ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Saccharina ochotensis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_013478	TTATT	3	3446	3460	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
2	NC_013478	CAA	4	4296	4306	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	26805360
3	NC_013478	TAGT	3	5165	5176	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	26805361
4	NC_013478	TAA	4	5492	5504	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	26805361
5	NC_013478	CGT	4	5636	5647	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	26805361
6	NC_013478	TAT	4	5770	5780	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	26805361
7	NC_013478	TTTA	3	6706	6716	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	26805361
8	NC_013478	TTTG	3	7117	7128	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	26805361
9	NC_013478	ATTTTT	3	8202	8219	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	0 %	26805361
10	NC_013478	ACA	4	9016	9027	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	26805361
11	NC_013478	TTG	4	9657	9668	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	26805361
12	NC_013478	TGT	4	10083	10094	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	26805361
13	NC_013478	GTTC	3	11408	11418	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	26805362
14	NC_013478	CTTTCC	3	11610	11627	18	0 %	50 %	0 %	50 %	5 %	26805362
15	NC_013478	TTTA	3	12206	12216	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	26805362
16	NC_013478	ATT	4	12447	12457	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	26805362
17	NC_013478	T	13	12719	12731	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	26805362
18	NC_013478	T	12	12738	12749	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	26805362
19	NC_013478	TTTG	3	13024	13035	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	26805362
20	NC_013478	TAT	4	14236	14247	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	26805362
21	NC_013478	TTG	4	15470	15481	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	26805362
22	NC_013478	GAA	4	15877	15888	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	26805362
23	NC_013478	TTAA	3	16333	16343	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	26805362
24	NC_013478	TTTTTA	3	17303	17321	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	10 %	26805362
25	NC_013478	GTTT	3	18326	18336	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	26805363
26	NC_013478	TTAT	3	18424	18434	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	26805363
27	NC_013478	GGT	4	20227	20238	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	26805363
28	NC_013478	ATTTAT	3	21229	21245	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
29	NC_013478	TAA	4	23131	23142	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	26805363
30	NC_013478	GT	6	24298	24309	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	26805363
31	NC_013478	GCAG	3	26233	26243	11	25 %	0 %	50 %	25 %	9 %	26805363
32	NC_013478	AAAT	3	26359	26369	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	26805363
33	NC_013478	TCT	4	27048	27059	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	26805363
34	NC_013478	TGCAA	3	28422	28435	14	40 %	20 %	20 %	20 %	7 %	26805363
35	NC_013478	TTGG	3	30162	30173	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	26805363
36	NC_013478	ATTT	3	30477	30487	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	26805363
37	NC_013478	TA	7	33478	33491	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	26805364
38	NC_013478	ATAA	3	34571	34582	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
39	NC_013478	TAT	4	36231	36241	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	26805364
40	NC_013478	A	13	36248	36260	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	26805364

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Saccharina ochotensis mitochondrion