ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Pleurozia purpurea mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_013444	ATTC	3	1382	1392	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
2	NC_013444	A	13	2370	2382	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
3	NC_013444	ATT	4	2638	2648	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	26218669
4	NC_013444	GAT	4	4512	4522	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	26218669
5	NC_013444	GC	6	5175	5185	11	0 %	0 %	50 %	50 %	9 %	Non-Coding
6	NC_013444	C	14	5185	5198	14	0 %	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013444	TAG	4	5241	5251	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_013444	AT	7	5945	5958	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
9	NC_013444	TAT	4	6453	6463	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	26218669
10	NC_013444	ATTTT	3	7444	7457	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	26218669
11	NC_013444	GGTT	3	8529	8541	13	0 %	50 %	50 %	0 %	7 %	26218669
12	NC_013444	TGTT	3	8932	8943	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	26218669
13	NC_013444	T	15	9617	9631	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	26218669
14	NC_013444	GATCC	3	9759	9773	15	20 %	20 %	20 %	40 %	0 %	26218669
15	NC_013444	AT	6	10070	10081	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	26218669
16	NC_013444	G	16	10344	10359	16	0 %	0 %	100 %	0 %	0 %	26218669
17	NC_013444	TTTG	3	10988	10998	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	26218669
18	NC_013444	CTTT	3	11182	11192	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	26218669
19	NC_013444	TTTA	3	11785	11795	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_013444	CAAT	4	12014	12029	16	50 %	25 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
21	NC_013444	GATTAA	3	12768	12784	17	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
22	NC_013444	TA	8	13657	13672	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
23	NC_013444	TA	6	13750	13760	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
24	NC_013444	AT	9	15441	15458	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
25	NC_013444	AT	6	15704	15715	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_013444	AT	6	15899	15910	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_013444	TCT	4	18824	18835	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
28	NC_013444	TCT	4	19155	19166	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
29	NC_013444	AT	6	23254	23265	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_013444	TTGG	3	23480	23491	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
31	NC_013444	TAT	4	26367	26380	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	26218670
32	NC_013444	TAA	4	27118	27128	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_013444	CCCG	3	28289	28299	11	0 %	0 %	25 %	75 %	9 %	Non-Coding
34	NC_013444	CTAA	3	28439	28451	13	50 %	25 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
35	NC_013444	AATA	3	28685	28697	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
36	NC_013444	TATT	3	29603	29614	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_013444	TTTG	3	32206	32216	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
38	NC_013444	CTTT	3	32400	32410	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
39	NC_013444	CCCT	3	33009	33019	11	0 %	25 %	0 %	75 %	9 %	Non-Coding
40	NC_013444	AAAT	4	34744	34759	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	26218670
41	NC_013444	AT	6	34758	34768	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	26218670
42	NC_013444	AT	7	34770	34783	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	26218670
43	NC_013444	TATTT	4	34961	34979	19	20 %	80 %	0 %	0 %	10 %	26218670
44	NC_013444	TAA	5	36256	36270	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
45	NC_013444	CCGT	3	37422	37433	12	0 %	25 %	25 %	50 %	8 %	Non-Coding
46	NC_013444	AAG	4	39612	39622	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
47	NC_013444	AGCG	3	41651	41662	12	25 %	0 %	50 %	25 %	8 %	Non-Coding
48	NC_013444	AT	7	43406	43419	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
49	NC_013444	AAAT	3	44698	44710	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
50	NC_013444	CGC	4	47764	47778	15	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	6 %	Non-Coding
51	NC_013444	ACT	4	47915	47926	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
52	NC_013444	TATTG	3	48845	48860	16	20 %	60 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
53	NC_013444	CGGG	3	49674	49684	11	0 %	0 %	75 %	25 %	9 %	Non-Coding
54	NC_013444	AT	7	50292	50305	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
55	NC_013444	GAA	7	50690	50710	21	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013444	TGCG	3	50801	50811	11	0 %	25 %	50 %	25 %	9 %	Non-Coding
57	NC_013444	CCT	4	51875	51885	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	26218671
58	NC_013444	CCCT	3	53710	53721	12	0 %	25 %	0 %	75 %	8 %	26218671
59	NC_013444	A	13	55566	55578	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	26218671
