ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

All Imperfect Repeats of Ectocarpus siliculosus chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_013498TA6149715081250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
2NC_013498AAT4154015511266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
3NC_013498TCT419371947110 %66.67 %0 %33.33 %9 %269100997
4NC_013498TGAA3203620461150 %25 %25 %0 %9 %269100997
5NC_013498GCT422092220120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %269100997
6NC_013498AAAC3256325741275 %0 %0 %25 %8 %269100997
7NC_013498ATA4266826791266.67 %33.33 %0 %0 %8 %269100997
8NC_013498GAAA3338433941175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
9NC_013498TAA4623562461266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
10NC_013498TTGG389498959110 %50 %50 %0 %9 %269100999
11NC_013498TTG51014710161150 %66.67 %33.33 %0 %6 %269101000
12NC_013498TGG41039710408120 %33.33 %66.67 %0 %8 %269101000
13NC_013498CTTAT310633106461420 %60 %0 %20 %7 %269101000
14NC_013498TTTG31201812028110 %75 %25 %0 %9 %269101002
15NC_013498TA612615126261250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
16NC_013498AATT312754127641150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
17NC_013498TATT312882128921125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
18NC_013498AT613432134421150 %50 %0 %0 %9 %269101004
19NC_013498ATT414312143241333.33 %66.67 %0 %0 %7 %269101004
20NC_013498TGA414594146051233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %269101004
21NC_013498CTT51593015943140 %66.67 %0 %33.33 %7 %269101005
22NC_013498GATT316113161231125 %50 %25 %0 %9 %269101005
23NC_013498TAAAT316154161681560 %40 %0 %0 %6 %Non-Coding
24NC_013498TA616278162881150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
25NC_013498AAT416974169841166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
26NC_013498TTTA316993170031125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
27NC_013498TAAA317344173551275 %25 %0 %0 %8 %269101006
28NC_013498AAAT318142181531275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
29NC_013498TA618275182851150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
30NC_013498ATAA319144191551275 %25 %0 %0 %8 %269101010
31NC_013498TAT519464194781533.33 %66.67 %0 %0 %6 %269101010
32NC_013498GTTTT32068920702140 %80 %20 %0 %7 %269101011
33NC_013498CTAA321863218751350 %25 %0 %25 %7 %Non-Coding
34NC_013498AAAT323903239141275 %25 %0 %0 %0 %269101015
35NC_013498TA624749247601250 %50 %0 %0 %8 %269101015
36NC_013498ATT525050250631433.33 %66.67 %0 %0 %7 %269101015
37NC_013498ATTA325233252441250 %50 %0 %0 %8 %269101015
38NC_013498AATT326540265501150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
39NC_013498GTTA327899279101225 %50 %25 %0 %8 %269101018
40NC_013498AAATAA327960279771883.33 %16.67 %0 %0 %5 %269101018
41NC_013498TTA428374283841133.33 %66.67 %0 %0 %9 %269101018
42NC_013498AAAT329058290681175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
43NC_013498ATAA330215302261275 %25 %0 %0 %0 %269101020
44NC_013498ATG430397304071133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %269101021
45NC_013498TTAA330676306861150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
46NC_013498TCTT33154231553120 %75 %0 %25 %8 %269101023
47NC_013498ATT432604326151233.33 %66.67 %0 %0 %8 %269101023
48NC_013498TAATT333374333871440 %60 %0 %0 %7 %269101026
49NC_013498CAT434075340861233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %269101027
50NC_013498TAA435512355231266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
51NC_013498ATTA335615356261250 %50 %0 %0 %0 %Non-Coding
52NC_013498TAA435936359471266.67 %33.33 %0 %0 %8 %269101029
53NC_013498TTTTA338038380521520 %80 %0 %0 %0 %269101032
54NC_013498TAAA338981389921275 %25 %0 %0 %8 %269101034
55NC_013498ATTT339401394131325 %75 %0 %0 %7 %269101035
56NC_013498TAA439418394291266.67 %33.33 %0 %0 %8 %269101035
57NC_013498ATA439591396021266.67 %33.33 %0 %0 %8 %269101035
58NC_013498TTATTT340769407871916.67 %83.33 %0 %0 %5 %Non-Coding
59NC_013498TA641241412511150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
60NC_013498ATTT641258412812425 %75 %0 %0 %8 %269101038
61NC_013498CTT44281242823120 %66.67 %0 %33.33 %8 %269101040
62NC_013498TGTA343008430191225 %50 %25 %0 %8 %269101040
63NC_013498AT643730437411250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
64NC_013498TA644136441461150 %50 %0 %0 %9 %269101043
65NC_013498CTT44491844928110 %66.67 %0 %33.33 %9 %269101044
66NC_013498TAA445990460011266.67 %33.33 %0 %0 %8 %269101047
67NC_013498AAT446135461451166.67 %33.33 %0 %0 %9 %269101047
68NC_013498TGTT34826348274120 %75 %25 %0 %0 %269101052
69NC_013498TTTC34867748688120 %75 %0 %25 %8 %269101054
70NC_013498CAC448761487721233.33 %0 %0 %66.67 %8 %269101054
