ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Bryopsis hypnoides chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_013359	TGT	4	4585	4595	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	260780684
2	NC_013359	ATA	4	5630	5642	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	260780649
3	NC_013359	ATA	4	7804	7815	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_013359	TCA	4	8263	8274	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
5	NC_013359	CTT	4	9637	9648	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	260780678
6	NC_013359	CGA	4	10044	10054	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	260780678
7	NC_013359	TTG	4	12229	12240	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_013359	GTT	4	19306	19316	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_013359	TCA	4	27542	27554	13	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	260780658
10	NC_013359	TCT	4	30666	30677	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	260780663
11	NC_013359	ATA	5	31281	31295	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	260780675
12	NC_013359	TTA	4	33401	33411	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_013359	AAC	4	33763	33773	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	260780674
14	NC_013359	TAT	4	33936	33948	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
15	NC_013359	TAT	4	49055	49065	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_013359	ACA	4	57119	57131	13	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	7 %	260780635
17	NC_013359	TTC	4	57824	57835	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	260780652
18	NC_013359	TAG	4	57872	57883	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	260780652
19	NC_013359	ATT	4	58313	58324	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_013359	TAA	4	59024	59035	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_013359	TAT	4	59452	59463	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	260780641
22	NC_013359	ATT	4	68208	68218	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	260780699
23	NC_013359	AAT	4	69660	69670	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	260780639
24	NC_013359	TAT	4	72423	72433	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	260780650
25	NC_013359	TCT	4	72807	72817	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	260780647
26	NC_013359	CTT	4	74597	74608	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	260780660
27	NC_013359	TCA	4	81323	81334	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	260780693
28	NC_013359	AAT	4	81947	81957	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_013359	ATT	4	83782	83794	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	260780648
30	NC_013359	TTA	4	84181	84191	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
31	NC_013359	TGA	4	86757	86767	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
32	NC_013359	ATT	4	87483	87493	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_013359	CTT	4	89002	89012	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
34	NC_013359	ATT	4	92052	92064	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
35	NC_013359	ATT	4	92604	92615	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
36	NC_013359	ATA	4	97976	97987	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013359	TAA	4	98408	98419	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_013359	TAA	4	98955	98965	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
39	NC_013359	TCA	4	102218	102229	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
40	NC_013359	TGT	4	106639	106650	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
41	NC_013359	GCT	5	108639	108653	15	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
42	NC_013359	TCT	4	109578	109589	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
43	NC_013359	CAA	4	112066	112076	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
44	NC_013359	TGT	4	112509	112520	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
45	NC_013359	AAT	4	116978	116990	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
46	NC_013359	ATA	4	124438	124448	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	260780689
47	NC_013359	TAA	4	125862	125873	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	260780689
48	NC_013359	AGA	4	128286	128297	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
49	NC_013359	ATA	4	152481	152492	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Bryopsis hypnoides chloroplast