ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Ectocarpus siliculosus chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_013498	AAT	4	1540	1551	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_013498	TCT	4	1937	1947	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	269100997
3	NC_013498	GCT	4	2209	2220	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	269100997
4	NC_013498	ATA	4	2668	2679	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	269100997
5	NC_013498	TAA	4	6235	6246	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_013498	TTG	5	10147	10161	15	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	269101000
7	NC_013498	TGG	4	10397	10408	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	269101000
8	NC_013498	ATT	4	14312	14324	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	269101004
9	NC_013498	TGA	4	14594	14605	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	269101004
10	NC_013498	CTT	5	15930	15943	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	269101005
11	NC_013498	AAT	4	16974	16984	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_013498	TAT	5	19464	19478	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	269101010
13	NC_013498	ATT	5	25050	25063	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	269101015
14	NC_013498	TTA	4	28374	28384	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	269101018
15	NC_013498	ATG	4	30397	30407	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	269101021
16	NC_013498	ATT	4	32604	32615	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	269101023
17	NC_013498	CAT	4	34075	34086	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	269101027
18	NC_013498	TAA	4	35512	35523	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_013498	TAA	4	35936	35947	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	269101029
20	NC_013498	TAA	4	39418	39429	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	269101035
21	NC_013498	ATA	4	39591	39602	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	269101035
22	NC_013498	CTT	4	42812	42823	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	269101040
23	NC_013498	CTT	4	44918	44928	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	269101044
24	NC_013498	TAA	4	45990	46001	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	269101047
25	NC_013498	AAT	4	46135	46145	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	269101047
26	NC_013498	CAC	4	48761	48772	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	269101054
27	NC_013498	TAT	4	48860	48871	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	269101054
28	NC_013498	TCT	4	49479	49489	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
29	NC_013498	ATT	4	53700	53711	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_013498	ATT	4	57266	57277	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	269101059
31	NC_013498	AGC	4	57724	57735	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	269101059
32	NC_013498	AAG	4	57996	58007	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	269101059
33	NC_013498	ATA	4	62135	62145	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
34	NC_013498	ATT	4	62618	62629	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_013498	ATT	4	63206	63217	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	269101066
36	NC_013498	ATT	4	63303	63314	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013498	TTA	4	66518	66529	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_013498	TAT	5	67832	67845	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
39	NC_013498	TAT	4	69073	69083	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_013498	TAA	4	69655	69666	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
41	NC_013498	ATT	4	77795	77805	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	269101083
42	NC_013498	TAT	4	82669	82681	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
43	NC_013498	TTA	4	82902	82913	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	269101087
44	NC_013498	TAT	4	82986	82997	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	269101087
45	NC_013498	GAA	4	90538	90549	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	269101092
46	NC_013498	TGT	4	92556	92567	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	269101093
47	NC_013498	CAA	4	93304	93315	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	269101093
48	NC_013498	ATT	4	95550	95560	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	269101094
49	NC_013498	GAA	4	96296	96306	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	269101094
50	NC_013498	AAT	4	97471	97482	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
51	NC_013498	AGA	4	97911	97922	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	269101095
52	NC_013498	TAT	4	101041	101052	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	269101100
53	NC_013498	ACA	4	101551	101562	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	269101101
54	NC_013498	ATA	4	104573	104585	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
55	NC_013498	TTC	4	105649	105660	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	269101105
56	NC_013498	CTG	4	105738	105749	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	269101105
57	NC_013498	ATT	4	106546	106556	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	269101107
58	NC_013498	TAA	4	107127	107137	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
59	NC_013498	ATA	4	107274	107284	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
60	NC_013498	CAA	4	107495	107506	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	269101108
61	NC_013498	TAT	4	110090	110100	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	269101109
62	NC_013498	ATA	4	112359	112370	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
63	NC_013498	AGA	4	113694	113705	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	269101112
64	NC_013498	GAA	4	114227	114237	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	269101112
65	NC_013498	AGA	4	114345	114355	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	269101112
66	NC_013498	TAT	4	115773	115784	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
67	NC_013498	TAA	4	116026	116037	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	269101115
68	NC_013498	TAT	4	117976	117987	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	269101116
69	NC_013498	ATA	4	118725	118736	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	269101117
70	NC_013498	TGT	4	122542	122553	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	269101122
71	NC_013498	GTT	4	122594	122605	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	269101122
72	NC_013498	TTA	4	122800	122811	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
73	NC_013498	ATG	4	125481	125492	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	269101123
74	NC_013498	AAG	4	126760	126771	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	269101125
75	NC_013498	TAT	4	129287	129298	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
76	NC_013498	TAA	4	130613	130625	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	269101129
77	NC_013498	TAT	4	130793	130804	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
78	NC_013498	TAA	4	131859	131870	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
79	NC_013498	TTA	4	132830	132841	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
80	NC_013498	ATA	4	134440	134451	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
81	NC_013498	AAT	4	135575	135586	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	269101138
82	NC_013498	TTA	4	135838	135849	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013498	ATA	4	135934	135945	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
84	NC_013498	TAA	4	136966	136976	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
85	NC_013498	AGC	4	137734	137745	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	269101141

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Ectocarpus siliculosus chloroplast