ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Pneumocystis carinii mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_013660	TAT	4	40	52	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
2	NC_013660	TAT	4	133	145	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
3	NC_013660	TAT	4	177	187	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_013660	TAT	4	215	225	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_013660	TAT	4	231	243	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
6	NC_013660	TAT	4	261	271	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_013660	TAT	4	609	621	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	28142879
8	NC_013660	TAT	4	800	812	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	28142879
9	NC_013660	TAT	4	845	855	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	28142879
10	NC_013660	TAT	4	1111	1123	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
11	NC_013660	GAA	4	2555	2565	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	28142880
12	NC_013660	TAA	4	3283	3294	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	28142880
13	NC_013660	CTC	4	4256	4267	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	28142880
14	NC_013660	ATA	5	4343	4357	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	28142880
15	NC_013660	ATA	4	5608	5619	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	28142880
16	NC_013660	TTA	4	5753	5764	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	28142880
17	NC_013660	AGA	4	6543	6553	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	28142880
18	NC_013660	ATT	4	8541	8552	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_013660	TTA	4	8577	8588	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_013660	ATT	4	8617	8628	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_013660	ATT	4	8679	8690	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_013660	ATA	4	10627	10637	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	28142880
23	NC_013660	TGA	4	11468	11480	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	28142880
24	NC_013660	AGA	4	12194	12206	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	28142880
25	NC_013660	TAA	4	12662	12673	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	28142881
26	NC_013660	AAG	4	13398	13410	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	28142881
27	NC_013660	AGA	4	13812	13824	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
28	NC_013660	TAC	4	14082	14095	14	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	28142881
29	NC_013660	AAT	4	14923	14935	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	28142881
30	NC_013660	AAT	5	14953	14967	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	28142881
31	NC_013660	TAA	4	15069	15079	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	28142881
32	NC_013660	AAG	4	15314	15325	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	28142881
33	NC_013660	AAG	5	15962	15976	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	28142881
34	NC_013660	TAA	4	16200	16211	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	28142881
35	NC_013660	TAC	4	17534	17548	15	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
36	NC_013660	ATA	4	17564	17575	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	28142881
37	NC_013660	TAA	4	18333	18343	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	28142881
38	NC_013660	TAA	4	20213	20224	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
39	NC_013660	TAA	6	21090	21106	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Pneumocystis carinii mitochondrion