60	NC_013444	TTA	4	55876	55887	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	26218671
61	NC_013444	GC	6	56427	56437	11	0 %	0 %	50 %	50 %	9 %	26218672
62	NC_013444	GGGAAA	3	56528	56545	18	50 %	0 %	50 %	0 %	5 %	26218672
63	NC_013444	CGTC	3	56603	56614	12	0 %	25 %	25 %	50 %	8 %	26218672
64	NC_013444	AAGAA	3	56686	56701	16	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	26218672
65	NC_013444	TAG	4	57099	57110	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	26218672
66	NC_013444	CTTT	3	58199	58210	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
67	NC_013444	TTTG	3	61362	61372	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	26218672
68	NC_013444	GGAT	3	62074	62086	13	25 %	25 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
69	NC_013444	AT	6	62814	62825	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
70	NC_013444	ACA	4	63225	63235	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	26218672
71	NC_013444	CAAG	3	63309	63320	12	50 %	0 %	25 %	25 %	0 %	26218672
72	NC_013444	TAT	4	64493	64503	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	26218673
73	NC_013444	GAT	4	69736	69746	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	26218673
74	NC_013444	T	12	70459	70470	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	26218673
75	NC_013444	AT	14	70951	70978	28	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	26218673
76	NC_013444	G	12	73302	73313	12	0 %	0 %	100 %	0 %	0 %	26218673
77	NC_013444	GGC	4	75296	75307	12	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	8 %	26218673
78	NC_013444	AGGA	3	75520	75531	12	50 %	0 %	50 %	0 %	0 %	26218673
79	NC_013444	TCAC	3	76215	76226	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	26218673
80	NC_013444	TCTA	3	76870	76882	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	26218673
81	NC_013444	ACG	4	77852	77863	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
82	NC_013444	GGC	4	78964	78974	11	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	9 %	26218673
83	NC_013444	ACAT	3	79307	79317	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	26218673
84	NC_013444	C	12	80831	80842	12	0 %	0 %	0 %	100 %	8 %	Non-Coding
85	NC_013444	GCG	4	81441	81451	11	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	9 %	26218673
86	NC_013444	TATT	3	81663	81678	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
87	NC_013444	A	13	83286	83298	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
88	NC_013444	AAAGA	3	83520	83534	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
89	NC_013444	GGTA	3	84584	84594	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
90	NC_013444	CG	6	85322	85332	11	0 %	0 %	50 %	50 %	9 %	Non-Coding
91	NC_013444	AT	6	86577	86588	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
92	NC_013444	TTTTTA	3	87315	87333	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	10 %	26218674
93	NC_013444	CAAC	3	87774	87785	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	26218674
94	NC_013444	TTGGA	3	88971	88984	14	20 %	40 %	40 %	0 %	7 %	Non-Coding
95	NC_013444	AT	6	90202	90213	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
96	NC_013444	AAAG	3	90252	90262	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
97	NC_013444	AT	17	90934	90967	34	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
98	NC_013444	ATAG	3	91111	91122	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
99	NC_013444	TA	12	91130	91152	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
100	NC_013444	TGGT	3	91508	91518	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
101	NC_013444	TGGG	3	91835	91845	11	0 %	25 %	75 %	0 %	9 %	Non-Coding
102	NC_013444	AT	6	92229	92240	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
103	NC_013444	TTGG	3	92458	92469	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	26218674
104	NC_013444	CAAA	3	93023	93034	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	26218674
105	NC_013444	CTA	4	94953	94963	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	26218674
106	NC_013444	GA	6	95250	95261	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	26218674
107	NC_013444	CGG	4	96624	96635	12	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	8 %	26218674
108	NC_013444	AAT	4	98850	98860	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
109	NC_013444	TGA	4	98936	98947	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
110	NC_013444	CTG	4	98983	98994	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
111	NC_013444	TATG	3	99087	99098	12	25 %	50 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013444	AT	9	99434	99450	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
113	NC_013444	GAAA	3	99452	99462	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
114	NC_013444	AGC	4	99861	99872	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	26218674
115	NC_013444	CGC	4	99952	99963	12	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	8 %	26218674
116	NC_013444	GGC	4	101531	101541	11	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	9 %	26218674
117	NC_013444	AT	16	102238	102269	32	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
