878
15	NC_013703	AT	6	14635	14645	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	283794878
16	NC_013703	GTTT	3	15070	15081	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	283794879
17	NC_013703	TTTC	3	15826	15836	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	283794880
18	NC_013703	TTTG	3	16160	16171	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	283794880
19	NC_013703	AATTC	3	16583	16596	14	40 %	40 %	0 %	20 %	7 %	283794881
20	NC_013703	GCTT	3	17025	17036	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	283794881
21	NC_013703	TGT	4	17115	17126	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	283794881
22	NC_013703	TGTT	3	22023	22034	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	283794883
23	NC_013703	TGCC	3	22731	22742	12	0 %	25 %	25 %	50 %	8 %	283794883
24	NC_013703	ATTA	3	24824	24834	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	283794883
25	NC_013703	TATT	3	28189	28200	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_013703	TA	6	28819	28829	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	283794888
27	NC_013703	GTTT	3	30922	30933	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	283794890
28	NC_013703	TTTC	3	31136	31147	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	283794890
29	NC_013703	TTG	4	31313	31324	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_013703	TCT	4	32888	32898	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
31	NC_013703	TAG	4	35120	35131	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	283794896
32	NC_013703	TGT	4	36422	36434	13	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
33	NC_013703	GGT	5	37404	37417	14	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	7 %	283794898
34	NC_013703	TGT	4	38441	38451	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	283794900
35	NC_013703	TGA	4	40747	40757	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	283794905
36	NC_013703	CTGT	3	40769	40779	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	283794905
37	NC_013703	AAAT	3	42022	42032	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	283794909
38	NC_013703	AGG	4	42619	42630	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	283794910
39	NC_013703	CTAT	3	42682	42694	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	283794910
40	NC_013703	AAT	4	43266	43277	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	283794911
41	NC_013703	GAA	4	44696	44706	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	283794914
42	NC_013703	TAAT	3	45635	45646	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	283794914
43	NC_013703	AAGT	3	45689	45699	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	283794915
44	NC_013703	CAAA	3	45893	45903	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	283794916
45	NC_013703	CTTC	3	46997	47008	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	283794918
46	NC_013703	AATT	3	48469	48480	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	283794920
47	NC_013703	GGAA	3	50867	50877	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	283794924
48	NC_013703	AAAAG	3	51248	51261	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	283794925
49	NC_013703	ACT	4	51680	51690	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
50	NC_013703	AGA	4	51939	51949	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
51	NC_013703	AGG	4	53125	53136	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	283794927
52	NC_013703	AGA	4	55179	55190	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	283794929
53	NC_013703	AAAG	3	58043	58053	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	283794930
54	NC_013703	AACA	3	58064	58075	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	283794930
55	NC_013703	CAAAA	3	60918	60932	15	80 %	0 %	0 %	20 %	6 %	283794935
56	NC_013703	ACT	5	62272	62286	15	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	6 %	283794935
57	NC_013703	AAAG	3	64427	64439	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	283794937
58	NC_013703	AAAG	3	64562	64574	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	283794937
59	NC_013703	CACAA	3	64952	64966	15	60 %	0 %	0 %	40 %	6 %	283794937
60	NC_013703	TTTCAG	3	67798	67814	17	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	5 %	283794941
61	NC_013703	TTAT	3	68286	68297	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	283794941
62	NC_013703	TAT	4	69805	69816	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	283794942
63	NC_013703	TA	6	69828	69838	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	283794942
64	NC_013703	A	16	71286	71301	16	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	283794945
65	NC_013703	CA	6	71644	71654	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
66	NC_013703	ATA	4	77656	77667	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Cryptomonas paramecium plastid