ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Parthenium argentatum chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_013553	TCT	4	735	745	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	281190764
2	NC_013553	TAC	4	1867	1879	13	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
3	NC_013553	TTC	4	2139	2150	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	281190765
4	NC_013553	GAA	4	2944	2955	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	281190765
5	NC_013553	TAA	4	7105	7116	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_013553	AAT	4	7669	7680	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_013553	CTA	4	9121	9132	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
8	NC_013553	GGA	4	17511	17522	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_013553	GAA	4	17558	17568	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_013553	GTT	5	24977	24991	15	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	281190717
11	NC_013553	TGT	4	28443	28454	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	281190719
12	NC_013553	TAA	7	32729	32749	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_013553	GAG	4	34529	34539	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	281190721
14	NC_013553	TTC	4	35259	35270	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281190721
15	NC_013553	ATA	5	35935	35948	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
16	NC_013553	CTT	4	36405	36416	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
17	NC_013553	ATG	4	38881	38891	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	281190724
18	NC_013553	GCA	4	40779	40790	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	281190725
19	NC_013553	TAT	4	42065	42076	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_013553	TTA	4	51580	51591	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_013553	TTC	4	52041	52051	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
22	NC_013553	TAG	4	54505	54516	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	281190731
23	NC_013553	ATA	4	54533	54543	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
24	NC_013553	TTG	4	55257	55267	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_013553	TTA	5	57096	57111	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
26	NC_013553	ATA	4	59473	59484	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_013553	TTC	4	63238	63249	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	281190736
28	NC_013553	ATA	4	67175	67186	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
29	NC_013553	AAT	4	70975	70985	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
30	NC_013553	TCT	4	74231	74242	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	281190745
31	NC_013553	ATA	4	75811	75824	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
32	NC_013553	CTG	4	79304	79316	13	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
33	NC_013553	ATA	4	79373	79384	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
34	NC_013553	TAT	4	84370	84382	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
35	NC_013553	GAT	4	86631	86641	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
36	NC_013553	GAA	5	109211	109225	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
37	NC_013553	GAA	4	109808	109820	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
38	NC_013553	ATT	4	113770	113781	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
39	NC_013553	CTT	4	116004	116014	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
40	NC_013553	AGA	5	117181	117195	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
41	NC_013553	ACT	4	121784	121794	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
42	NC_013553	GAA	4	123439	123450	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_013553	CTT	4	124942	124953	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
44	NC_013553	TTC	4	127525	127536	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013553	TCT	4	127553	127564	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
46	NC_013553	GAA	4	138424	138435	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Parthenium argentatum chloroplast