118	NC_013444	AT	6	102298	102311	14	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013444	AT	6	102533	102544	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013444	AT	8	102794	102809	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	26218674
121	NC_013444	AT	6	102941	102951	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	26218674
122	NC_013444	CCCT	3	111619	111629	11	0 %	25 %	0 %	75 %	9 %	Non-Coding
123	NC_013444	CAT	5	112032	112045	14	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
124	NC_013444	AGTT	4	112264	112279	16	25 %	50 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
125	NC_013444	TA	7	113115	113127	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
126	NC_013444	TAAA	3	114026	114037	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
127	NC_013444	ATTT	3	114108	114119	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013444	ACAA	3	114425	114436	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	26218675
129	NC_013444	AATC	3	118295	118306	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	26218675
130	NC_013444	CAAT	3	119506	119517	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	26218675
131	NC_013444	GTTT	3	119605	119615	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	26218675
132	NC_013444	C	13	124302	124314	13	0 %	0 %	0 %	100 %	0 %	26218675
133	NC_013444	TAA	4	131391	131402	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
134	NC_013444	AAAT	3	132581	132591	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
135	NC_013444	TAT	4	134103	134113	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
136	NC_013444	CTTT	4	134135	134150	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
137	NC_013444	CTT	5	134176	134191	16	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
138	NC_013444	CCTA	4	134265	134281	17	25 %	25 %	0 %	50 %	5 %	Non-Coding
139	NC_013444	CCGCG	3	134348	134362	15	0 %	0 %	40 %	60 %	6 %	Non-Coding
140	NC_013444	AG	6	135373	135383	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
141	NC_013444	TTTA	3	137950	137961	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
142	NC_013444	ATA	4	139566	139576	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
143	NC_013444	ACAA	3	140335	140346	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
144	NC_013444	GCC	4	140817	140827	11	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
145	NC_013444	GCC	4	141263	141275	13	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	7 %	Non-Coding
146	NC_013444	TA	6	144888	144898	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
147	NC_013444	CAA	4	145213	145223	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
148	NC_013444	TCCC	3	145300	145310	11	0 %	25 %	0 %	75 %	9 %	Non-Coding
149	NC_013444	AAT	7	146389	146411	23	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
150	NC_013444	TA	13	149668	149692	25	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
151	NC_013444	AT	6	150314	150325	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
152	NC_013444	TTATT	3	151143	151157	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
153	NC_013444	C	16	151572	151587	16	0 %	0 %	0 %	100 %	0 %	26218675
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157	NC_013444	AT	6	156027	156038	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
158	NC_013444	TTTA	3	156208	156218	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
159	NC_013444	ATT	5	156472	156486	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
160	NC_013444	AATC	3	156496	156506	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
161	NC_013444	TA	6	156623	156634	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
162	NC_013444	AAT	4	156757	156768	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
163	NC_013444	CGG	4	157919	157929	11	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
164	NC_013444	GAATA	3	158332	158346	15	60 %	20 %	20 %	0 %	6 %	26218675
165	NC_013444	AT	6	159057	159068	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
166	NC_013444	T	14	160152	160165	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
167	NC_013444	A	14	162036	162049	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	26218676
168	NC_013444	TTTG	3	162348	162358	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	26218676
169	NC_013444	CATT	3	162718	162729	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	26218676
170	NC_013444	ATTG	3	162738	162749	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	26218676
171	NC_013444	GCA	4	163428	163438	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	26218676
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174	NC_013444	CTAT	3	165769	165779	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
175	NC_013444	TACTTG	3	167162	167180	19	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	5 %	26218676
176	NC_013444	TGTT	3	167376	167386	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	26218676
177	NC_013444	TCTT	3	168313	168324	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Pleurozia purpurea mitochondrion