71NC_013498TAT448860488711233.33 %66.67 %0 %0 %8 %269101054
72NC_013498TCT44947949489110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
73NC_013498AAAT349732497421175 %25 %0 %0 %9 %269101055
74NC_013498TTAA350083500951350 %50 %0 %0 %7 %269101056
75NC_013498TATT353278532881125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
76NC_013498AATA353461534711175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
77NC_013498ATT453700537111233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
78NC_013498CAGG354320543311225 %0 %50 %25 %8 %Non-Coding
79NC_013498TTTC35655056560110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
80NC_013498ATT457266572771233.33 %66.67 %0 %0 %8 %269101059
81NC_013498AAGA357300573101175 %0 %25 %0 %9 %269101059
82NC_013498TTGGT35736357376140 %60 %40 %0 %7 %269101059
83NC_013498AGC457724577351233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %269101059
84NC_013498TTCA357898579081125 %50 %0 %25 %9 %269101059
85NC_013498AAG457996580071266.67 %0 %33.33 %0 %8 %269101059
86NC_013498CAAATT358618586361950 %33.33 %0 %16.67 %10 %269101060
87NC_013498TTTA359976599861125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
88NC_013498TAAAAT360296603141966.67 %33.33 %0 %0 %10 %Non-Coding
89NC_013498AT661878618881150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
90NC_013498ATA462135621451166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
91NC_013498AT662592626031250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
92NC_013498ATT462618626291233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
93NC_013498ATT463206632171233.33 %66.67 %0 %0 %0 %269101066
94NC_013498ATT463303633141233.33 %66.67 %0 %0 %0 %Non-Coding
95NC_013498TATAT364641646551540 %60 %0 %0 %6 %Non-Coding
96NC_013498ATTTTA364693647111933.33 %66.67 %0 %0 %5 %Non-Coding
97NC_013498AAATAA365034650521983.33 %16.67 %0 %0 %5 %Non-Coding
98NC_013498TATT365286652961125 %75 %0 %0 %9 %269101070
99NC_013498TTA466518665291233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
100NC_013498TA767247672591350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
101NC_013498TTATT367452674651420 %80 %0 %0 %7 %Non-Coding
102NC_013498TA667666676781350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
103NC_013498TAT567832678451433.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
104NC_013498TAAAAA368165681821883.33 %16.67 %0 %0 %5 %269101073
105NC_013498TAT469073690831133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
106NC_013498TTGT36911269123120 %75 %25 %0 %8 %Non-Coding
107NC_013498TAA469655696661266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
108NC_013498AAAT370097701071175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
109NC_013498T137030170313130 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
110NC_013498A13730747308613100 %0 %0 %0 %7 %269101079
111NC_013498ATCT373266732761125 %50 %0 %25 %9 %269101079
112NC_013498TTAA376670766801150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
113NC_013498AATA377559775691175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
114NC_013498TA777578775901350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
115NC_013498ATT477795778051133.33 %66.67 %0 %0 %9 %269101083
116NC_013498AT778211782231350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
117NC_013498AAAT379454794651275 %25 %0 %0 %8 %269101084
118NC_013498AAAT379902799121175 %25 %0 %0 %9 %269101084
119NC_013498AGAAA381082810951480 %0 %20 %0 %7 %269101085
120NC_013498TAT482669826811333.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
121NC_013498TAGT382756827661125 %50 %25 %0 %9 %269101087
122NC_013498TTA482902829131233.33 %66.67 %0 %0 %8 %269101087
123NC_013498TAT482986829971233.33 %66.67 %0 %0 %8 %269101087
124NC_013498TCAA383102831121150 %25 %0 %25 %9 %269101087
125NC_013498TAAAA384204842181580 %20 %0 %0 %0 %Non-Coding
126NC_013498AAAG384892849021175 %0 %25 %0 %9 %269101088
127NC_013498AT685044850541150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
128NC_013498TAAATA385824858411866.67 %33.33 %0 %0 %5 %269101089
129NC_013498TAGA386119861301250 %25 %25 %0 %8 %269101089
130NC_013498AAAT487505875191575 %25 %0 %0 %6 %269101090
131NC_013498TAAAA387797878101480 %20 %0 %0 %7 %269101091
132NC_013498AATT388388883981150 %50 %0 %0 %9 %269101092
133NC_013498TAAAA389370893831480 %20 %0 %0 %7 %269101092
134NC_013498GAA490538905491266.67 %0 %33.33 %0 %8 %269101092
135NC_013498TAAAAA391666916841983.33 %16.67 %0 %0 %10 %Non-Coding
136NC_013498TGT49255692567120 %66.67 %33.33 %0 %8 %269101093
137NC_013498TTTA393218932281125 %75 %0 %0 %9 %269101093
138NC_013498CAA493304933151266.67 %0 %0 %33.33 %8 %269101093
139NC_013498AAATG394851948641460 %20 %20 %0 %7 %269101094
140NC_013498ATT495550955601133.33 %66.67 %0 %0 %9 %269101094
