ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Bryopsis hypnoides chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_013359	TATT	3	1724	1735	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_013359	TGTT	3	2737	2748	12	0 %	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013359	TAAA	3	3910	3920	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	260780690
4	NC_013359	TA	6	3981	3991	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	260780690
5	NC_013359	TGT	4	4585	4595	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	260780684
6	NC_013359	CTAT	3	5144	5154	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
7	NC_013359	A	13	5387	5399	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
8	NC_013359	GAAATT	3	5561	5579	19	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	10 %	260780649
9	NC_013359	ATA	4	5630	5642	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	260780649
10	NC_013359	TTAA	3	5699	5709	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_013359	ATA	4	7804	7815	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_013359	TCA	4	8263	8274	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
13	NC_013359	T	15	8535	8549	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
14	NC_013359	AAAT	3	8553	8563	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_013359	CTT	4	9637	9648	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	260780678
16	NC_013359	CGA	4	10044	10054	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	260780678
17	NC_013359	CAATAA	3	12153	12171	19	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
18	NC_013359	TTG	4	12229	12240	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_013359	CA	6	12928	12938	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
20	NC_013359	ATAA	3	13463	13475	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
21	NC_013359	TA	6	17505	17515	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_013359	TAAA	3	17648	17658	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_013359	TTTTAT	3	17921	17939	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
24	NC_013359	ATAA	3	17989	17999	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_013359	GTT	4	19306	19316	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_013359	ATTT	3	19946	19956	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_013359	TA	6	21047	21058	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
28	NC_013359	CTCC	3	26657	26667	11	0 %	25 %	0 %	75 %	9 %	260780658
29	NC_013359	CTTTTT	3	27136	27154	19	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	10 %	260780658
30	NC_013359	AAGA	3	27315	27326	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	260780658
31	NC_013359	TCA	4	27542	27554	13	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	260780658
32	NC_013359	ATTT	3	28718	28729	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
33	NC_013359	TTTTTC	3	28943	28960	18	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
34	NC_013359	T	18	30096	30113	18	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013359	TCT	4	30666	30677	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	260780663
36	NC_013359	ATA	5	31281	31295	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	260780675
37	NC_013359	TA	6	31664	31675	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	260780675
38	NC_013359	TAGT	3	31787	31799	13	25 %	50 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
39	NC_013359	AAAATA	3	32091	32108	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	260780672
40	NC_013359	ATTT	3	32550	32561	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	260780680
41	NC_013359	TTA	4	33401	33411	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
42	NC_013359	AAC	4	33763	33773	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	260780674
43	NC_013359	TAT	4	33936	33948	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
44	NC_013359	AATT	3	34092	34103	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
45	NC_013359	CTTT	3	35285	35296	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
46	NC_013359	ATTT	3	35948	35958	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
47	NC_013359	TA	6	36810	36821	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
48	NC_013359	TAAA	3	37011	37022	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
49	NC_013359	T	15	38507	38521	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	260780686
50	NC_013359	AAAT	3	38561	38571	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	260780686
51	NC_013359	TTGA	3	38572	38582	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	260780686
52	NC_013359	TTTC	3	39150	39161	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	260780686
53	NC_013359	ATTTTT	3	40235	40253	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
54	NC_013359	GAAT	3	40561	40572	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	260780679
55	NC_013359	AAAAT	3	41281	41294	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	260780668
56	NC_013359	ATTTT	3	41578	41591	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	260780668
57	NC_013359	TTCT	3	42792	42802	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	260780676
58	NC_013359	ATTTT	3	42909	42923	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	260780676
59	NC_013359	T	14	43511	43524	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	260780685
60	NC_013359	TTTG	3	45517	45528	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	260780701
61	NC_013359	ATTTTT	3	45812	45829	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	260780701
62	NC_013359	TA	8	45991	46005	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
63	NC_013359	TTTAT	3	46016	46029	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
64	NC_013359	AT	6	46071	46081	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
65	NC_013359	CATA	3	46206	46217	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
66	NC_013359	TTGA	3	46452	46463	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	260780653
67	NC_013359	T	14	47421	47434	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
68	NC_013359	ATAA	3	48954	48965	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
69	NC_013359	TA	6	48967	48980	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
70	NC_013359	TAT	4	49055	49065	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
71	NC_013359	AAGA	3	53205	53216	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	260780634
72	NC_013359	AT	6	53323	53333	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	260780634
73	NC_013359	AAAT	3	54730	54741	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	260780634
74	NC_013359	TCCA	3	55355	55366	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	260780634
75	NC_013359	ACA	4	57119	57131	13	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	7 %	260780635
76	NC_013359	TTC	4	57824	57835	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	260780652
77	NC_013359	TAG	4	57872	57883	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	260780652
78	NC_013359	TA	6	58084	58095	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
79	NC_013359	ATT	4	58313	58324	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
80	NC_013359	TTTA	3	58930	58940	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
81	NC_013359	TAA	4	59024	59035	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
82	NC_013359	TTGG	3	59320	59330	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	260780641
83	NC_013359	TAT	4	59452	59463	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	260780641
84	NC_013359	TCTTT	3	60619	60633	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	260780640
85	NC_013359	TTAAA	3	61321	61334	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	260780640
86	NC_013359	TTAGA	3	61606	61620	15	40 %	40 %	20 %	0 %	6 %	260780640
87	NC_013359	AATA	3	61733	61743	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
88	NC_013359	TAATT	3	62684	62697	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
89	NC_013359	TTAT	3	63183	63193	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
90	NC_013359	T	23	63376	63398	23	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
91	NC_013359	AAAT	3	66194	66205	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
92	NC_013359	TTTA	3	66227	66238	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
93	NC_013359	T	14	66239	66252	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
94	NC_013359	CTTT	3	66496	66506	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
95	NC_013359	GTTA	3	67108	67119	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	260780694
96	NC_013359	TTTA	3	67159	67170	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	260780694
97	NC_013359	ATT	4	68208	68218	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	260780699
98	NC_013359	TAAA	3	68423	68434	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
99	NC_013359	GTAT	3	68636	68647	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	260780639
100	NC_013359	TATT	3	68880	68891	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	260780639
101	NC_013359	ATTT	3	69424	69435	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	260780639
102	NC_013359	A	12	69551	69562	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	260780639
103	NC_013359	AAT	4	69660	69670	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	260780639
104	NC_013359	TAT	4	72423	72433	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	260780650
105	NC_013359	TCT	4	72807	72817	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	260780647
106	NC_013359	AATTT	3	72931	72945	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
107	NC_013359	AATT	3	73857	73868	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	260780696
108	NC_013359	AAAT	3	73973	73985	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	260780696
109	NC_013359	T	12	74211	74222	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	260780696
110	NC_013359	CTT	4	74597	74608	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	260780660
111	NC_013359	ATAA	4	76164	76179	16	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	260780659
112	NC_013359	AATAA	3	76443	76457	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	260780683
113	NC_013359	AAAAT	3	76828	76842	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
114	NC_013359	TA	6	77657	77667	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	260780655
115	NC_013359	AATA	3	78935	78945	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	260780677
116	NC_013359	GAAG	3	79890	79900	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	260780695
117	NC_013359	TTAA	3	80095	80105	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	260780695
118	NC_013359	TTAA	3	80129	80139	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
119	NC_013359	TCA	4	81323	81334	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	260780693
120	NC_013359	AAT	4	81947	81957	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
121	NC_013359	TAAA	3	82015	82025	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
122	NC_013359	AAATTA	3	82062	82080	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	260780700
123	NC_013359	TTAATT	3	82499	82516	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	260780700
124	NC_013359	TA	6	82617	82627	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	260780700
125	NC_013359	ATT	4	83782	83794	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	260780648
126	NC_013359	TAAA	3	83944	83954	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
127	NC_013359	TTA	4	84181	84191	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
128	NC_013359	A	24	84256	84279	24	100 %	0 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding
129	NC_013359	AAAT	3	85664	85674	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
130	NC_013359	TGA	4	86757	86767	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
131	NC_013359	AACT	3	87261	87271	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
132	NC_013359	ATT	4	87483	87493	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
133	NC_013359	AAAT	3	88259	88270	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
134	NC_013359	TTTC	3	88469	88479	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
135	NC_013359	AAAG	3	88485	88495	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
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