ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Diatraea saccharalis mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_013274	TTTA	3	127	137	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_013274	TAA	4	492	503	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	260150958
3	NC_013274	TTTA	3	895	906	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	260150958
4	NC_013274	TA	6	941	952	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	260150958
5	NC_013274	ATT	4	1037	1049	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	260150958
6	NC_013274	GAAA	3	2265	2276	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	260150959
7	NC_013274	ATCA	3	2899	2909	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	260150959
8	NC_013274	ATT	4	2918	2928	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	260150959
9	NC_013274	TTTAC	3	3331	3344	14	20 %	60 %	0 %	20 %	7 %	260150960
10	NC_013274	TAAA	3	3460	3471	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	260150960
11	NC_013274	ATT	4	3885	3896	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_013274	T	17	3947	3963	17	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	260150961
13	NC_013274	ATA	4	4015	4025	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	260150961
14	NC_013274	ATT	4	4150	4162	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	260150962
15	NC_013274	ATT	4	4655	4665	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	260150962
16	NC_013274	TTTAA	4	5585	5604	20	40 %	60 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
17	NC_013274	AATT	3	5835	5845	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	260150964
18	NC_013274	AT	28	5962	6014	53	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_013274	TAATT	3	6053	6067	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
20	NC_013274	AAT	4	6091	6101	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_013274	TAA	4	6319	6330	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_013274	T	12	6332	6343	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_013274	AT	18	6411	6445	35	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	260150965
24	NC_013274	ATT	4	6509	6521	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	260150965
25	NC_013274	TTA	5	6880	6894	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	260150965
26	NC_013274	A	18	7032	7049	18	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	260150965
27	NC_013274	AT	6	7140	7151	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	260150965
28	NC_013274	TTA	4	7318	7329	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	260150965
29	NC_013274	ATA	4	7423	7434	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	260150965
30	NC_013274	AAT	5	7607	7621	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	260150965
31	NC_013274	TAA	4	7861	7873	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	260150965
32	NC_013274	ATA	5	7891	7905	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	260150965
33	NC_013274	A	13	8105	8117	13	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	260150965
34	NC_013274	AAATAA	3	8129	8146	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	260150965
35	NC_013274	TAA	4	8305	8319	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	260150966
36	NC_013274	ATTA	3	8432	8444	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	260150966
37	NC_013274	TAT	5	8566	8580	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	260150966
38	NC_013274	ATAA	3	8979	8990	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	260150966
39	NC_013274	TAA	4	9204	9216	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	260150966
40	NC_013274	AAAAT	3	9240	9253	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	260150966
41	NC_013274	TATAA	3	9280	9293	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	260150966
42	NC_013274	ATT	4	9560	9571	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	260150966
43	NC_013274	AT	6	9713	9725	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	260150967
44	NC_013274	AAT	7	9851	9870	20	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	260150967
45	NC_013274	TTAT	3	10218	10229	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	260150968
46	NC_013274	ATT	4	10280	10291	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	260150968
47	NC_013274	TTTA	3	10400	10410	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	260150968
48	NC_013274	ATA	5	10470	10484	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	260150968
49	NC_013274	GTT	4	10503	10514	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	260150968
50	NC_013274	AT	15	10592	10622	31	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
51	NC_013274	T	13	10927	10939	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	260150969
52	NC_013274	TAT	4	11021	11032	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	260150969
53	NC_013274	AAAT	3	12278	12288	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	260150970
54	NC_013274	AAT	4	12418	12430	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	260150970
55	NC_013274	TAAAA	3	12489	12502	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	260150970
56	NC_013274	AAT	7	12587	12607	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	260150970
57	NC_013274	AT	6	12817	12827	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	260150970
58	NC_013274	TA	7	12832	12844	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
59	NC_013274	T	12	13323	13334	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
60	NC_013274	AATT	3	13354	13365	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
61	NC_013274	TTAA	3	13575	13585	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
62	NC_013274	TA	18	13678	13710	33	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
63	NC_013274	AAATT	3	13762	13776	15	60 %	40 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013274	ATTA	8	13928	13959	32	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
65	NC_013274	AATTA	3	14166	14181	16	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
66	NC_013274	AATTT	3	14902	14915	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
67	NC_013274	ATTT	3	15148	15159	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
68	NC_013274	T	17	15182	15198	17	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
69	NC_013274	TC	6	15237	15248	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
70	NC_013274	ATTAAA	3	15260	15278	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
71	NC_013274	TTAA	3	15351	15362	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013274	TAAT	3	15371	15382	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013274	TA	6	15387	15397	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
74	NC_013274	ATTAAT	3	15394	15412	19	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
75	NC_013274	TA	15	15430	15457	28	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Diatraea saccharalis mitochondrion