141NC_013498GAA496296963061166.67 %0 %33.33 %0 %9 %269101094
142NC_013498TAAA397378973901375 %25 %0 %0 %7 %269101094
143NC_013498AAT497471974821266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
144NC_013498AGA497911979221266.67 %0 %33.33 %0 %8 %269101095
145NC_013498TA698495985061250 %50 %0 %0 %8 %269101096
146NC_013498TAGT31001271001381225 %50 %25 %0 %8 %269101098
147NC_013498ATTA41007831007981650 %50 %0 %0 %6 %Non-Coding
148NC_013498TAT41010411010521233.33 %66.67 %0 %0 %8 %269101100
149NC_013498ACA41015511015621266.67 %0 %0 %33.33 %8 %269101101
150NC_013498ATA41045731045851366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
151NC_013498TTAA31048551048661250 %50 %0 %0 %8 %269101104
152NC_013498TTC4105649105660120 %66.67 %0 %33.33 %8 %269101105
153NC_013498CTG4105738105749120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %269101105
154NC_013498ATT41065461065561133.33 %66.67 %0 %0 %9 %269101107
155NC_013498TAA41071271071371166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
156NC_013498TTTC3107250107260110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
157NC_013498ATA41072741072841166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
158NC_013498CAA41074951075061266.67 %0 %0 %33.33 %8 %269101108
159NC_013498TAT41100901101001133.33 %66.67 %0 %0 %9 %269101109
160NC_013498ATA41123591123701266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
161NC_013498AGA41136941137051266.67 %0 %33.33 %0 %8 %269101112
162NC_013498GAA41142271142371166.67 %0 %33.33 %0 %9 %269101112
163NC_013498AGA41143451143551166.67 %0 %33.33 %0 %9 %269101112
164NC_013498TAT41157731157841233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
165NC_013498TAA41160261160371266.67 %33.33 %0 %0 %8 %269101115
166NC_013498ATAA31161301161411275 %25 %0 %0 %8 %269101115
167NC_013498TAT41179761179871233.33 %66.67 %0 %0 %8 %269101116
168NC_013498ATA41187251187361266.67 %33.33 %0 %0 %8 %269101117
169NC_013498AATA31189971190071175 %25 %0 %0 %9 %269101117
170NC_013498TAATA41190501190681960 %40 %0 %0 %5 %269101117
171NC_013498TTCA31196591196691125 %50 %0 %25 %9 %269101118
172NC_013498TGTA31224711224831325 %50 %25 %0 %7 %269101122
173NC_013498TGT4122542122553120 %66.67 %33.33 %0 %8 %269101122
174NC_013498GTT4122594122605120 %66.67 %33.33 %0 %8 %269101122
175NC_013498TTA41228001228111233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
176NC_013498CTTA31234141234251225 %50 %0 %25 %8 %269101123
177NC_013498ATG41254811254921233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %269101123
178NC_013498AAAG31257011257121275 %0 %25 %0 %8 %269101123
179NC_013498AAG41267601267711266.67 %0 %33.33 %0 %8 %269101125
180NC_013498AAAT31274381274481175 %25 %0 %0 %9 %269101126
181NC_013498AAAAG31285231285361480 %0 %20 %0 %7 %Non-Coding
182NC_013498ATAA41287651287801675 %25 %0 %0 %6 %Non-Coding
183NC_013498TGTA31291001291111225 %50 %25 %0 %8 %Non-Coding
184NC_013498TAT41292871292981233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
185NC_013498TTCT3130205130216120 %75 %0 %25 %8 %269101128
186NC_013498TAA41306131306251366.67 %33.33 %0 %0 %7 %269101129
187NC_013498TAT41307931308041233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
188NC_013498ATTTT31308571308701420 %80 %0 %0 %7 %Non-Coding
189NC_013498TAAAT41310871311062060 %40 %0 %0 %5 %Non-Coding
190NC_013498ATTT31312951313051125 %75 %0 %0 %9 %269101131
191NC_013498TAA41318591318701266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
192NC_013498TA81320521320661550 %50 %0 %0 %6 %Non-Coding
193NC_013498CTAA31321581321681150 %25 %0 %25 %9 %Non-Coding
194NC_013498TTA41328301328411233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
195NC_013498ATTA31331831331951350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
196NC_013498ATA41344401344511266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
197NC_013498AATTT31348101348241540 %60 %0 %0 %6 %269101135
198NC_013498AAT41355751355861266.67 %33.33 %0 %0 %8 %269101138
199NC_013498TA61358051358151150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
200NC_013498TTA41358381358491233.33 %66.67 %0 %0 %0 %Non-Coding
201NC_013498AATT31359101359211250 %50 %0 %0 %0 %Non-Coding
202NC_013498ATA41359341359451266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
203NC_013498AGCG31363781363881125 %0 %50 %25 %9 %Non-Coding
204NC_013498AATT31369281369381150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
205NC_013498TAA41369661369761166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
206NC_013498AT61370371370471150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
207NC_013498AGC41377341377451233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %269101141
208NC_013498ATTT31391841391951225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding