ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Aplidium conicum mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_013584	TAGA	4	18	33	16	50 %	25 %	25 %	0 %	6 %	270267720
2	NC_013584	TAT	4	56	66	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	270267720
3	NC_013584	T	19	800	818	19	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
4	NC_013584	TTTA	3	1160	1170	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	270267721
5	NC_013584	AAGT	3	2065	2075	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	270267721
6	NC_013584	T	13	2288	2300	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	270267721
7	NC_013584	TTAT	3	2354	2364	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	270267721
8	NC_013584	T	12	2370	2381	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	270267721
9	NC_013584	T	19	2488	2506	19	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	270267721
10	NC_013584	ATTTT	3	2786	2799	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	270267722
11	NC_013584	ATT	4	2821	2831	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	270267722
12	NC_013584	AT	6	2864	2874	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	270267722
13	NC_013584	TTTTTA	3	3061	3079	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	10 %	270267722
14	NC_013584	AT	6	3250	3261	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	270267723
15	NC_013584	TAT	4	3307	3317	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	270267723
16	NC_013584	AGA	4	3533	3543	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_013584	TTTA	3	5236	5248	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	270267725
18	NC_013584	TAA	4	5381	5392	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	270267725
19	NC_013584	T	32	5448	5479	32	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	270267725
20	NC_013584	TAGT	3	5690	5700	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	270267725
21	NC_013584	TTTG	3	5948	5959	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	270267726
22	NC_013584	TTTA	3	6172	6184	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	270267726
23	NC_013584	AGTA	3	7009	7019	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
24	NC_013584	TTA	4	7512	7524	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
25	NC_013584	AT	6	7536	7547	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_013584	TAA	4	7807	7818	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_013584	TAT	5	8056	8069	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
28	NC_013584	GTAA	3	8100	8110	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_013584	TTAA	3	8191	8202	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_013584	AT	6	8252	8262	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
31	NC_013584	TTAT	4	8313	8328	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
32	NC_013584	T	14	8873	8886	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	270267728
33	NC_013584	TGTC	3	9013	9024	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	270267728
34	NC_013584	TAG	4	9090	9100	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	270267728
35	NC_013584	TAA	4	10770	10781	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	270267729
36	NC_013584	TA	6	10967	10978	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	270267729
37	NC_013584	TTA	4	11064	11074	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	270267729
38	NC_013584	ATT	4	11089	11100	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	270267729
39	NC_013584	TTTA	3	11155	11165	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	270267729
40	NC_013584	TTA	4	11232	11243	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	270267729
41	NC_013584	T	15	11534	11548	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	270267730
42	NC_013584	AAAT	4	11844	11859	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
43	NC_013584	ATTT	3	12169	12180	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
44	NC_013584	T	12	12387	12398	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013584	TA	7	12544	12556	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
46	NC_013584	TTAA	3	12601	12612	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
47	NC_013584	TTTA	3	12871	12882	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
48	NC_013584	T	14	13096	13109	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	270267731
49	NC_013584	TATTTT	3	13212	13229	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	270267731
50	NC_013584	T	14	13324	13337	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	270267731
51	NC_013584	ATA	4	13713	13724	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_013584	TTA	4	13804	13815	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	270267732
53	NC_013584	T	18	13849	13866	18	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	270267732
54	NC_013584	ATT	4	14036	14048	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	270267732
55	NC_013584	T	13	14077	14089	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	270267732
56	NC_013584	T	17	14104	14120	17	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	270267732
57	NC_013584	T	15	14520	14534	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	270267732
58	NC_013584	TTAA	3	14744	14755	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	270267732
59	NC_013584	T	14	14837	14850	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	270267732
60	NC_013584	TATT	3	15141	15151	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Aplidium conicum mitochondrion